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标题:【求助】一株菌的大量蛋白质如何才能确定这些蛋白分类

yazi[使用道具]
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发表于 2016-3-23 12:52 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】一株菌的大量蛋白质如何才能确定这些蛋白分类

紧急求助：通过质谱技术，获得了一株菌的大量蛋白质序列信息，如何才能确定这些蛋白序列的功能喝分类呢？怎么查找参与某一代谢途径的蛋白？谢谢
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xiaoxiaoai[使用道具]
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发表于 2016-3-23 12:52 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

首先你要过滤和通过统计学方法选定哪些蛋白是可信、可用的， 然后选查的感兴趣的蛋白参与的代谢途径  推荐一个网站 cuturl('http://www.genome.jp/kegg/pathway.html')
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mimima[使用道具]
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发表于 2016-3-23 12:53 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

不好意思，能详细一点吗？我只是想找到这些蛋白中有哪些蛋白参与氨氧化过程
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886爱[使用道具]
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发表于 2016-3-23 12:53 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

你有该菌种的全基因序列么？ 如果有 就先再基因组里找哪些蛋白参与了氨氧化过程， 然后再去看你打出来的质谱里有没有这些蛋白
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青青草[使用道具]
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发表于 2016-3-23 12:53 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【回复】

谢谢，有全基因组序列
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