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标题: 【求助】关于抗体分子量问题 [打印本页]

作者: queen    时间: 2013-5-13 15:44     标题: 【求助】关于抗体分子量问题

如果相同来源的同一个抗体,例如都是抗人CK19,同样是单抗或多抗,是否分子量越大,说明抗体纯度越低呢??
作者: shenkunjie    时间: 2013-5-13 15:52



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如果相同来源的同一个抗体,例如都是抗人CK19,同样是单抗或多抗,是否分子量越大,说明抗体纯度越低呢??

WB的分子量?分子量 好像和抗体纯度没有多大关系吧,有些抗体组分很单一的也可能会有交叉反应,因为抗体识别的表位可能会和其他蛋白交叉
作者: queen    时间: 2013-5-13 15:53



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WB的分子量?分子量 好像和抗体纯度没有多大关系吧,有些抗体组分很单一的也可能会有交叉反应,因为抗体识别的表位可能会和其他蛋白交叉

谢谢您的回复。那分子量与什么有关呢?为什么不同牌子的抗体分子量不一样呢??(同种属,同抗体)
作者: shenkunjie    时间: 2013-5-13 15:53



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谢谢您的回复。那分子量与什么有关呢?为什么不同牌子的抗体分子量不一样呢??(同种属,同抗体)

不同公司的抗体的表位不一样,分子量你可以参考文献或者理论分子量,一般翻译后修饰会分子量变化,如果同一个膜上面做出来不一样,那就比较麻烦,你可以具体把两个公司的抗体链接发上来看看
作者: queen    时间: 2013-5-13 15:54

不同公司的抗体的表位不一样,分子量你可以参考文献或者理论分子量,一般翻译后修饰会分子量变化,如果同一个膜上面做出来不一样,那就比较麻烦,你可以具体把两个公司的抗体链接发上来看看

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大概原因如下,是ABCAM总结的,但这么说的话,只知道predicted molecular weight实际条带位置会出现在哪里是无从得知的。。
作者: queen    时间: 2013-5-13 15:54

不同公司的抗体的表位不一样,分子量你可以参考文献或者理论分子量,一般翻译后修饰会分子量变化,如果同一个膜上面做出来不一样,那就比较麻烦,你可以具体把两个公司的抗体链接发上来看看

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图不能正常显示,复制一个:

Why is the actual band size different from the predicted?

Western blotting is a technique that separates proteins based on size - in general, the smaller the protein the faster it migrates through the gel. However, migration is also affected by other factors and so the actual band size observed may differ from that predicted. Common factors include...

post-translational modification - e.g. phosphorylation, glycosylation etc which increases the size of the protein
post-translation cleavage - e.g. many proteins are synthesized as pro-proteins, and then cleaved to give the active form, e.g. pro-caspases
splice variants - alternative splicing may create different sized proteins from the same gene
relative charge - the composition of amino acids (charged vs non-charged)
multimers - e.g. dimerisation of a protein. This is usually prevented in reducing conditions, although strong interactions can result in the appearance of higher bands

作者: queen    时间: 2013-5-13 15:55

不同公司的抗体的表位不一样,分子量你可以参考文献或者理论分子量,一般翻译后修饰会分子量变化,如果同一个膜上面做出来不一样,那就比较麻烦,你可以具体把两个公司的抗体链接发上来看看

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只有预测值时该如何得知条带位置,求高手指教!!(我的蛋白预测值是270KD)
作者: shenkunjie    时间: 2013-5-13 15:55

图不能正常显示,复制一个:

Why is the actual band size different from the predicted?

Western blotting is a technique that separates proteins based on size - in general, the smaller the protein the faster it migrates through the gel. However, migration is also affected by other factors and so the actual band size observed may differ from that predicted. Common factors include...

post-translational modification - e.g. phosphorylation, glycosylation etc which increases the size of the protein
post-translation cleavage - e.g. many proteins are synthesized as pro-proteins, and then cleaved to give the active form, e.g. pro-caspases
splice variants - alternative splicing may create different sized proteins from the same gene
relative charge - the composition of amino acids (charged vs non-charged)
multimers - e.g. dimerisation of a protein. This is usually prevented in reducing conditions, although strong interactions can result in the appearance of higher bands

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这个应该是abcam网站的吧?你把两个不同公司的产品链接发上来
作者: queen    时间: 2013-5-13 15:57

这个应该是abcam网站的吧?你把两个不同公司的产品链接发上来

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CST:

Specificity / Sensitivity

Notch1 (D1E11) XP® Rabbit mAb detects endogenous levels of total Notch1 protein. It recognizes both the full-length (~300 kDa) and the transmembrane/intracellular region NTM (~120 kDa).

Source / Purification

Monoclonal antibody is produced by immunizing animals with a synthetic peptide corresponding to residues surrounding Pro2438 of human Notch1.

来源:cuturl('http://www.cellsignal.com/products/3608.html')

博奥森:predicted molecular weight: 270kDa
来源:cuturl('http://www.bioss.com.cn/prolook_03.asp?id=1219')

作者: shenkunjie    时间: 2013-5-13 15:57

Monoclonal antibody is produced by immunizing animals with a synthetic peptide corresponding to residues surrounding Pro2438 of human Notch1.

来源:cuturl('http://www.cellsignal.com/products/3608.html')

博奥森:predicted molecular weight: 270kDa
来源:cuturl('http://www.bioss.com.cn/prolook_03.asp?id=1219')

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NOTCH1 CST的应该是cleaved的,博奥森自己都不知道自己的抗体做出来是多少,只是给了个理论分子量。没有任何参考意义。
作者: queen    时间: 2013-5-13 15:58

NOTCH1 CST的应该是cleaved的,博奥森自己都不知道自己的抗体做出来是多少,只是给了个理论分子量。没有任何参考意义。

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那如果需要用博奥森的抗体来做,请问做法应该如何呢?
作者: shenkunjie    时间: 2013-5-13 15:58



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NOTCH1 CST的应该是cleaved的,博奥森自己都不知道自己的抗体做出来是多少,只是给了个理论分子量。没有任何参考意义。

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那如果需要用博奥森的抗体来做,请问做法应该如何呢 ...

非得博奥森的?
作者: shenkunjie    时间: 2013-5-13 15:59



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非得博奥森的?

博奥森是现有的抗体,CST需要再买。。。
作者: shenkunjie    时间: 2013-5-13 15:59



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非得博奥森的?

用270?还是把整张膜都拿去孵育?整张曝光?

整张膜孵育曝光
作者: queen    时间: 2013-5-13 16:16



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用270?还是把整张膜都拿去孵育?整张曝光?

整张膜孵育曝光

那就算能曝出条带也没有说服力吧。。。
作者: shenkunjie    时间: 2013-5-13 16:17



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那就算能曝出条带也没有说服力吧。。。

先曝出来再说,呵呵
作者: popo520    时间: 2013-5-13 16:17


楼主是做WB?为什么需要关注抗体分子量?不是检测抗原来的吗?ABCAM总结的总结是指抗原吧?

作者: shenkunjie    时间: 2013-5-13 16:17



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楼主是做WB?为什么需要关注抗体分子量?不是检测抗原来的吗?ABCAM总结的总结是指抗原吧?

他指的也是抗原的分子量,可能表达造成你的误解了。
作者: queen    时间: 2013-5-13 16:18



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他指的也是抗原的分子量,可能表达造成你的误解了。

对,我关注的是抗原分子量。
作者: shenkunjie    时间: 2013-5-13 16:21



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对,我关注的是抗原分子量。

galaxy notch1 做出来了么?
作者: queen    时间: 2013-5-13 16:22



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galaxy notch1 做出来了么?

还没呢。。。这次曝的抗体有点多,而且分子量集中在37~68,剪膜的时候可能把其中一个条带剪掉了。。。欲哭无泪。。。下次分开跑。。。这次本来要分两块胶,但其中一块制胶漏很多,所以挤在一块跑。。。




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