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标题:【求助】关于高通量测序

子衿青青[使用道具]
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【求助】关于高通量测序

第一次送样做高通量测序,很多地方不懂,我想分析古菌和细菌的多样性,引物要自己选么,一般选择什么引物呢,是把16S全长测出来还是测某个可变区,有木有大神跟我讲一讲,万分感谢
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newway[使用道具]
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引物的话,一般的测序公司都已经确定好了,可以选择的扩增区域不是很多,要看你选择哪个测序公司,不过,目前用的平台大都是Illumina 的,由于读长的限制,扩增区域也是比较有限的。另外,也有用三代测序Pacbio测序的,测的是16S的全长,楼主可以检索一些相关文献,学习一下。不是很懂的时候,可以多跟测序公司的技术支持聊聊,多咨询一下慢慢的就知道啦。
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baidukk[使用道具]
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对细菌而言一般用通用引物扩增出16sRNA,再测序比对。
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sunbent[使用道具]
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引物不需要自己设计。
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zbboom[使用道具]
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直接找公司给你做吧 全套 800一个样品
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leifengta[使用道具]
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通用引物就可以了
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tewank[使用道具]
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引物有taget V3,V4,V5,V3+V4,V4+V5等。
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采用illumina MiSeq第二代高通量测序平台测定的细菌16SV4区域和真菌ITS2区域的序列测序,测序数据量不低于4万reads。
一般引物是设定好的,特殊引物存在开发和摸索的问题,费用会增加,常规的引物已经流程化了,从成本考虑,肯定会推荐使用常规的。
如果是研究多样性,测某个可变区即可
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milkdog[使用道具]
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直接找公司给你做吧 全套 800一个样品

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样本量大的话,全套可以低于800元,具体可以联系我们
祝好
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quiqui008[使用道具]
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请问朋友能给我发一些16SRNA测序(特别是对于土壤或者沉积物样品)的资料么,越详细越好。谢谢了啊。
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