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标题:请问大鼠IL-8的基因组序列

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发表于 2011-9-24 14:01 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

请问大鼠IL-8的基因组序列

请问大鼠IL-8的基因组序列 [转载]


我想找大鼠IL-8的基因组序列,用来设计RT-PCR的引物,但在NIH的GENEBANK中找不到大鼠IL-8的mRNA的序列，请问还有什么其它的途径可以找到，谢谢！
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发表于 2011-9-24 14:01 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
怎么会没有呢？
NCBI Reference Sequences (RefSeq)

mRNA Sequence NM_000584
Source Sequence M26383,Y00787
Product NP_000575 interleukin 8 precursor
Domains
cd00273: Small secreted cytokine (intecrine/chemokine) domain subgroup CXC score:238

Related Sequences
Nucleotide Protein
Genomic AF385628 AAK60276
Genomic D14283 BAA03245
Genomic M23344 AAA74722
Genomic M28130 AAA59158
mRNA AJ227913 None
mRNA AK131067 None
mRNA BC013615 AAH13615
mRNA M17017 AAA35611
mRNA M26383 AAA36323
mRNA Y00787 CAA68742
mRNA Z11686 CAA77745
None P10145
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发表于 2011-9-24 14:02 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
一步一步教你吧，其实和你同样的求助在本版有很多了，仔细找找就能学到。
首先，在下面的网页中，输入IL-8，点击“find”，注意不是点击“find in this view”！！
[iframe]http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/maps.cgi?CHR=X&MAPS=ideogr%5BXpter%3AXqter%5D%2Ccntg%5B1.000000%3A152634180.000000%5D%2CugHs%5B1.000000%3A152634180.000000%5D%2Cgenes%5B1.000000%3A152634180.000000%5D&BEG=36503900&END=37503900[/iframe]

然后就看到： 4 IL-8 IL8 Gene Genes_cyto | Genes_seq
点击“ IL-8”，这时候就看到 IL-8的基因图了；
然后再点击 “IL-8”，在偏下方就可以看到mRNA Sequence NM_000584 ！
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发表于 2011-9-24 14:02 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
果冻也算 兄给出的是人的序列把。我用LocusLink查询的结果为：
cuturl('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=Nucleotide&dopt=GenBank&val=NM_030845')
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发表于 2011-9-24 14:03 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
没错，我要的是大鼠的序列，庄梦蝶  请问你查的主题词是什么，为什么我用IL-8查不到呢？你是不是用其他别名查的。谢谢！！
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发表于 2011-9-24 14:03 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
没错，我要的是大鼠的序列，庄梦蝶  请问你查的主题词是什么，为什么我用IL-8查不到呢？你是不是用其他别名查的。谢谢！！
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 小中大
不对，庄梦蝶是否用CINC-1这个主题词查的，CINC-1全称是cytokine-induced neutrophil chemoattractant 1，它并不是IL-8.
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发表于 2011-9-24 14:04 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
1 首先，我用Rat interleukin 8 或者 Rat IL-8 （Rattus norvegicus）搜索Nucleotide ，无果！


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 小中大
2 Locuslink:结果如前，似乎也不象！


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 小中大
最后选用Map Viewer： No matches found
请supergene 等高人指点一二！


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