【求助】做水稻胁迫差异蛋白质组学

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daomei[使用道具]
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小中大

做水稻胁迫差异蛋白质组学，送到公司去打MALDI-TOF/TOF 质谱，得到如图片所示PDF文件，有一系列蛋白名称，登录号，分子量，等电点，等等信息
问根据这个怎么找蛋白点的功能与亚细胞定位信息？在那些网站找？水稻有无专门的蛋白库或基因库？就是类似拟南芥的tair 那种网站？

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2016-3-5 11:07

zouyou[使用道具]
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你把相应的GI号的序列在这个网站里面弄弄cuturl('http://www.uniprot.org/')
这里面好像是有功能预测的，具体在哪忘记了
亚细胞定位没做过，帮不上忙了

冰激凌[使用道具]
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google accession number (登录号) and check the related database
or ask the company what database they use in their search engine.

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先Blast查找同源蛋白，pfam可查找蛋白保守结构域，go注释其功能及定位。亚细胞定位有很多在线工具可以使用，比如CELLO, Psort等。Blast2go可做go富集和KEGG代谢通路的富集