生物质谱

坛子里各位大牛好，新虫一只，最近遇见一个问题想寻求大家的帮助。
我目前研究的这个物种是一种真菌，技术限制现在无法进行基因编辑。在本实验室研究的前期，我们鉴定到了此物种的一个重要蛋白。
目前已经做完了原核表达蛋白，并且获得了相应的单抗，获得了亚细胞定位结果，并且证明了他的原核表达蛋白能够粘附在宿主细胞上。现在老板让我着手研究此蛋白的功能，我目前只进行了生物信息学分析了一些磷酸化位点，对于如何制定相对应的功能研究的方法毫无头绪。
求教大家，这种情况无法进行knock out 、knock in的情况应该如何着手研究一个蛋白的功能。
小女子十分感谢各位相助。

真菌本身没法做，可以做它的宿主啊。看看黏在宿主细胞上是和哪个表面受体（应该也是蛋白质）结合，结合的机理是什么，这种结合和蛋白的三级结构的关系，结合后对宿主组织及细胞膜的改变，是否靠这种改变侵染宿主，如果把宿主的受体蛋白抑制掉会不会造成真菌的无法侵染。

看看黏在宿主细胞上是和哪个表面受体（应该也是蛋白质）结合，结合的机理是什么
您好，请问下这一部分工作，是否能够通过Pull down ,co ip 或者western杂交宿主总蛋白这样的方法来抓取这个表面受体蛋白？另外如果此受体不是蛋白，能用什么别的方法再进行抓取嘛？

可以试试co-ip找找结合蛋白，也应该试试酵母双杂。
如果不是蛋白就比较麻烦了，我想用同位素标记蛋白，然后用电镜看看是不是能看出什么来。不过想想看，不和蛋白结合它和什么结合啊？直接进入细胞膜磷脂分子的话，应该有功能非常明确的domain，并且有3级结构支持才行。