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标题:[讨论帖]稳定转染和抗性筛选,那个对细胞的影响更大?

qqq111[使用道具]
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[讨论帖]稳定转染和抗性筛选,那个对细胞的影响更大?



手上也做了十多个稳定克隆细胞系了,可是越往下游做越迷茫。
有时候挑十几个单克隆才一两个阳性,咱也不去追究为什么没有稳定转染进质粒也有抗性了。可有时候空载体和目的载体各挑了两个克隆,鉴定阳性以后,却发现四个细胞很多蛋白表达各不相同。。。。于是惊讶,那么多文献只用一个克隆就能说事儿?做的越多,我越觉得稳定克隆很难去代表仅仅稳定表达了外源基因的原细胞系,变数太多了。细胞从转染到抗性筛选,到从单克隆长出来,外界施加的调控太多了,如果某基因对其下游的影响不是很高效的,或者不是很专一的,用稳定克隆的方法是很难去研究的。
请教高手们,稳定克隆的形成和外源基因的表达,哪个对细胞的影响或塑造更大一点?
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很多试验都要求用混合克隆做的,你可以将几个克隆混合到一起,看看结果。
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个人认为单克隆个性太强,很多时候跟原有细胞系的形态和生长特性差异还挺大,我也觉得实验用混合克隆更能说明问题。
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qqq111[使用道具]
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个人认为:稳定转染不太适合做功能实验,比较适合做信号通路。(很多成瘤率不高的正常细胞系,我筛选出单克隆后成瘤率接近100%,对于永生性向恶性的转变来说,有限稀释单克隆形成的影响真的很大很大),还有就是overexpression的体系比knockdown要来的清楚些,尽管不太符合实际:)
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稳定转染的意思就是你的载体上的DNA片段随机整合到基因组内了
但是每个细胞进入的DNA量不一样 整合的效率也不一样
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如果信号强的话,混合克隆更好些。
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utt0989[使用道具]
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手上也做了十多个稳定克隆细胞系了,可是越往下游做越迷茫。
有时候挑十几个单克隆才一两个阳性,咱也不去追究为什么没有稳定转染进质粒也有抗性了。可有时候空载体和目的载体各挑了两个克隆,鉴定阳性以后,却发现四个细胞很多蛋白表达各不相同。。。。于是惊讶,那么多文献只用一个克隆就能说事儿?做的越多,我越觉得稳定克隆很难去代表仅仅稳定表达了外源基因的原细胞系,变数太多了。细胞从转染到抗性筛选,到从单克隆长出来,外界施加的调控太多了,如果某基因对其下游的影响不是很高效的,或者不是很专一的,用稳定克隆的方法是很难去研究的。
请教高手们,稳定克隆的形成和外源基因的表达,哪个对细胞的影响或塑造更大一点?

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我是这么理解的:
1.没有稳定转染质粒也有抗性:细胞突变,对药物有耐受;
2.挑单克隆后蛋白表达不一:稳定表达细胞系,基因随机插入,当然有可能蛋白表达差异。但是目前我们的研究手段就这么些,这种情况下,混合克隆可能还更接近实际情况。
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吴才子[使用道具]
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早些做个相关实验,对此谈几点看法:

1. 通过稳定转染来研究一个目的基因功能的方法,应该是比较成熟的,因为国外有好多文献,包括一些高影响向因子期刊文献,都是采用这种方法!所以对此方法,请勿质疑!但细胞试验毕竟是体外实验,不一定能正真反应出该基因在体内真是情况!

2.关于细胞抗性的理解,好多战友有个误区,以为只要加入一定浓度的筛选药物后细胞没有死亡,即为抗性!其实是不全面的!我理解:正常的某种系细胞,它本身可能对筛选药物具有一定的抵抗作用,但不应盲目的称此为抗性!而所谓的抗性应该是对这些正常细胞预实验后,选择一定的合适浓度,致绝大部分细胞死亡,而后用此浓度筛选出的细胞,如果存活,才可能具有正真的抗性。这也是稳定筛选细胞系的基本原理!

3.稳定筛选后的单细胞克隆表达的目的基因,其含量不一定具有一致性!毕竟涉及到基因转录、表达的相关调控因素很多!所以有学者对目的基因功能的研究,往往选择3个或更多的单克隆,最后在统计学数据的参考下,得出目的基因的相关功能,如果结果不错,可以发表到质量高一点的杂志,而差一些的杂志中,相关的研究者往往选择了一两个克隆,缺乏强有力的说服力!因很早看过相关的文献,时间太长了,记不住那些了!如果感兴趣的话,楼主去查询一下!

4. 关于混合克隆研究基因功能的方法,也有相关文献报道,应该也有一定的研究意义!但这种方法,个人感觉,把许多目的基因表达量不同的单克隆混合一起,重复性可能差一些,而且说服力有限!

5.关于稳定克隆的形成和外源基因的表达对细胞的影响哪个大?我想应该没有人做过相关的实验,无非对此做一些相关的理论性探讨!!毕竟其中涉及的机制很复杂,而这两种比较不知有大的意义?当然这仅属个人观点!
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fei1226com[使用道具]
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稳定筛选细胞系:
1.在稳定筛选细胞系之前,用牌对数期生长的细胞作抗性耐受浓度的确定(注意:在培养过程中及时换液),通常情况下是用比细胞经7天全部死亡低那个的浓度作为筛选浓度。
2.在稳定筛选细胞系时,我通常是用选定筛选浓度培养两次后,再用比它高的那个浓度培养1
~2天,换回筛选浓度,经过传代后,可用比筛选浓度稍低的浓度维持。
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milkdog[使用道具]
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个人认为,外在环境对细胞施加的压力比外源基因的表达对细胞的影响更大些,因为不同的培养环境会影响细胞不同基因的表达及相应的表达量。如果细胞一段时间不加抗性培养,细胞的外源基因就可能丢失。
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