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标题:请教：关于内含子和外显子

生物迷[使用道具]
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发表于 2011-9-24 10:43 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

请教：关于内含子和外显子

请教：关于内含子和外显子 [转载]


已知cDNA 的序列，准备设计引物，但对内含子和外显子不了解，请教有关内容，谢谢！  
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绿茶公子[使用道具]
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发表于 2011-9-24 10:43 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
你设计引物的目的是什么？
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长发piaopiao[使用道具]
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发表于 2011-9-24 10:44 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
cdna是RNA转录的单链DNA，不存在内含子的问题。如果你想做RT-PCR可以不考虑内含子。
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发表于 2011-9-24 10:45 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
Exon : sequence of a gene’s DNA that transcribes into protein structures It is just interspersed with Introns.

Intron : sequence of a eukaryotic gene’s DNA that is not translated into a protein.

Now, you can see the main difference between exon and introns .  
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发表于 2011-9-24 10:45 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
Exon : sequence of a gene’s DNA that transcribes into protein structures It is just interspersed with Introns.

Intron : sequence of a eukaryotic gene’s DNA that is not translated into a protein.

Now, you can see the main difference between exon and introns .  
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发表于 2011-9-24 10:45 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
内含子（intron）是断裂基因中外显子之间的间隔序列（intervening sequence，IVS），可参与前体RNA的转录，但其转录的RNA序列于转录后的加工中被切除，不包括于成熟的RNA分子中。外显子（exon）在断裂基因中，转录成熟RNA中相应序列的DNA片段。所以，我认为你可不必考虑内含子。  
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发表于 2011-9-24 10:51 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
同意以上各位战友的意见，但我认为还是要考虑内含子，为了避免以后在P的过程中不出现烦人的的DNA污染问题，应该在设计引物时，其中一条引物要跨越一个内含子，即包含两个外显子。
希望对你有帮助
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发表于 2011-9-24 10:51 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
如果要防止DNA污染，最好是再做RT之前先用DNA酶处理一下。  
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queen[使用道具]
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发表于 2011-9-24 10:51 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
在RNA转录过程中,间隔内含子的两个外显子互相靠近,内含子突出出来形成套索,然后被剪切掉了,这是一种比较流行的说法.但RNA的剪切方式可能不止一种,有的内含子并没有被切除,仍保留在RNA中,只不过在翻译到这一段序列时发生翻译绕过,而没有翻译出蛋白质.同意引物设计在两个外显子连接处,拙见如下:
1.减少了DNA污染的干扰而出现的杂带,泡出的带子很干净,发文章时好用.
2.如果内含子很小时,杂带的位置和目的条带相近,不容易区分.如果跨越内含子就不会有这个问题。
3.如果两条引物都跨内含子会影响引物评分，至少一条引物跨，以减少基因组DNA影响。
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生物迷[使用道具]
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发表于 2011-9-24 10:52 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
谢谢大家！
再次请教，在从genebank上查到的cDNA序列或者NDA序列后，怎样才能知道那些序列是内含子，那些有时外显子呢？希望得到大家的继续帮助

再次感谢、！
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