加州大学Davis分校的研究人员将使用这种单分子实时技术,对包括沙门氏菌、弯曲杆菌、大肠杆菌、弧菌和李斯特菌在内的一千多种致病菌样本进行基因组测序,以探明这些致病菌的表观基因组。“长读长、高度一致的精确性、以及对GC含量或基因组序列无测序偏好,这些特点使SMRT测序技术能够以无预先假设(hypothesis-free)无偏向性的方式构建完成基因组,”PacBio公司CSO Jonas Korlach在声明中称。
新一代测序虽然速度快产量高,但固有的短读长和偏向性使得过往微生物de novo 测序结果出现许多难以填补的“洞”(空缺),得不到完整的基因组序列。近期发表的研究显示,PacBio公司SMRT测序生成的长读长能够有效进行细菌基因组和表观基因组分析,包括对德国大肠杆菌疫情和海地霍乱菌株的遗传学分析。