小中大【求助】测定分子量,跑电泳可以是SDS-PAGE吗
本人有一PEG修饰蛋白,修饰后分子量在90kD左右,想通过MALDI-TOF测定分子量。问题是蛋白纯度不高,想通过PAGE胶回收的方法获得高纯度的蛋白。搜索了论坛有关蛋白胶回收的帖子,收益匪浅,但仍有问题请教大家:
1. 关于电泳 变性还是非变性:我的用途是测定分子量,跑电泳可以是SDS-PAGE吗?SDS会污染样品导致分子量测定结果吗?最保险的方法是native-PAGE?
2.关于电泳后的蛋白洗脱:论坛上给出了两种方法,一是将胶切碎或研碎,置于溶液中,冰箱过夜,离心得上清再透析浓缩;二是电洗脱,置于透析袋中水平电泳。第一种方法比较简单,但是我担心研碎的过程会不会导致胶成分小部分溶解,从而导致上清中成分复杂,影响质谱测定?在这点上说是不是电洗脱方法会好一点呢?
请虫友们帮忙分析分析,先行谢过啦!