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标题:【求助】电泳图条带W状是肿么回事?

seven7[使用道具]
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【求助】电泳图条带W状是肿么回事?

我们在做基因型鉴定。有WT、杂合子、纯合子3种基因型(400~700bp)。用的1.2%的琼脂糖凝胶,上样10uL。电泳120V,40min。之前很好,这次就这样的条带,换了电泳槽的缓冲液也没解决。 第一条是MAKER,跑的也不好。 大家帮我分析下。


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2016-3-10 16:00
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chenshuanhe[使用道具]
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从你这个图上来看,你的marker跑开了,只是所有的样都弯曲了,有两个方面的可能原因:1.胶浓度较高,关键是没有混匀就凝固了,导致凝胶在缓冲液里分布不均,你试试用1%的浓度配胶,同时注意摇匀后灌胶;2.电压不稳,导致跑胶过程中条带歪曲,也不用那么高的电压跑的,你试试恒流跑20—30mA,恒压显示一般为50-60V(这个跟电泳槽有关,具体的数据看你的电泳槽说明)。希望对你有帮助
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vtongli[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 chenshuanhe 于 2016-3-10 16:00 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
从你这个图上来看,你的marker跑开了,只是所有的样都弯曲了,有两个方面的可能原因:1.胶浓度较高,关键是没有混匀就凝固了,导致凝胶在缓冲液里分布不均,你试试用1%的浓度配胶,同时注意摇匀后灌胶;2.电压不稳,导致跑胶过程中条带歪 ...

有一个疑问,如果是胶浓度的问题,那有可能全部是规则的w吗?
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yonger[使用道具]
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应该是胶布均一吧 ,你要把胶煮沸几次才好。
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shenkunjie[使用道具]
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是不是用水冲冷却了?
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seven7[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 shenkunjie 于 2016-3-10 16:19 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
是不是用水冲冷却了?

没有用水冲来冷却,是在摇床上摇晃8分钟冷却的。每次煮沸3次,应该煮匀了吧。
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感觉是胶冷却的时候没有均匀冷却或者冷却时间太长,电压不稳或者过高,我们一般用100v
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memory[使用道具]
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这种情况基本可以断定是电压过高导致。
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qhyu[使用道具]
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先不说你的问题 就针对你的实验我提点小tips,胶跑的时间越长,带越不清楚,尤其是杂合的条带,因此建议你加大电压140V,跑的时间短一点,只要能区分开就可以了,不需要在胶图上跑的那么开,那么大,胶的浓度高一点2%,你可以试一下。
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原因可能有三 第一电压太高 第二制胶时候泳道口不规整 第三 缓冲液没有及时更换
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