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标题:[求助]细胞线粒体内和胞浆蛋白提取

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[求助]细胞线粒体内和胞浆蛋白提取



我的实验是研究细胞凋亡过程中(体外培养的细胞株),细胞色素C等线粒体内蛋白向细胞质的释放情况。因此,必须要先分离线粒体和细胞浆,然后对各自的蛋白进行western-blot,观察凋亡前后细胞色素C等蛋白在线粒体和细胞浆之间分布的变化。

虽然试剂公司有卖分离线粒体的试剂盒,可是比较贵,我还是想自己做。

下面的方法是一位战友发给我的,热心的战友帮我看看,您觉得该方法内部有没有问题。或者您有什么新方法教我,万分感谢!另外,我要测线粒体内部的蛋白,为什么各种方法都告诉我最后提取的是完整的线粒体?我不要完整的线粒体,完整的线粒体能做western-blot测内部的蛋白么?应该不能吧?

方法如下:
所需物品:
10ml玻璃离心管,冰冷的PBS,Dounce匀浆器,1.5ml离心管,4°C离心机。
RSB低渗缓冲液:
10 mmol/L NaCl
2.5 mmol/L MgCl2
10 mmol/L Tris-Hcl, pH7.5

2.5X MS缓冲液
525 mmol/L甘露醇
175 mmol/L蔗糖
12.5 mmol/L Tris-Hcl, pH7.5
2.5 mmol/L EDTA, pH7.5

1X MS缓冲液
210 mmol/L甘露醇
70 mmol/L蔗糖
5 mmol/L Tris-Hcl, pH7.5
1 mmol/L EDTA, pH7.5

实验步骤:
实验开始前,准备足够的RSB缓冲液(1 ml/次):每毫升RSB、MS缓冲液中加入2μl蛋白酶抑制剂和1μl DTT。

1. 用10ml玻璃离心管收集5 x 107个细胞。
2. PBS洗细胞一次,将细胞在4°C 下,600 g x 5 min 离心一次;
3. 弃上清,细胞沉淀重悬于 1ml冰冷的PBS;
4. 细胞在4°C 下,600 g x 5 min 离心一次;
5. 弃上清,细胞沉淀重悬于1ml 冰冷的RSB缓冲液,冰上孵育10 min;
6. 将细胞重悬液全部转移到合适的已预冷的Dounce匀浆器中,用研杵上下研磨30~50次左右。
注:可在显微镜下检测匀浆的效果。取2~3μl匀浆液滴在载玻片上,显微镜下观察 ,若70~80%的细胞核周围不存在一圈亮环,则说明匀浆效果较好,否则再研磨10次。
7. 立刻加入0.8ml 2.5 X MS缓冲液至终浓度为1XMS,用封口膜封住匀浆器顶端,混匀;
8. 将匀浆液转移到1.5ml离心管中,4°C ,1000 g x10 min 离心一次;
9. 将上清液转移到另一干净的1.5ml离心管中,4°C ,17,000 g x20 min 离心一次;
10. 收集上清液(即细胞浆部分),将离心后的细胞沉淀重悬于0.1ml MS缓冲液;
11. Bradford法测定蛋白浓度。
12. Western Bltoing.
谢谢帮助。
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我们是用来做cyto-c释放,方案如下,结果很理想,只是要超速离心,不知你们那里有没有超速离心机,如果不超离,得到的只是粗线粒体,对结果可能会有影响,为排除溶酶体和过氧化物体污染,必需超离。

线粒体与胞浆的分离
试剂配置
1)Buffer A :250 mM sucrose, 1 mM EDTA, 50 mM Tris-HCl, 1 mM DTT, 1 mM PMSF, 1 mM Benzamidine, 0.28 u/ml apotinin, 50 µg/ml leupeptin, and 7 µg/ml pepstainA, pH 7.4 ;
2)Buffer B :250 mM sucrose, 1 mM EGTA, 10 mM Tris-HCl, 1 mM DTT, 1 mM PMSF, 1 mM Benzamidine, 0.28 u/ml apotinin, 50 µg/ml leupeptin, and 7 µg/ml pepstain A, pH 7.4;
3)细胞裂解液:10 mmol/L Tris-HCl,pH 7.5;150 mmol/L NaCl;5 mmol/L EDTA;1% Triton X-100;1% 去氧胆酸钠;1% SDS;1 mmol/L PMSF;0.28 u/ml Aprotinin;50 μg/ml leupeptin;7 μg/ml Pepstatin A。
分离线粒体与胞浆蛋白
1)取对数生长期细胞,调整细胞浓度为2×105/ml,接种于玻璃培养瓶中,分别在给予处理1.5 hr、3 hr、6 hr、12 hr、24 hr后收集细胞,冰冷的PBS洗两次;
2)将细胞重悬于Buffer A中,转移至1 ml玻璃匀浆器,放至冰浴中,上下抽拉30次;
3)离心(1000 g×10 min,4℃),弃沉淀,将上清移至一新EP管中;
4)离心(10,000 g×20 min,4℃),所得上清和沉淀分别为胞浆、线粒体粗品;
为排除溶酶体和过氧化物体污染,需做以下进一步处理:
5)将胞浆部分转移至超离管中,离心(100,000 g×1 hr,4℃),所得上清为纯化的胞浆;
6)将线粒体沉淀部分重悬于Buffer B中,离心(10,000 g×10 min,4℃),重复3次,所得线粒体沉淀于细胞裂解液中裂解;
7)分装以上蛋白溶液,-70℃保存。

紧接着就可以western blot了,试一试,我们实验室这个方法已经很成熟了,祝你好运。
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yes4[使用道具]
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衷心感谢帮助,关于您提供的方法,我有几个问题,请指教:
第二步中,将细胞重悬于Buffer A中,此时用的Buffer A是4度还是常温?

紧接着,转移至1 ml玻璃匀浆器,放至冰浴中,上下抽拉30次。请问1 ml玻璃匀浆器您知道到哪里弄么?或者哪里卖?多少钱?或者有什么方法可以代替?

第5步中,所得上清为纯化的胞浆。大概有1ml吧?我以前做western的时候,每1×106个细胞总蛋白才制50微升样品,1ml是不是太多了?蛋白浓度还能够么?最后细胞浆部分蛋白浓度能达到western的要求么?
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1.所有操作最好在4℃下存在,因为有蛋白酶抑制剂。
2.10e6个细胞加100ul就够了,因为线粒体的蛋白较少,而胞浆蛋白浓度大了还可以稀释,但若加太少,匀浆将损失大量的蛋白。
3.1 ml玻璃匀浆器购于海门的一个仪器公司,baidu上查一下就可以搜到,大约8元/个。
祝好运。
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yes4[使用道具]
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请问您提供的方法哪本书上有介绍么?
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各位大侠,最近小弟也在提线粒体,不管是粗提还是精提都能提出线粒体,但是有两个问题,我测得线粒体氧消耗,没活性,粗提还是精提都测过了,就是不行,另外 楼主说胞浆蛋白部分我也想做western 部分,但整个上清有1ml左右,直接测浓度做WB 吗,是不是浓度太低了啊!还是有其他的获取高浓度蛋白的方法,请楼主及各位大侠指点!(据说有蛋白浓缩的方法,各位大侠可有经验!)
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loli[使用道具]
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各位亲爱的战友 有没有人知道-80℃保存的心肌如何提线粒体的啊? 看了很多文献都说是新鲜的,~~~~(>_<)~~~~ 盼望各位好心人给予帮助 谢谢啦!
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kewanqi2011[使用道具]
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想请教一下大家,裂解液B裂解离心后我们收集的是沉淀还是上清啊~~大家对这个好像都没有说清楚~~
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