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标题:【求助】关于抗体电荷异构体之间是否存在相互转化问题

PINK[使用道具]
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有没有这种可能,5转为2,6转为4或3,蛋白酶污染了,纯属瞎猜,转“Physicochemical characterization of Remsima®”。
Rituximab
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Remicade
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楼上的能提供一下infliximab的文献吗?谢谢额!
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这个话题有点意思啊,有持续的关注。charge variants的分离我觉得还是displacement chromatography效果最好。另外,这个图谱确实不正常,整体偏右。现在国内做抗体药的,都没有人是全部都懂的,做培养的也许只知道发酵,但是对蛋白质的性质完全不了解,做纯化的也未必深度了解蛋白质。药物分析这块呢多数是以前做小分子的,后来转做大分子,方法虽然大同小异,但是蛋白质的复杂性决定了分析的复杂。每个部分如果没有一个牛人支持,基本就搞不成。7楼这个确实很有意思,我以前确实碰到过这种蛋白,离子柱可以分得很好,但是后面每一个单独组分再分析又变了,不过这样的抗体确实没碰到过。按道理,抗体的charge variant虽然有多种成因,但是在下游纯化完成后最容易发生的也就是oxidation和deamidation了,有些可能还有Asp的isomerization啥的。如果真像7楼说的,倒是可以分析抗体里面是否含有这种金属离子导致构象出现了变化。
......

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请教大牛displacement chromatography都有用到啥displacer?能做到多大规模?
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图谱看的不是很清楚。第一个第二个碱性峰是不是含K的峰要看CPB酶切之后的结果的,有可能第一个峰是P-amidated的峰,第二个碱性峰才是1k,而2K则很小。所以也有可能第二个碱性峰高于第一个碱性峰。我们做的就有这样的
另外说到放大后的酸碱比例出现变化我们也经常碰到,酸性峰还可以通过后期纯化降低,碱性峰就有点困难,我们当时碰到的问题就是1K的峰太高,导致件碱性峰一直超标
......

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感觉你说的不错,第一个是有可能是P Amidated,是需要看酶切后的结果;另外,后期纯化酸性峰是容易去除,而碱性峰则难以去除,主要是因为两则的浓度相差太大,酸性一般占34%左右,而碱性占15%以下,在同样的阳离子条件下,浓度与出峰的先后顺序导致除去难以程度不同,个人观点。
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QUOTE:
原帖由 PINK 于 2016-4-13 12:49 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
有没有这种可能,5转为2,6转为4或3,蛋白酶污染了,纯属瞎猜,转“Physicochemical characterization of Remsima®”。
Rituximab
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请问,你是用的N2000软件吧?
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hulu呼噜[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 3.14 于 2016-4-13 12:52 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

请问,你是用的N2000软件吧?

并不是,,就用的agilent chemstation。
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PINK[使用道具]
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http://d.dxy.cn/detail/7455129
已有,之前早已上传,其实抗体的经典的就那么几篇,是否是可以找个人把抗体的链接文章都整合下,进行分类,例如培养类、纯化类、质量研究、USP及国内标准、生物类似物类便于大家学习。或者把这些帖子汇总起来,便于学习。
我不做生物类似物,但我特别喜欢生物类似物的研究文章,感觉能悟出一些思路或者想法出来。
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hulu呼噜[使用道具]
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电荷异构体的课题也做完啦,感谢各位战友给予的帮助。
最终分离的样品
对于最初提的问题,做个总结,欢迎补充讨论。
1、分离方法:最开始分离电荷异构体时,考虑过用置换色谱(displacement chromatography),也有相应的文献参考,找到了置换剂,但置换剂过贵,且仍需检测置换剂的残留,最终放弃这个方法,改用半制备的离子交换柱,与分析型的一致,也有利于直观观察收集。 不过此方法收集量小,做常规分析够用。 若准备做细胞活性分析及动物实验,建议直接去探索置换色谱吧。 分离后,样品的保存很关键,后续的检测方法条件也值得推敲。
2、关于图谱偏右: 偏右的原因还是因为上样量亦或是分离条件受限,尝试过降低上样量,峰型对称因子变好,但由于微小的组分分辨差,导致比例差异大。 尝试过加大洗脱液离子强度,也同样能形成不拖尾的峰,但同样也易使碱性峰被洗脱,影响分析结果。 综上,受限于离子性质过近,某些翻译后修饰量甚小,选择分离条件时要平衡这些因素。个人感觉,原则上能表征CQA,同时方法耐受性、重复性等等均符合。
3、酸碱性成因: 24楼 jackieustc 提到了类克的酸碱性峰主要的形成原因,但如氧化、异构化等并未提及。 我所做的抗体 结果显示,酸性峰主要由脱酰胺、唾液酸、蛋氨酸组氨酸氧化 、异构化等,碱性峰主要有赖氨酸、氧化、多聚、man5等导致,酸碱性峰中性糖差异也显著,如G0 G1F man5,这些中性糖是否会通过构象影响与柱子的结果,现在也不得而知,已有多篇报道,并未得到一致结果。
4、酸碱性峰的转化:关于转化,主要牵扯到的是哪种翻译后修饰占主导。如唾液酸使抗体带负电,而赖氨酸会使抗体增加一个正电荷,若抗体同时存在唾液酸及赖氨酸,情况又会是如何? 两个赖氨酸存在下,会增大两个电荷,因而主要是碱性效应。 若在培养纯化等过程,赖氨酸被切除,碱性异构体就会转化成酸性异构体。7楼提到的CU离子,最终影响的也是赖氨酸的形成。 在课题中遇到酸碱性异构体中255位蛋氨酸氧化明显、经CPB处理后,碱性减少,酸性第一峰比例增加;经双氧水处理后,酸性第一峰同样增加显著。 这些现象似乎就能说明,对于此抗体255位蛋氨酸氧化导致构象改变,形成酸性异构体,但若末端赖氨酸存在,正电荷效应更加显著,最终主要显示碱性峰效应。受限于仪器条件,证明过程并为深入研究。
几点建议: 1、 关注聚体,聚体主要显示碱性,对离子分布、疏水分布及后续的活性实验都有很大影响。因为做碱性分析时,最好排除聚体干扰。
2、 疏水色谱在行业内并为得到较好的应用,但是其在表征PTM尤其是异构化,氧化等作用很显著。
3、 多读文献,由于PTM太过复杂,文献的积累很重要。当年提这个问题时啥都不懂,看了不下百篇文献后,很多问题都已经心中有底,只缺实验验证。
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#碧海潮生#[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 hulu呼噜 于 2016-4-13 12:53 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
电荷异构体的课题也做完啦,感谢各位战友给予的帮助。
最终分离的样品
对于最初提的问题,做个总结,欢迎补充讨论。
1、分离方法:最开始分离电荷异构体时,考虑过用置换色谱(displacement chromatography),也有相应的文献参考,找 ...

太牛了,先挺后细细品味。
但是对你的课题来说,转化的原因呢,如何从碱性变成酸性的,氧化会形成酸性峰,但是末端的赖氨酸没那么容易掉的啊。如果赖氨酸不掉,单单氧化按你的描述,应该仍是碱性的。
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#碧海潮生#[使用道具]
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几点建议: 1、 关注聚体,聚体主要显示碱性,对离子分布、疏水分布及后续的活性实验都有很大影响。因为做碱性分析时,最好排除聚体干扰。
聚体出峰在碱性位置,甚至还要靠后,活性成倍增加。

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能排除当然最好。实际上很难,蛋白一般在离子交换层析过程中也会产生聚合。
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