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标题:【求助】植物蛋白双向点鉴定

qinqinai[使用道具]
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发表于 2015-12-19 13:27 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】植物蛋白双向点鉴定

如题，植物（比如，玉米、小麦）蛋白双向点鉴定后，公司给的分析报告应该怎样分析？
    包括报告怎么看，哪几部分的分析，运用什么软件，大致可以得到的结果，根据结果怎样做出预测或者推论，等等。（希望有具体点的，对待第一次鉴定出来的点儿们，忐忑的很）有什么tips之类的木有？
    先谢谢各位高手了，大家也可以交流下经验些些的。
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dadaai[使用道具]
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发表于 2015-12-19 13:28 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

不知道现在你弄懂了没有，每个公司给的结果都不一定一样。最好能提供点图什么的，光这么问，谁都无从下手
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yayayu[使用道具]
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发表于 2015-12-19 13:28 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

看了些别人的东西，觉得分析手法还是很多的。挑一个适合自己文章的就好了。十分感谢。
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发表于 2015-12-19 13:29 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

质谱分析结果中，peptide sequence那一行，括号是什么意思，哪一段才是多肽勒
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8899[使用道具]
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发表于 2015-12-19 13:30 资料  个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

你这是用什么型号做的呢？偏差这么大，好不好定结构哦？最好用超高分辨质谱做一下，把误差缩小了，再来比对搜索，才比较好吧？
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发表于 2015-12-19 13:30 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

诶，这个是文献中看到的一张结果图，用的MALDI-TOF跑的，就不太懂旁边括号的意思，因为我们需要肽段
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发表于 2015-12-19 13:30 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

是不是N端（氨基端）和C端（羧基端）？不好意思，不能肯定哦。
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rrra6[使用道具]
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发表于 2015-12-19 13:31 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

有可能哦，俺也不太懂，俺怀疑要么表示其两端
要么可能是不确定到底是哪个氨基酸，所以打了个括号
你认为哪种可能性比较大啊
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发表于 2015-12-19 13:31 资料  个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

K与L还是相差比较大的。因此，应该不是指不确定。C/N基也不需要两个都表示出来。可能是指下一个基团可能要连接的。一般是用小数点吧。
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xiaoxiaoai[使用道具]
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发表于 2015-12-19 13:31 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

括号里面应该指的是上一连接的氨基酸和下一连接的氨基酸。
这个蛋白应该是trypsin酶解完再去做MALDI的吧？不知道lz有没有注意到，前面一个括号里的氨基酸都是R和K，而后面一个括号里的氨基酸的前面一个氨基酸也都是R和K，就是trypsin的酶切位点。
frgmentaion里面对应的就是该断多肽在该蛋白上的位置，把这个排一排，还可以大概知道这个PMF的序列覆盖度。
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