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标题:【求助】如果有很多不同DNA小片段的混合物

qinqinai[使用道具]
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发表于 2015-10-25 11:23 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】如果有很多不同DNA小片段的混合物

如果有很多不同DNA小片段的混合物，大概500-1000bp之间，而且都是未知的，也就不能像一般基因测序一样提供引物。请问这种情况能否用高通量测序仪测出这些DNA片段的序列。
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青青草[使用道具]
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发表于 2015-10-25 11:23 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

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是否可以对这些混合的DNA片段一起末端加A，然后连接T载，再用T载的通用引物进行高通量测序是否可行呢？
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哈密瓜[使用道具]
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发表于 2015-10-25 11:24 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

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你DNA片段大约多少？几千？还是几百万？
测了对你帮助大不大？预算多少？
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发表于 2015-10-25 11:24 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

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可以测啊  问题是你测序了是干什么用的？   500-1000肯定要打断的  现在的高通量测不了这么长的片段
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发表于 2015-10-25 11:25 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

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大概有几百个片段，每个片段大概在500-1000bp之间。帮助会有，预算不是很大的问题，实验室买了Illumina MiSeq高通量测序仪。
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小熊妮妮[使用道具]
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发表于 2015-10-25 11:25 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

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500-1000还用打断么？据我所知测基因组的时候，现在都倾向用5Kb的片段构建文库了
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发表于 2015-10-25 11:26 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

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不好意思，我是新手，刚刚看到您说的是对的，我混淆了概念，呵呵
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yuanyuan[使用道具]
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发表于 2015-10-25 11:27 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

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打断，加接头，切胶，测序
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发表于 2015-10-25 11:27 资料  个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

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5k不算大！200k的我都见过！
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发表于 2015-10-25 11:28 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

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454可以
solex需要打断
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