小中大关于RNA溶液的纯度和浓度问题
关于RNA溶液的纯度和浓度问题 [转载]
把结果总结了一下,请大家分析分析
前天把冻存的RNA溶液拿出来又测纯度和浓度,结果如下
药物组
OD260 0.460 (前天刚提出来测为0。360)
OD280 0.259 ( 前天刚提出来测为0。208)
比值为 1.76 (比值为1。73)
浓度为 9。2 UG/UL (浓度为7。24 UG/UL)
什么原因造成这一组浓度差距这么大?看到有的战友说,试剂盒提RNA的量可在OD260的值在0。15--0。5,但没有提到稀释倍数,如果按稀释500倍的话,RNA溶液浓度可在3-10微克之间,我这个值还算正常。试剂盒提RNA测OD值时,稀释的倍数是不是500倍呢?
另外,两次测的值的差距有2UG/UL之多,我都是用同一批DEPC水调的零,单纯是机器误差,会差这么多吗?我应该以哪一次的测量值为标准进行定量开始逆转录呢 ? 有的战友说比值大于2,说明RNA降解了成单核苷酸了,但是我的可能也不属于这种情况吧?
阳性对照
OD260 0.239 (前天刚提出来测为0。229))
OD280 0.139 ( 前天刚提出来测为0。130))
比值 为 1。72 (比值为1。76)
浓度 为 4。7 UG/UL (浓度为4.58 UG/UL)
这一组好象还好,变化不大。
昨天用以上两组的RNA液(各加了1UL进行RT)逆转录后做了B-ACTIN的PCR,做了一个25UL体系,(两组上样量均为1UL,岂不是加的模板量不一样多?)做了一个50UL体系,(两组上样量均为2UL),做了一管PCR产物再PCR(因为上次B-ACTIN的PCR产物没有条带出现)
结果25UL体系B-ACTIN都跑出来了,亮度差不多;也没有杂带
50UL体系B-ACTIN也跑出来了,亮度比25UL亮很多,且出现两条非特异条带;
PCR产物再PCRB-ACTIN也跑出来了,亮度和25ul体系的一致,但是有一条杂带出现。
今天,又用以上两组的RNA液(各加了1UL进行RT)逆转录后做目的基因的PCR,
其它参数都没有变,只有退火温度变了,但是都没有特异条带出现。