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ES细胞来源于着床前胚胎囊胚时期的内细胞团，在体外可以无限扩增，并具有分化为各种成熟的体细胞的能力，这些特性使ES细胞无论在基础研究还是在临床应用上，都具有非常重要的价值。近年来，由体细胞重编程所得的诱导性多能干（induced  pluripotent  stem，iPS）细胞的建立进一步拉近了ES细胞和临床疾病治疗的距离。同时，深入了解ES细胞的自我更新调控和分化潜能维持的分子机制，也成为科学家们共同关注的焦点之一。



近年来的研究发现TAF3是基础转录因子TFIID复合体中的一个亚基。在转录起始过程中，TAF3通过PHD  domain与H3K4me3结合，进而帮助TFIID间接结合至H3K4me3位点，引发转录起始。在这篇文章中，研究人员对TAF3的功能进行了进一步探索。研究发现，TAF3对内胚层标志基因表达起重要的调控作用。下调ES细胞中TAF3的表达水平，可导致内胚层标志基因的表达水平下降，阻碍内胚层的分化过程。与之相对应的是，在ES细胞中过表达TAF3则可促使ES细胞内胚层（endoderm）样分化，并抑制ES细胞向神经外胚层（neuroectoderm）和中胚层（mesoderm）定向分化。进一步的全基因组结合研究和分析表明，TAF3一方面通过TATA结合蛋白定位在核心启动子上，另一方面通过CTCF直接将TAF3招募至启动子远端位点，通过形成TAF3/CTCF/Cohesin介导DNA成环（looping）调控内胚层标志基因表达，从而促使ES细胞向内胚层方向分化。



该研究首次发现了TAF3在调控ES细胞命运上的重要功能，并为全面认识胚胎干细胞的分化调控机制，了解祖细胞中调控细胞命运的转录因子网络提供了新视角。