小中大首先，你筛选的菌，那你肯定是有目的的去选择的，你的筛选条件就可以指导这株菌可能得特性。另外，原核做16s鉴定是需要的，可以指导你去搜索相关，相似菌株的研究成果。最后，如果你筛选的菌鉴定后，为已知菌且完成全基因组测序，通常可以检索到相关基因功能的注释，当然整个基因组中，表达的酶也是非常多的，你还是要结合你研究方向或思路去选择你想要的那个功能基因来研究；当然如果是一个新菌株，又打算对它进行深入研究，进行全基因组测序是需要的，拿到菌的基因序列，再进行生物信息学的比对分析来注释每个功能基因，接下来就可以选择感兴趣的再进行下一步验证研究，最终确定或否定这个酶就是你之前比对的酶，这个工作量估计也是够个博士毕业了
