小中大很多战友都是“过来人”了，在菜鸟时代也曾有过现在看起来非常低级的失误，也曾有很多疑惑希望有经验的老同志给以指导，将心比心吧，人家虚心问，老同志也稍微注意一下言辞虚心作答，要不然人家的虚心就变成心虚了，兴许人家一直在搞药学研究，偶尔需要做点基因表达的东西，基础自然会薄弱些。
以上纯属灌水，见谅。
以下说说楼主的问题，我也尽量说得简明易懂些，当然表述上可能就不是那么严密了。
楼主要先明白基因，mRNA，cDNA是啥关系。
基因转录得到了mRNA，mRNA逆转录得到了cDNA
你的目的基因在基因组中的拷贝数（很多基因在基因组中只有单独的一条，但也有多条相同基因共同存在于基因组的情况，这个1条或n条的数就是拷贝数了）是一定的，你加药不加药，这个拷贝数都不会变了，所以如果你直接提取基因组DNA，那么无论怎么做PCR，也不会有差异了。
但是cDNA与基因组DNA不同，我们提取mRNA，然后用逆转录酶把mRNA变成cDNA，这样cDNA和mRNA之间就存在着等比的关系，我们用实时定量PCR或者半定量PCR检测cDNA的多少，也就相当于检测mRNA的多少，这样才能比较出你要研究的目的基因的mRNA的表达水平。
希望这些对楼主能有帮助，的确如有些战友所言，如果楼主以后要经常从事分子生物学研究的话，最好还是找机会听些课，看点书籍，多和老同志聊聊，肯定是有裨益的，祝你顺利。
