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标题:【求助】现在前沿文献知道一个新蛋白质

aaby[使用道具]
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发表于 2015-11-24 13:28 资料 个人空间 短消息  加为好友 QQ

 小中大

【求助】现在前沿文献知道一个新蛋白质

现在前沿文献知道一个新蛋白质，但还没报道该蛋白的基因序列，各位大侠有何高见能够获得该蛋白的基因序列？小弟我对该方面的了解比较缺乏，恳请各位大侠指点，如果有相关的文献，最好附上。感激不尽！
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wwwh[使用道具]
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发表于 2015-11-24 13:28 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

没搞明白，你是看文献发现有这么一种蛋白，然后想知道这个蛋白的表达基因呢，还是说你手上已经有这么一种蛋白，然后你想通过实验获得这种蛋白的基因编码序列？如果是后一种的话我到是有些经验。
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发表于 2015-11-24 13:29 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

我是后一种，我手头上有这么一种蛋白，还请你指导一下小弟我吧，谢谢大侠了
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发表于 2015-11-24 13:29 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

Edman降解测序，只测一小段就行了，估计有10个氨基酸足够了。之后NCBI的BLast查同源蛋白，就能查到该基因了。
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发表于 2015-11-24 13:30 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

那个是新，发现的蛋白，NCBI上可能没有
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malong[使用道具]
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发表于 2015-11-24 13:30 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

如果是新的蛋白的话，你可以送到公司做质谱分析，得到全序列
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发表于 2015-11-24 13:30 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

想请教一下，把数据库中没有的蛋白用质谱分析获得全序列的技术流程和相关思路是怎样的？本人也有相关的疑虑。谢谢！
PS：质谱分析肽质量指纹然后对比数据库中的蛋白，通过对比片段的相似性来找到数据库中与未知蛋白对应的蛋白，这是常用的方法。测定未知蛋白的序列和这个思路相似吗？谢谢！
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n111[使用道具]
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发表于 2015-11-24 13:31 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

想请教一下，把数据库中没有的蛋白用质谱分析获得全序列的技术流程和相关思路是怎样的？本人也有相关的疑虑。谢谢！
PS：质谱分析肽质量指纹然后对比数据库中的蛋白，通过对比片段的相似性来找到数据库中与未知蛋白对应的蛋白，这是常用的方法。测定未知蛋白的序列和这个思路相似吗？谢谢！
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大嘴猴[使用道具]
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发表于 2015-11-24 13:31 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

1纯化蛋白，然后进行氨基酸测序
2根据同源性设计简并引物，直接PCR
3基因文库
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malong[使用道具]
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发表于 2015-11-24 13:32 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

数据库里没有对应的蛋白的话，想获得序列只能通过酶解+edman测序？那酶解成小片段后测序如何还原成该蛋白的全序列呢？有相关软件吗？还原出来的全序列可信度高吗？还望赐教，谢谢！
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