小中大你可以用PCR产物测序鉴定一下1000kb那条带,可能就是你的目的条带。因为有时电泳跑时会出现误差。再有就是检查你的引物质量如何。
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测序太费钱了,送公司测序又费时。要是的话还好说,要不是就走了冤枉路了。
建议在中间找一个酶切位点,若切成预期的片断就可能是;否则就不要在这个片断上浪费精力了。