生物质谱

大家好，最近我在做一个霉菌代谢反应实验，我是将一种知道背景的天然产物（
单体）以液态的形式加到平板上，再在凝固的平板上接以我的代谢菌（霉菌固态发酵），经过几天代谢后，我想把菌体外的代谢物给提取出来，可是培养基中含有琼脂，所以我想请教大家能不能有什么办法把琼脂给沉淀下来，但是我的目标代谢物又以液态的形式得以保留（类似沉淀蛋白质的方法）。
也许有人会问怎么不用液态发酵的形式得到代谢物，是这样的，我的这个菌主要是存在于茶叶上，也就是它在茶叶上生长就是以固态发酵的形式存在，所以我想用最接近这种生长的方式来考察这种菌的代谢情况，而且液态发酵的过程有别于固态发酵菌体的生长过程，所以这就是我的难题所在，有哪位高手知道这种情况或者有这方面经验的请给我指点指点，在此先谢谢大家了。

发酵完毕后，直接捣碎琼脂，用等体积乙酸乙酯乙酸乙酯来萃取三次，提取目标产物。能告诉我你做的是哪株真菌吗？具体的名字，能不能共享菌株啊，我做的是植物病原微生物和海洋微生物，可以互换菌株，共同共享怎么样啊……

可以的啊，我的是黑茶里的优势真菌，全名叫冠突散囊菌，因形态颜色金黄，因此又叫金花菌。
您说的用乙酸乙酯萃取的话，那琼脂应该不会溶于乙酸乙酯吧，萃取完后直接过滤除去琼脂是么？还有想请教下琼脂都会溶哪些有机溶剂啊，是这样的，因为我的代谢产物还不是太清楚，所以我想得到比较全的代谢化学组分，看可不可以考虑下用别的有机溶剂来提取目标产物。

脂不会溶于乙酸乙酯的，萃取完成后，过滤即可，再说，琼脂会沉底的，很好除去，另外，乙酸乙酯的萃取范围很大，应该会萃到你的目标产物，如果你不放心，乙酸乙酯萃取完后，再用正丁醇或者甲醇萃取，这样的萃取物属于大极性的，乙酸乙酯相是中小极性的……

脂不会溶于乙酸乙酯的，萃取完成后，过滤即可，再说，琼脂会沉底的，很好除去，另外，乙酸乙酯的萃取范围很大，应该会萃到你的目标产物，如果你不放心，乙酸乙酯萃取完后，再用正丁醇或者甲醇萃取，这样的萃取物属于大极性的，乙酸乙酯相是中小极性的……

怎样确定代谢产物是在菌体之内和之外？

这个问题问的很好哦，第一，捣碎之前你要是不嫌麻烦，刮菌苔也可以，无非是分两份萃取，一份纯菌苔萃取，一份琼脂萃取，个人感觉还是直接萃取吧，我都是这么做的，第二，你的目标产物在菌体内还是外，这个不好说，你必须得做发酵液活性实验，首先少量发酵2L发酵液，过滤或者离心，分离菌体与发酵液，分别用乙酸乙酯萃取，菌体要用丙酮浸泡24h破细胞壁，然后旋干丙酮，得到的水相用乙酸乙酯萃取，分别得到了两种浸膏，取少量浸膏用水溶解，分别测活性，来确定活性目标产物的位置。你能给我寄些你那的菌株吗？多寄几种，我们给你寄海洋真菌好不好啊！共享啊……

我又看了一遍你的帖子，必须有一点提醒你，我的方法是研究小分子化合物的，对蛋白质或者长肽链不适合，因为提取中用的有机溶剂会让蛋白质失活，短的多肽还是可以的，所以你首先得对目标产物有一定的了解。至少得知道大致的类型。

恩，说的很详细哦，谢谢！跟你学到不少东西了！
那可不可以告诉我具体的一些操作呢？比如说用什么样的培养基，测活性时怎样摒弃培养基的背景影响，认为是菌的代谢产物的影响而不是培养基的成分（我们一般用的液体培养基是PDA液体培养基），还有菌体破壁你们通常都是用丙酮来浸泡么？它的破壁率我多少？之前我们实验室是用酒精加超声的方法获得产物，这些有机溶剂的萃取比列通常又是多少呢，谢谢！我也是做小分子的，所以这个不用担心。
我们做微生物时间不长，昨天和你说了现在研究的主要是是黑茶中的一种优势菌株——冠突散囊菌，是一种曲霉，请问下您的海洋菌通常是用作什么活性功能的？

目标产物是茯茶素之类的么？先搞清楚易溶于水还是有机溶剂，易溶于有机溶剂比较好办，如果易溶于水就比较麻烦一点。试试干燥粉碎后提取，另外丙酮浸泡的话效果应该还是可以的，基本不用考虑破壁问题。