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标题:【求助】水样中细菌种类的鉴定

tangxin_80[使用道具]
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发表于 2016-3-8 09:52 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】水样中细菌种类的鉴定

请问有什么办法可以确定某一水样中的所有菌的种类，最好是能具体到种的方法
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8黑眼圈8[使用道具]
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 小中大
涂平板，纯化出单菌落，做个16s，送测序公司。
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tangxin_80[使用道具]
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发表于 2016-3-8 09:53 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 8黑眼圈8 于 2016-3-8 09:52 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
涂平板，纯化出单菌落，做个16s，送测序公司。

这种方法肯定会漏掉很多细菌种类的，有没有别的方法。
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 小中大
先对水样微生物进行富集，然后选取不同类型的培养基涂平板，纯化出单菌落，根据简单的菌落形态及生理生化试验区分大致类别，然后做个16s，送测序公司
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 小中大
高通量测序。
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了了[使用道具]
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发表于 2016-3-8 09:54 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
你可以问问有没有专门提取水中16S总DNA的提取试剂盒，然后去做个高通量就行了。
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bhka[使用道具]
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发表于 2016-3-8 09:54 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
直接把水样用0.22微米滤膜过滤，滤膜交给公司提取总DNA，进行微生物多样性分析，价格不贵。
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tangxin_80[使用道具]
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发表于 2016-3-8 09:55 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
你可以问问有没有专门提取水中16S总DNA的提取试剂盒，然后去做个高通量就行了

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请问做个高通量的话可以鉴定到种吗？
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发表于 2016-3-8 09:55 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
做三代扩增子测序可以到种，但是我问了好几次，没人愿意做。
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