英研制出“U盘”基因组测序仪 插入电脑即可完成测序

据美国物理学家组织网近日报道,英国牛津纳米孔技术公司在佛罗里达州基因组生物学与技术会议上宣布了一个爆炸性消息,即推出GridION和MinION 两款基于新一代DNA测序技术的便携式基因组测序仪,后者仅有U盘大小,可插入电脑USB端口完成测序,价格仅900美元。




两个仪器都是基于纳米孔测序技术,采用一种特殊的蛋白在薄膜结构上打出纳米级小洞或小孔,在膜的一侧施加电压将单条DNA链(带负电)拉进纳米孔。 当DNA的化学碱基通过时,引起细微的电流变化,测量这种变化即可识别出不同的碱基(T、C、G和A)组成顺序,然后通过电脑将每一部分的结果编织在一起 呈现。人类基因组包含大约30亿个碱基,DNA测序就是将这些碱基的顺序识读出来。


    该消息令投资者大为振奋,而对于牛津纳米孔技术公司的竞争对手美国Illumina公司和生命科技公司来说犹如一记重创。生命科技公司于今 年初推出的最新台式离子质子序列发生器测序需要24小时,价格约15万美元。相比之下,如果将20个单元连接在一起,GridION可在15分钟内完成整 个人类基因组测序,价格为5000美元;如U盘大小、即插即用的MinION可直接插入笔记本电脑USB端口测序。


    无疑,新测序仪将带来DNA测序更为广泛的应用,允许非专业科学家提取DNA信息,即使在野外研究人员也可将样品置于仪器中,将其插入载有 相关软件的笔记本电脑后,几乎片刻就会得到基因组样品的信息,以确定植物或动物的遗传性状。种子研究公司可使用它来分析田间作物,如查查是否有外源混合; 肉类检查员可拿它测试不同类型的微生物;生物学家可以用它来寻找几代人基因中的微小变化。


    然而,在这些愿景中也有小小瑕疵:目前这种设备有4%的错误率;MinION是一次性的,产量不如GridION高;尽管该公司称,在今年 某个时候发售相关产品之前,价格会大幅下降,但对于许多应用者来说还是有些贵。