小中大一般我们把和负链结合但是序列和正链一直的引物叫上游引物:Upper Primer
而和正链结合,序列却和正链反向互补的引物叫下游引物:Lower Primer
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想请教一下 ,正链和负链是如何定义的,比如说吧,一条DNA双链,一条叫模板链,它是转录的模板,又叫无义链,因为它与mRNA互补,那么它应该与cDNA是同义的;另一条链叫编码链,又叫有义链,它与mRNA除了T与U的区别外,其它一致。那么,不知道您所说的正链是否就是模板链?与cDNA同义的就是正链吗?
我画了一个PCR上下游引物的示意图,这与分子克隆上的说法是一致的。
分子克隆(第二版)683页:
”上游“寡核苷酸引物(即与初始mRNA互补的引物)
”下游“寡核苷酸引物(即与cDNA第一链互补的引物)