标题:
【求助】纯化his-tag蛋白的镍柱可以永久性再生吗
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作者:
小游abc
时间:
2013-6-8 16:23
标题:
【求助】纯化his-tag蛋白的镍柱可以永久性再生吗
纯化his-tag蛋白的镍柱可以永久性再生吗?如果不能够,大概能够用多少次呢?
几丁质层析柱大家都是用5次就重新换填料吗?
作者:
tie8
时间:
2013-6-8 16:23
任何纯化填料都不可能永久再生。使用次数与柱的种类、你的样品原料性质、再生方法、操作细节习惯以及纯化的要求相关,没有确定的说法。但可以肯定的是,IDA类型的镍柱(如Chelating Sepharose FF)是比较耐用的,注意再生操作的话用个100-200次没有问题。NTA类型的镍柱在使用还原剂的条件下,镍脱落较多,再生后不能达到初始效果,使用次数要少很多很多。
作者:
49888
时间:
2013-6-8 16:24
现在的Ni-NTA柱子都很便宜,不用太在意的。
作者:
9900
时间:
2013-6-8 16:26
NTA螯合四价,IDA螯合三价,NTA的稳定性要更好一些吧。
作者:
04906
时间:
2013-6-8 16:28
现在的Ni-NTA柱子都很便宜,不用太在意的。
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是的,现在的柱子都不贵。要拿到好的结果,完全不用太在意。
作者:
04906
时间:
2013-6-8 16:29
NTA螯合四价,IDA螯合三价,NTA的稳定性要更好一些吧。
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IDA不能用还原剂,NTA可以用还原剂,我说的是在用还原剂条件下的NTA和不用还原剂的IDA比较。IDA可以很方便的脱镍再生,NTA不可以。NTA脱镍后再挂镍就不耐还原剂了,NTA生产商是怎么做到挂镍后耐还原剂的,没人说。我们的版助是做填料的大师,如果不是涉及到商业秘密他早就告诉大家了。
作者:
小游abc
时间:
2013-6-8 16:29
填料很贵啊。几丁质珠填料(279元/10ml)只能够提5次蛋白;而25ml NI-NTA都在2600元以上。
作者:
remenb
时间:
2013-6-8 16:30
NTA的可以照分子克隆上的去再生,效果挺好,当然肯定不会是永久性的, 不过这样可以用不少次,当然得到好的实验结果更重要,改换新的就换新的。
作者:
summerxx
时间:
2013-6-8 16:30
填料很贵啊。几丁质珠填料(279元/10ml)只能够提5次蛋白;而25ml NI-NTA都在2600元以上。
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Ni-NTA的柱子GE的预装柱HisTrap FF 1 mlX5也就$130,我一年多用了两个,效果还非常好的。
Chitin的填料没用过。
作者:
131415
时间:
2013-6-8 16:31
IDA不能用还原剂,NTA可以用还原剂,我说的是在用还原剂条件下的NTA和不用还原剂的IDA比较。IDA可以很方便的脱镍再生,NTA不可以。NTA脱镍后再挂镍就不耐还原剂了,NTA生产商是怎么做到挂镍后耐还原剂的,没人说。我们的版助是做填料的大师,如果不是涉及到商业秘密他早就告诉大家了。
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请问如果两者都是在不用还原剂的条件下哪个更稳定呢?谢谢
作者:
zhezhe
时间:
2013-6-8 16:31
请问如果两者都是在不用还原剂的条件下哪个更稳定呢?谢谢
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毫无疑问,无论是理论上还是实践上,在鳌合镍方面都是NTA比IDA稳定。而且很多时候NTA纯化的效果都比IDA要好一些。
但是如果都不用还原剂的话,我肯定是选择IDA,而不是NTA。
原因有三个方面
1、价格,相差有3-4倍吧。
2、再生性能,IDA柱反复再生个几百次都没问题。
3、载量,可能有成倍的差异。
作者:
9900
时间:
2013-6-8 16:32
IDA柱耐还原剂及特异性完全可换成钴离子改善,这时候多大浓度的还原剂都不成问题.
作者:
小游abc
时间:
2013-6-8 16:33
呵呵,楼上大师出手了。
钴离子我试过一次,但是完全不成功。我把我的程序讲一讲,还请韦兄指点。
1、填料chelating Sepharose FF, GE,国产16/20柱,20ml装胶量,多次使用过旧胶,20%乙醇保存,AKTA explorer 100。
2、水洗:去离子水洗大于5个柱体积
3、脱镍:50mM EDTA.2Na水溶液,至柱完全变白,电导和pH稳定
4、水洗:去离子水洗至电导近为0ms/cn,pH稳定
5、再生:0.5N NaOH洗柱至紫外280、260均回归基线
6、水洗:去离子水洗至电导近为0ms/cn,pH基本在中性偏碱
7、挂钴离子:100mM CoCl2水溶液,大于5个柱体积
8、水洗:去离子水洗至电导近为0ms/cn,pH基本在5-6
9、平衡:pH8.0,20mMPB,0.5NNaCl,40mM咪唑至柱完全变颜色,紫外280小峰过,电导和pH与bypass缓冲液完全相同
10、还原:新配制1mM DTT加平衡缓冲液,溶液一进入柱中,填料立即变色,流出液有钴离子沉淀及深色
11、拆柱,烧杯倒出填料,加20乙醇,4度放置,大约有4-5个月了,还是深深的钴离子沉淀颜色
这个程序基本是按说明书做的,只是常用的硫酸镍改成了氯化钴,再就是加了DTT。
不知道问题出在哪儿,请韦兄指点一下,为什么我用钴离子也是不耐还原剂的?
作者:
star#room
时间:
2013-6-8 16:33
我也不是大师,钴离子我记得用的是硫酸钴,是粉色的,理论上钴离子已经是最低价,不会被还原的,我记得曾经用巯基乙醇和半胱氨酸试过,当时没怎么调pH,你可用巯基乙醇试试,此外pH调到7点多试试.此外所用填料是我们自己的镍琼脂糖凝胶,进口的我没试过.可参考下面的文件,说明书上写30mM巯基乙醇内没问题,大多样品浓度用5mM左右应该足够,毕竟蛋白浓度没那么高,不需要太大浓度的还原剂.
理论上来说镍柱如果合成的对,那配基是不会脱落的,镍离子就可以反复固定,其实填料有时配基脱落是填料本身设计时化学键不牢固造成的,这样通常按说明书做可延长寿命,另外主要是杂质包裹导致失效,可再生能恢复,还有一种情况是填料本身如琼脂糖凝胶分解或断裂导致失效.的确IDA三百次左右是完全没问题的,但是需要有效清洗.而特异性可通过洗脱和改变吸附条件一样能达到NTA的效果,此外NTA理论上也不会不能反复用,只是再生没解决好而已.通常情况下个人觉得IDA已经足够,如果需要特异性好点,那就牺牲载量,这样作用力弱,对一些本身作用力弱的蛋白可能会挂不上.所以可把IDA上挂钴离子,这样作用力弱了,背景会更干净,但是载量是肯定会下降的.
作者:
utt0989
时间:
2013-6-8 16:34
硫酸钴还是CoCl2,我买过,很容易潮解和“冒烟”
至今被我冷落在哪个不知名的实验台柜子的底层了
作者:
小游abc
时间:
2013-6-8 16:34
但从产品说明上看clontech的介质也是NTA类型的,与这里讨论的IDA耐还原剂问题有差别。是否IDA挂上Co离子就可以耐还原剂仍然是个谜。我做失败了,chromatography做成功过,唉,不知我的程序错在哪儿。
作者:
小游abc
时间:
2013-6-8 16:34
上面一个图是clontech的,下面一个图是qiagen的Ni-NTA,配基作用相同。
作者:
bluelake
时间:
2013-6-8 16:35
clontech的介质不是NTA类型的,是CM-ASP类型的。和NTA一样都是螯合四价的。CM-ASP比NTA具有更好的特异性,基本没有非特异性的吸附。
最近,clontech还推出了IDA的树脂。结合能力达到惊人的60mg/ml,名字就叫作His60 Ni Superflow。
其实,clontech的介质要比NTA便宜15%左右!
大家不妨关注一下。
cuturl('http://www.clontech.com/products/detail.asp?product_family_id=1424&product_group_id=1459&product_id=212698')
作者:
memory
时间:
2013-6-8 16:35
QUOTE:
原帖由
bluelake
于 2013-6-8 16:35 发表
bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '
%s
')
clontech的介质不是NTA类型的,是CM-ASP类型的。和NTA一样都是螯合四价的。CM-ASP比NTA具有更好的特异性,基本没有非特异性的吸附。
最近,clontech还推出了IDA的树脂。结合能力达到惊人的60mg/ml,名字就叫作His60 Ni Supe ...
个人觉得都是四价螯合,所以CM-ASP类型和NTA没本质区别.而60mg/ml这不难达到,只是个别蛋白或动态吸附载量.有时间我再做钴离子的试试,详细情况到时候告诉大家,CM-ASP类型的不是很难合成.钴离子的理论上在IDA上应该也不容易被还原,至少我做的是这样.
作者:
小游abc
时间:
2013-6-8 16:36
QUOTE:
原帖由
bluelake
于 2013-6-8 16:35 发表
bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '
%s
')
clontech的介质不是NTA类型的,是CM-ASP类型的。和NTA一样都是螯合四价的。CM-ASP比NTA具有更好的特异性,基本没有非特异性的吸附。
最近,clontech还推出了IDA的树脂。结合能力达到惊人的60mg/ml,名字就叫作His60 Ni Supe ...
多谢指点。当时比较了一下两者鳌合镍的方式,都是三个羧基一个N原子,就认为是相同的,鲁莽了。二者在其中一个羧基的位置上有差异。
但这些都不能解释IDA与还原剂是否兼容的问题。
作者:
zwsyrt
时间:
2013-6-8 16:36
关于还原剂是否兼容的问题,我的观点:
1.钴和镍肯定会被还原的,或多或少,还要看还原剂的类型和浓度。
2.做一次纯化,发现介质没有变色就断定兼容是不科学的。怎么得有浓度的梯度试验,再加上时间的试验吧。
3.能纯化出来就可以了吧,一定要争出是否兼容没啥意义。退一步讲,介质被还原了,但是蛋白已经纯化出来了,那目的不也达到了吗。
作为抛砖引玉吧。
作者:
idoww
时间:
2013-6-8 16:37
非特异性吸附的多少,一方面取决于填料本身,第二方面更重要的是纯化的方法,很多时候想在binding中加还原剂,也是希望能将一些2硫键打开,减少非特异性吸附,我们最近在试验对比一些IDA和NTA填料,在非特异性方面IDA做的也完全可以象NTA一样,而载量上NTA就输的多了。我个人觉得还原剂,能不加,还是尽量不加。
作者:
rxcc33
时间:
2013-6-8 16:37
还原剂DTT是可以还原镍和钴离子的,会将镍还原为棕色,钴还原为蓝色。
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