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标题:请教:RNA电泳

逍遥燕子[使用道具]
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1
 

请教:RNA电泳

请教:RNA电泳 [转载]


请教:RNA电泳时,是不是一定要加marker,不加行吗?
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=菓子=[使用道具]
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不用MARKER,你怎么知道条带是不是目的片段呢?
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白鸟之翼[使用道具]
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总RNA 电泳吗?
不需要吧!
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wiwi[使用道具]
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一般应该都是总RNA电泳,这种情况不需要加Maker,电泳结果应该是三条带。  
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韩梅梅[使用道具]
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一般RNA电泳可以看到主要的两条带28S,18S和5S,对于哺乳动物RNA,28S分子量大约为4.6~5.3kb,18S分子量大约是1.8~2.0kb,另外在18S前还可以看到5S。如果RNA质量好,28S和18S的比例大约是2:1,如果RNA降解,则除了条带不清楚,可以看到EB主要显示位于18S前。至于MARKER,如果你有,那可以加,但是不必强求,因为基本两个条带大小是固定的,而期间的mRNA是看不清的。  
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逍遥燕子[使用道具]
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谢谢楼上各位,特别是古越龙山兄,拜读了你许多帖子,发现你解答是非常详细,再次感谢!
我是指TRNA电泳的,侧比值还是不错,一般在1.85~2.0左右,但是刚刚做试验,还是不放心,所以想跑电泳。
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麻瓜[使用道具]
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可否把你的提取方案借小弟我看一下,我得方案提取结果比值不好,一般在1.4左右,我想是不是方案问题!非常感谢。
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caihong[使用道具]
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8
 
你好。请把你的提取方法也给我看一下。我用TRIZOL提的。但比值不好。只有调PH值到8.0以后才到1.8以上。谢谢
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蒲公英[使用道具]
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invitrogen 关于Trizol的说明书上有介绍,当使用含低盐溶液如DEPC水溶解RNA时,比值会小于1.6。
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逍遥燕子[使用道具]
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10
 
我用的是“上海华舜”的试剂盒(关键是开始做的时候,想找个便宜的练练手)。他们的TRNA的试剂盒有多种,我的体会是最好不要选用吸附柱的那种,因为没法看到沉淀的RNA,反正我是做了一个多礼拜都没成功,后来换了他们的TRNA抽提盒Ⅳ,一天后搞定。(好像有做广告的嫌疑哦,就此打住)
下面说说的我的步骤。
1  TRIZOL 1000ul分装在2个1.5ml的离心管中。(TRIZOL和组织的比例因不同的组织而不同,我的是肝脏,一般是50mg:1ml,我用的是一种类似于小棒槌的捣碎棒,开始没经验,一开始就把1000ul的TRIZOL放在一个管中,这样肝组织容易漂起来,不好捣碎,后来把TRIZOL 分开装,组织就很好捣碎,迅速捣碎组织后,在加上另一管中的500ul的TRIZOL,继续匀浆。置于冰上,继续下一个标本。所有标本都匀浆后同时进入下一个步骤。(开始的时候不知道50mg是多少,每次都是傻傻的去秤,后来熟练了也就省调这一步了。所以大家可以在做之前,找相同的组织,秤秤看你要的重量大概是多少,多秤几次,有了概念后,到了做时,就不需要秤组织了,这对于防止RNA降解非常有好处)
2  置5min后加入氯仿200ul,颠倒混匀。杂质含量多的组织,可先高速(10000-12000g\min,4℃,下同)离心5min后取上清液,在加氯仿,但会少量减少TRNA的得率。
3  静置10min后高速离心10min。
4  小心的吸取上层液,不要碰到中间白色的层和最下层的氯仿(否则,影响TRNA的纯度,如果碰到,则重新离心)
5  加入取得的上层液一半的异丙醇(体积),混匀。在加入异丙醇相同体积的RNA沉淀液。(有些含粘蛋白多的组织如肝脏需要加入这种RNA沉淀液,至于这是什么东西,我也问了他们公司,竟然说是商业秘密,晕,不过后来我嫌麻烦,只是加异丙醇,也是很好,哈哈)。
6 5min后 高速离心5min,弃去上清液,这时候在管底应该可以看到少量白色的TRNA.(如果对产量要求不高,这一步最好是7500g\min,可以明显提高纯度。)
7  75%的乙醇500ul洗涤(务必使管底的少量白色物漂起),7500g离心5min,弃去上清液
8  重复7
9  干燥10——15min(不一定非得等乙醇全部挥发),加水10-30ul
10  2ulTRNA溶于300-500ulDEPC-H2O中,测OD比值,2ulTRNA 电泳。
11  TRANA最好不要保存时间过长。我现在是当天用,当天提。
12  手套、口罩、台布开始的时候应该是必须的,等熟练了则可以不要。操作都要在冰上进行。
13  枪和枪头应该是RNA 专用的。
14  所用的东西要用DEPC 水处理。
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