PCR仪 » 讨论区 » 经验共享 » [求助]RT-pcr

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:[求助]RT-pcr

HOT兔[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 69996
精华 0
积分 209
帖子 158
信誉分 100
可用分 1551
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-3
状态 离线
1
 

[求助]RT-pcr

[求助]RT-pcr


各位大虾:
小弟用trizol提的小鼠肾脏和脾脏的RNA,但无论怎样改进方法测得的RNAOD260/OD280比值恒在1.4左右,我用PH试纸测得溶解RNA的溶液确实为酸性,但是实验室的其他兄弟提的RNA虽然用的也是相同的水,但是测得的比值相当满意(是不是这个原因我不是很确定)。但是现在我用我得到的膜板cDNA作pcr,总是得到弥漫性的条带,请教各位仁兄帮我找找原因,不甚感激!
顶部
caihong[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 73197
精华 1
积分 795
帖子 1206
信誉分 102
可用分 6856
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-9-20
状态 离线
2
 
我也用TRIZOL提的。第一次比值是1.7几,后来我移液相时只去了三分之二吧
测比值达1.9了,这样就防止把中间层的蛋白体进去。
有弥散带,我看文章说可以
1.减少循环数
2.减少底物量
3.降低延伸温度
顶部
INK[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 73382
精华 0
积分 348
帖子 375
信誉分 100
可用分 2696
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-9-22
状态 离线
3
 
不知道你自己有没有分析过原因。你这种情况我的一个同学也遇到过,我想你可以从一下几方面分析:
1. RNA提取的问题。在测定时可以用Tris缓冲液去测,那样会更准确些,另外,还是要重新提RNA,这是最关键的步骤。如果总不满意,可以试试其他方法。以我的经验RNA用水测,能达到1.6-1.7,有时也可以做反转录,但要注意你的260/230比值是否大于2。
2. 确定RNA没有问题后再确定你的反转录没有问题,根据你的RNA的量去大概判断模板cDNA的量。
3. 看看你的Taq有没有问题,换一种Taq酶试一试。
顺便说一句:你做实验不要太着急,先确定最初一步没有问题再继续,这样往往不会耽误实验,虽然你前面步骤可能花费时间多一些,但是总比每一步都不确定,到最后既浪费钱,又浪费时间还找不到原因好。
顶部
loli[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 71788
精华 0
积分 736
帖子 1171
信誉分 100
可用分 6650
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-31
状态 离线
4
 
我也同样遇到了这样的情况。可是我在每次提的时候都很“浪费”的不要了下层的1/3。
不过还是没有超过1。6!!
对了。用DEPC处理过的水来稀释样本来测OD值,应该用多少的PH值啊。我的那瓶水肯定PH值是已经低于6。5。是不是可以加NAOH啊。
反正都只是要测一下,不知道这个方法能不能行得通啊!
“能达到1.6-1.7,有时也可以做反转录,但要注意你的260/230比值是否大于2。”请问大于2又怎样!???
顶部
HOT兔[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 69996
精华 0
积分 209
帖子 158
信誉分 100
可用分 1551
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-3
状态 离线
5
 
谢谢楼上各位兄弟的宝贵意见,今天请教了位师兄,他建议我先用抽到的RNA做下电泳,那么是不是RNA电泳一定要用变性凝胶?鉴于本人呆的实验室条件简陋,请教下各位兄弟普通的琼脂糖凝胶行不行?  
顶部
avi317[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74131
精华 0
积分 566
帖子 811
信誉分 100
可用分 4896
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-6
状态 离线
6
 
0.8~~1%的琼脂糖跑RNA电泳都可以的,我就是这样作的,如果RNA提的好没有杂带,很清楚的。  
顶部
米米[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 70422
精华 0
积分 212
帖子 164
信誉分 100
可用分 1561
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-10
状态 离线
7
 
关于电泳问题,我用普通1%琼脂糖凝胶电泳的照片发一张:
28S比18S亮一点,虽然达不到两倍!
2道RNA蒋介比较严重了。


查看积分策略说明
附件
2011-10-9 10:52
58896926.jpg (26.37 KB)
 
顶部
米米[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 70422
精华 0
积分 212
帖子 164
信誉分 100
可用分 1561
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-10
状态 离线
8
 
关于比值不高的问题,我有两个建议:
1。在匀浆之后,12000转5分钟2~8度离心5min。上清转移之一新管。
2。吸上清时,绝对不能贪婪!扔掉1/3是保守估计!
顶部
dreaming[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 71302
精华 0
积分 371
帖子 441
信誉分 100
可用分 3016
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-24
状态 离线
9
 
RNAOD260/OD280的比值不一定能达到1.8,主要由于配制RNA的水应该用TE,而我们通常用无核酸酶水配制的,我的就只有1.7不到,但跑的电泳图还可以,而且在吸上清液的时候一定要小心,在用TRIZOL试剂1毫升时,最多只能吸取500微升。我用普通1.5%琼脂糖凝胶电泳的照片发一张:


查看积分策略说明
附件
2011-10-9 10:52
44036204_snap.jpg (9.77 KB)
 
顶部
=菓子=[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 71218
精华 0
积分 298
帖子 296
信誉分 100
可用分 2311
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-23
状态 离线
10
 
不知道两位用普通琼脂糖跑RNA电泳的时间为多长?  
顶部