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标题:【求助】各款荧光定量PCR仪的性能比较

junjie05[使用道具]
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【求助】各款荧光定量PCR仪的性能比较


本人从事荧光定量PCR检测试剂的开发工作,用过市场上主流的多款荧光定量PCR仪,如ABI5700,ABI7700,ABI7000,ABI7300,ABI7500,MJ opticon,MJ opticon2,bio-rad ICycler,LightCycler1.5,roter-gene3000,line-gene等等。这种仪器各有各的特点,但都存在不足之处。总的来说,ABI公司的荧光定量PCR仪产品比较多,成系列,但目前而言ABI5700和ABI7700不能实时在线地检测荧光,因而已经退出历史舞台,尤其是ABI7700,不但很贵,而且采用苹果机电脑,使用很不方便。ABI7000目前也已经淘汰,我用的这台仪器老出问题,曲线极不光滑,但同样的体系在国内机line-gene上曲线非常好,在ABI7500上曲线也很光滑,所以,本人估计是ABI7000设计上有不足之处。现在市场上的ABI7300就是ABI7000的简单升级版,硬件设计上几乎没有改变,只是换过几个性能更好的配件,软件有所升级。不过我个人认为ABI7300和7500的软件有美化曲线之嫌,因为我有一次在ABI7000上做的很不好的文件,在ABI7500上打开时,曲线竟然变光滑了,而在者之前,在ABI7000上曲线很曲析不平的。另外我个人感觉ABI7900(ABI公司第二代产品)有些华而不实,价格应该是所有荧光定量PCR仪中最贵的,但性能指标还不如ABI7500(ABI公司第三代产品),硬件设计上也不如ABI7500合理。总的来说,ABI公司在荧光定量领域上还是做出很多贡献的,其仪器在科研上还是可以用的,但由于硬件设计上的缺陷,需要额外的ROX染料进行校正,并且占用了一个检测通道。国内的试剂厂商都不加ROX染料,科研用户一般也不使用,所以其检测的准确性和重复性还是很难保证的,尤其浓度较低的模板进行检测时效果不佳,偏差会很大。
罗氏的LightCycler以运行速度快而著称,在国内市场占有率最高,但本人最初使用时老出问题,有时候阳性曲线做不出来,后来发现这跟其独特的毛细管设计有关系,因为毛细管很细,所以反应液在毛细管中的交换对流非常不畅,反应液在低温是蛋白会以结晶状态析出,没有充分混匀时就加入毛细管会影响反应的进行,热启动酶不会受影响。所以本人在操作时都特意将反应液混合充分后再加入毛细管,这样实验就比较正常了。本人开始使用罗氏的仪器时最怕毛细管断裂,操作时特别担心,熟悉以后,规范使用随机赠送的操作配件,毛细管也就没断过。而且最重要的是,罗氏的仪器稳定性非常好,灵敏度明显比其它仪器高,这也许跟毛细管和其检测元件有关系,检测重复性也非常好,所得定量结果可信度高。本人所使用的罗氏LightCycler1.5三四年了也没出现硬件的故障。罗氏公司推出的LightCycler2.0在原有基础上检测通道增加到六个,软件功能也更加丰富。据说最新推出的LightCycler480是目前全球最先进的荧光定量PCR仪,突破了传统技术的瓶颈,推出了不具边缘效应的高通量荧光定量PCR仪。具体没有用过,听说使用非常灵活。
MJ的仪器总体上而言比较稳定,但检测灵敏度不高,功能单一,检测通道不多,运行时间太长。
伯乐的ICycler仪器也许是设计上的缺陷还是什么原因,同样的反应体系,在该仪器上进行实验时,阳性样本的扩增曲线荧光增量比较低,检测效果不好,所以在全国很少用户使用该仪器。
Line-gene仪器的使用比较方便,但返修率较高,不过厂家就在国内,售后服务非常及时。
roter-gene3000跟罗氏公司的LightCycler有很多相似之处,只是roter-gene在操作时比较麻烦,而且采用普遍反应管,光透性不好,影响了检测结果,这可以从其原始曲线上看出来,但该仪器的软件所表现的是对数曲线,把其原始曲线上的曲析不平掩盖了,其灵敏度不高。
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hyuu[使用道具]
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我知道你就是那个罗氏的托。别的不说,我就知道所谓ROX是用来校正实验中的加样误差而不是什么ABI的硬件设计缺陷的。我们这里有好几个厂家的定量,ABI的7500是我们所有人公认数据最好的,每天排队用7500的也最多。
而且,现在很多试剂厂家都是有两种版本,加ROX的和不加ROX的。前者稍贵些,后者是以前出的,因为现在用ROX的人越来越多,而且也不是说只有ABI才能用ROX。除了罗氏外,各个品牌的定量PCR都能用ROX.罗氏的那个480听说都推出快两年了,也没听说什么用户,据说就是模仿ABI的7500
的。
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yayya[使用道具]
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我用的是stratagene的mx3000p,不知道评价怎么样呢?
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hyuu[使用道具]
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我再跟楼上那个罗氏的托说一声,罗氏的定量根本也不是占有率第一,占第一的是ABI,而且罗氏的市场份额现在已经跌到伯乐和MJ之后了。为什么呢?其实伯乐和MJ的仪器质量口碑并不如罗氏好,但就是你那个罗氏公司心太黑,总搞封闭的试剂耗材体系。毛细管也要向你们买,什么六色的荧光,请你报个价,在国内根本找不到地方合成,因为多数是不开放的冷门荧光。我们搞科研的人为什么要买你们那种最贵的试剂?
我不是要去挺哪个厂家,但我就看不惯你们这种厂家的托为了利润,净误导那些还没买又不太懂得仪器细节的客户!
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ujne[使用道具]
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但由于硬件设计上的缺陷,需要额外的ROX染料进行校正,并且占用了一个检测通道

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本人亲自向ABI公司技术人员咨询后,此话不可信.
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vera+[使用道具]
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真是搞笑,竟然说我是Roche的托,你有什么证据,就因为我转了一篇这样的文章?那你怎么不说发表这篇文章的人啊,神经病!
另外,关于ROX的问题,大家可以在站内搜索一下,确实有这方面的说法,我也是看的人家的报道才说的。
这是我在站内查到的:
“ROX的作用ABI宣称是用来校准加样误差的。但是据说ROX的作用实际上是用来校准光程差的。即每个孔的荧光信号经过滤光片在经过聚焦到CCD的时候,走过的光程是不一样的,这样在CCD上成像的亮度就不一样了。所以需要把这个差异用ROX来计算孔间差异有多大,然后差异系数去处理,实际的荧光信号。”
具体是不是这么回事,我也不清楚,但是大家可以看看下面这张图片


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summerxx[使用道具]
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楼上是对的!!!
做过加ROX和不加ROX的重复性实验,不加ROX的荧光值发散严重,加了ROX就成束了。
鄙视ABI,资料里避重就轻,浪费了我很多时间。再鄙视一个山__山
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iii_ii[使用道具]
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ABI7300和7500采用的激发光源是卤钨灯,所以存在光程差需要用ROX进行校正,而7700由于采用光纤,反而没有这个问题。其实ABI7700才是最稳定可靠的机器(全球最早的定量PCR仪),全部采用军工的技术,但它不能实时显示扩增曲线,只有在扩增结束后才能看到扩增结果,的确是不太方便。
LightCycler1.2用过,曲线很漂亮,一看就是处理过的(与实时曲线存在较大的差异)。而实际上,LightCycler1.2的F2和F3通道也用来校正系统误差,所以大家看到的Roche曲线平滑漂亮。
Stratagene是原来ABI的人出来开的公司,旗下的产品Mx3000与ABI不仅软件相似,硬件结果也雷同。
Bio-Rad收购的MJ之后,把MJ旗下的Opticon产品外观进行了包装(从原来MJ的黑蓝色系变为现在的Bio-Rad一贯的乳白色系),但产品换汤不换药,没用过,不好评价。
从临床应用上来说,现在医院用来做HBV、HCV检测的定量PCR仪主要还是Roche和ABI的。一般ABI用来检测样本量较大的项目,Roche仪器用来检测低通量的项目。医院用的最多的反而是ABI7300和LightCycler1.2。
个人倒是认为lhqss或者转贴的原作者是杭州博日的托儿,其实他一直在有意无意的推荐着Line-Gene。
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qhyu[使用道具]
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定量PCR其实就是PCR和荧光检测的集合,现在国内很多厂家在硬件上做得还不错的,与进口产品的主要差距是在软件上,比如数据的分析、应用等。
现在国内有钱的都买ABI和罗氏的,没钱的才会用国产的,不过在临床上LINE-GENE的数量还是很多的。得感谢国产的仪器,进口的产品的价格才会降得这么低,大家才能用上定量来写文章。
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caihong[使用道具]
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大家应该多多支持一下国产的仪器,其实在国产仪器中还是有很多质量特别好的东西,只是大家习惯了什么都是国外的东西好这种定性思维而已!
支持国产!
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