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用MS-MS对多肽的从头测序 不是 用MS测定蛋白质的酶解片段从数据库中鉴定出已知的蛋白质!两者是不同的过程!请见:魏开华、应天翼 等 编著,蛋白质组学实验技术精编,化工出版社,2010,101-105,里面对两种质谱操作说的很清楚,另外还有不少英文版的MS指导书具体说明了用MS-MS对多肽的从头测序 和 用MS测定蛋白质的酶解片段从数据库中鉴定出已知的蛋白质这两种截然不同的操作。
另外也可以用Ladder Sequencing 方法(阶梯法)对蛋白质进行从头测序,这就是将MS与Edman降解法两者结合,Edman降解从N末端每次降解下来一个氨基酸,形成PTH-AA,然后此PTH-AA不用HPLC通过分子量鉴定,而是通过MS鉴定出其分子量,进而通过MS获得Edman降解从N末端每次降解下来一个氨基酸的身份,周而复始获得此蛋白质的全序列。