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标题:甲基化特异性PCR方面,欢迎交流讨论!

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甲基化特异性PCR方面,欢迎交流讨论!

甲基化特异性PCR方面,欢迎交流讨论! [转载]


我有外周血DNA,想扩增雌激素受体启动子区,该依据什么设计引物?雌激素受体启动子区的序列我该怎么找?老板马上要我开题,急啊!!!望各位大侠多多指教!!!
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猫屎一号[使用道具]
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首先找到基因的英文原名,然后到NCBI的locus link去找序列,再找到promoter区,然后设计引物。

看看这个贴吧。

cuturl('http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=67&id=720311&sty=1&tpg=1&age=0')  
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多谢,正在查阅!好像看到的只是mRNA的序列,我怎么确定其启动子区的序列?望指教!  
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韩梅梅[使用道具]
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做课题之前文献一定尽量找全,除非你做的是很偏很偏的题目,否则肯定有人做过相关课题,尤其是国外的文献报道要多找点,对你的研究会很有帮助。到pubmed去找,找到文献就去图书馆查,查不到就到我们的检索区求救。

你可以查一下文献,看看有人报道过没有。如果没有可以用一些预测promoter区的站点,预测一下。promoter都有一定的规律,具体内容我不记得了。这是一个Drosophila genomic预测promoter的站点,做为一个例子:

[iframe]http://www.fruitfly.org/seq_tools/nnppHelp.html[/iframe]
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非常感谢韩梅梅对我的热心帮助!我因为要做MSP,即甲基化特异性PCR,文献上有做别的基因的,但是做雌激素受体的没有看到,MSP技术方面的资料查了不少,但是确定不了模板序列就设计不了引物,所以很头痛。
不知道预测启动子区的可靠性有多大,毕竟我最后可能要涉及到测序的问题,要是不准确,到时候就麻烦了。
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可靠性很难说,预测的的总不如实验证明的好,你查雌性激素受体的文献,看看有没有promoter的报道。
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再请教,启动子预测是把mRNA序列输进去吗?
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韩梅梅[使用道具]
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这个网好象要DNA序列,你仔细读读,学习一下。  
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您好,我在雌激素受体的NM号码前的下拉菜单里面看到了一个GRAFICS,然后就可以找到启动子区了,不过引物设计还在进行中,先谢过你的提醒和帮助了!
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您好,我在雌激素受体的NM号码前的下拉菜单里面看到了一个GRAFICS,然后就可以找到启动子区了,不过引物设计还在进行中,先谢过你的提醒和帮助了!
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