【求助】DGGE图谱多一条相同条带问题

细胞世界 » 讨论区 » 经验共享 » 【求助】DGGE图谱多一条相同条带问题

11 1/2 1 2 ››

需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

打印 | 推荐 | 订阅 | 收藏

标题:【求助】DGGE图谱多一条相同条带问题

小游abc[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 108891
精华 0
积分 256
帖子 231
信誉分 100
可用分 1911
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态离线

发表于 2016-2-17 11:42 资料个人空间短消息加为好友

小中大

不同纯培养的菌株，经PCR扩增16S rDNA V3区后，跑DGGE除目标条带外，都多一条相同的条带，在同一位置，但条带较目标条带模糊，大家遇到过类似情况吗？帮帮我吧~~

greenbee[使用道具]
四级
Rank: 4

UID 79370
精华 0
积分 710
帖子 1119
信誉分 100
可用分 6368
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-12-10
状态离线

发表于 2016-2-17 11:43 资料个人空间短消息加为好友

小中大

有可能是非特异扩增，还有可能是模板。应该胶回收再上dgge

xyw5[使用道具]
四级
Rank: 4

UID 75137
精华 1
积分 620
帖子 815
信誉分 102
可用分 4991
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-10-19
状态离线

发表于 2016-2-17 11:43 资料个人空间短消息加为好友

小中大

我在做几株纯菌DGGE的时候，在目标条带的下方都有一条带，各条带的位置也相同。条带比目标条带相比较模糊。应该与楼主的问题相同……

小游abc[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 108891
精华 0
积分 256
帖子 231
信誉分 100
可用分 1911
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态离线

发表于 2016-2-17 11:43 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

原帖由 xyw5 于 2016-2-17 11:43 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我在做几株纯菌DGGE的时候，在目标条带的下方都有一条带，各条带的位置也相同。条带比目标条带相比较模糊。应该与楼主的问题相同……

那你后来是怎么消除的？

小游abc[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 108891
精华 0
积分 256
帖子 231
信誉分 100
可用分 1911
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态离线

发表于 2016-2-17 11:44 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

原帖由 greenbee 于 2016-2-17 11:43 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
有可能是非特异扩增，还有可能是模板。应该胶回收再上dgge

PCR时得到的条带很单一，没有非特异扩增啊，是否模板的问题还不清楚，我试试割胶回收。谢谢~

redbutterfly[使用道具]
四级
Rank: 4

UID 76433
精华 0
积分 701
帖子 1102
信誉分 100
可用分 6281
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-5
状态离线

发表于 2016-2-17 11:44 资料个人空间短消息加为好友

小中大

我们实验室，纯菌最近都跑出好多条带，不知道是什么原因

小游abc[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 108891
精华 0
积分 256
帖子 231
信誉分 100
可用分 1911
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-5-15
状态离线

发表于 2016-2-17 11:44 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

原帖由 redbutterfly 于 2016-2-17 11:44 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我们实验室，纯菌最近都跑出好多条带，不知道是什么原因

实验结果有时真的让人意想不到，唉！

ujne[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 117905
精华 0
积分 359
帖子 377
信誉分 100
可用分 2711
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-12-7
状态离线

发表于 2016-2-17 11:45 资料个人空间短消息加为好友

小中大

你们找到结果了吗？

天蓝蓝[使用道具]
三级
Rank: 3

UID 70323
精华 0
积分 159
帖子 97
信誉分 100
可用分 1201
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-8
状态离线

发表于 2016-2-17 11:45 资料个人空间短消息加为好友

小中大

北京华美锐是一家专门代做DGGE实验的单位
1.技术路线如下﹕
客户提供样本，公司负责从样本中提取DNA，设计与合成检测片段特异性PCR引物， PCR扩增，PCR产物纯化，变性梯度凝胶电泳，PAGE切胶回收，二次PCR扩增， ...

====================================================

你们公司这么强大吗
那你帮人家分析下结果噻，省的我们这帮人天天不知道怎么办

yychen[使用道具]
四级
Rank: 4

UID 77452
精华 0
积分 516
帖子 751
信誉分 100
可用分 4495
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态离线

发表于 2016-2-17 11:45 资料个人空间短消息加为好友

小中大

你可以做一个pcr的阴性对照在跑dgge时候顺便跑阴性对照看看是不是本来阴性就会跑出条带我做细菌341f/518r纯菌就有多条带然后跑阴性dgge就发现多的条带与阴性对照条带是对应的。

11 1/2 1 2 ››