生物质谱

本书主要介绍生物质谱技术与方法。全书共分14章和附录。第1章对生物质谱的发展予以扼要介绍。第2-4章侧重于生物质谱技术，包括生物质谱仪器、电离与接口技术、分离与鉴定联用技术。第5-14章侧重于生物质谱方法，分别为基本分析、氨基酸序列的解析、肤蛋白质分析、蛋白质组学分析、临床医学分析、核酸分析、分子间相互作用分析、药物分析、生物体液分析、样品分析前处理。附录包括数据库检索的一些知识和操作。
前言
第1章 生物质谱的发展
参考文献
第2章 四极杆、离子阱、离子回旋共振和飞行时间质谱技力
2.1 带电粒子的捕获
2.2 四极杆质谱仪
2.3 离子阱质谱
2.4 傅里叶变换-离子回旋共振质谱仪
2.5 飞行时间分析器的基本原理
2.6 反射式飞行时间质谱原理
2.7 二维质谱
参考文献
第3章 大分子电离与接口技术
3.1 大分子电离技术
3.2 接口技术
3.3 常压离子源与真空接口
参考文献
第4章 与生物质谱联用的分离技术[1]
4.1 高效液相色谱
4.2 毛细管电泳
4.3 毛细管电色谱-质谱联用
4.4 ***色谱与质谱联用
4.5 微加工微流控装置
4.6 LC与MALDI/MS联用
4.7 亲和分离与质谱联用
参考文献
第5章 基本分析方法
5.1 相对分子质量准确测定的意义
5.2 实验方法
5.3 实验条件影响
5.4 LC-MS联用鉴定蛋白
参考文献
第6章 氨基酸序列的解析
6.1 氨基酸序列的质谱解析
6.2 肽的解离
6.3 蛋白和多肽的选择性断裂
参考文献
第7章 肽和蛋白质分析
7.1 蛋白质鉴定概述
7.2 肽谱分析
7.3 质量肽谱和质量指纹谱
7.4 肽质量指纹谱的实验技术
7.5 串联质谱数据鉴定蛋白质技术
参考文献
第8章 质谱在蛋白质组学中的应用
8.1 蛋白质组学和生物质谱
8.2 蛋白质鉴定的方法
8.3 蛋白质组和翻译后的修饰
8.4 结论
参考文献
第9章 生物质谱在临床医学中的应用
9.1 临床化学与实验室质谱
9.2 用于诊断的代谢物
9.3 用于诊断的蛋白质和糖蛋白
9.4 用于诊断的生物聚合物
9.5 定量分析与质量保证
9.6 结论
参考文献
第10章 核酸分析
10.1 MALDI-MS和ESI-MS在寡聚核苷酸测序上的进展
10.2 寡聚核苷酸的序列测定策略
10.3 小结
参考文献
第11章 分子间相互作用的分析
11.1 非共价键合复合物的一般性研究
11.2 DNA和RNA非共价键复合物的研究
11.3 核酸复合物
11.4 RNA-配体复合物
11.5 展望
参考文献
第12章 生物质谱法在药物分析中的应用
12.1 概述
12.2 LDI、MALDI在药物分析中的应用
12.3 ESI/MS和LC/MS在药物分析中的应用
参考文献
第13章 生物体液中微量蛋白类药物的亲和提取与质谱鉴定
13.1 生物样品中蛋白类药物的分离纯化
13.2 亲和层析提取得到的蛋白类药物样品的生物质谱分析
参考文献
第14章 样品分析前处理
14.1 生物材料的选择与前处理
14.2 细胞的破碎与细胞器的分离
14.3 提取和纯化
14.4 样品的浓缩、干燥及保存
14.5 测试样品制备
参考文献
附录
附录1 数据库的Internet检索
附录2 因特网上蛋白质数据库的检索及应用
附录3 Mascot——一个强大的因特网质谱数据搜索平台
附录4 有关标准氨基酸和核酸的数据

请版主给我一个转行做modeler 的建议吧, 你觉得我还有机会转行做modeler? 需要做那些准备呢？

我对你不太了解，不知以前做什么？为什么要做modeler?还有你现在所处的环境是否支持你这样做？假如在高校会更灵活些。你的背景知识和计算机技巧是否匹配？或者你非常乐意花时间学新的技术和算法？
如果都OK的话，不妨去尝试，关键是自己喜欢的。

前辈有太多值得我们学习的地方了！专一、探索、钻研……得过且过的我们需要好好聆听前辈教诲！

前辈，因为我是学临床的学生，现在在做心梗血管开通前后代谢组的变化，找了些书来学习，可是还是觉得不懂，也不知道从哪开始学习。请前辈给点指教，谢谢。

不敢称前辈。代谢组涉及不少统计知识，也要学很多工具，如果没有人带，确实有点难度。不过事在人为，用心总会有收获。下面几篇综述请参考：
Metabolomics: A Global Biochemical Approach to Drug Response and Disease
cuturl('http://www.annualreviews.org/doi/pdf/10.1146/annurev.pharmtox.48.113006.094715')
Metabonomics technologies and their applications in physiological monitoring, drug safety assessment and disease diagnosis
cuturl('http://informahealthcare.com/doi/pdf/10.1080/13547500410001668379')

首先我们要明白为什么质谱，尤其是多级质谱的解析很难，甚至比核磁还难？！这是因为其提供的信息非常有限，NMR可以提供原子层次的信息，而质谱只能提供到基团（多个原子构成的特定组成）层次。这些有限的信息，少到从理论上就不可能推测出一个唯一的结构！是啊，确实如此，就像我们遇到了无解的方程，难道还有比这更难的吗？举了例子，对绝大多少小分子化合物来说，一套NMR图谱(1H, 13C, HMQC, HMBC)，有经验的人就可以推测出其结构；而拿来一套小分子的多级质谱，即便有10级的数据，如果解析的人不知道其他背景知识的话，比如样品是天然产物，还是合成的，若是天然产物，来自什么植物或药材，有没有紫外吸收等等，绝大多数情况没有人可以确切的推出化合物的结构。当然，你们可能会问我，给我一套多级质谱数据，我是否能推出其结构呢？这个问题留待后面回答！
看到这里，是不是感觉很失望！既然这么难，为什么非要用质谱分析呢？用NMR不就得啦！不然，质谱的优势在于其灵敏度高，同时在其与LC联用以后，就成为一种强大的混合物分子工具（LC-MS），这是NMR不可比拟的。LC-MS成熟以前，若要研究清楚一味药材中有哪些成份，不花几年功夫，基本没戏，一般一个植化的硕士或博士研究清楚一个药材就可以毕业了!但有了LC-MS，这个过程可能只需要几个月，甚至几周就可以获得以前需要几年才能获得的信息！因此，质谱是其他技术暂时无法替代的！
虽然普遍意义上的质谱数据没有唯一解，但只要限定研究的范围和条件，那还是有解可循的。就如化合物的浓度与其UV响应的关系我们是没法知道的，可在一个很窄的范围内，就能用直线来近似他们的关系！那么如何限定质谱研究的范围呢？首先我有几项假设，所有的质谱推理都建立在它们之上：

前文讲到由于质谱自身关于化合物精细结构的信息有限，需借助已有标准物质建立裂解规律，才能对同类物质的未知结构进行推断。除了借助标准品的信息，中药中成分间自有的关联信息也非常有用。中药（包括药材和方剂），甚至植物药，中的成分间往往存在某种特定的关系，很少遇到仅是孤零零几个不相关成分的情况，这个特点特别适合于用质谱分析，并且鉴定的时候，不出结果则已，一出结果那就是一大串化合物同时被鉴定了。因此，找到这个一锅粥中的内在联系，将会使我们的质谱分析工作事半功倍。

今天刚刚学习了LC-MS的基本操作。虽然还看不太懂，但是感觉讲的真好！！！

LZ做这方面的研究需要计算机技术吗？比如会用什么语言编程？