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标题: 【讨论帖】关于蛋白质组学“idea”方面的问题 [打印本页]

作者: NBA 时间: 2013-8-5 18:02 标题: 【讨论帖】关于蛋白质组学“idea”方面的问题

目前，蛋白质组学的工作在做完质普之后，分析蛋白质在细胞内的功能，以及建立一系列的蛋白质表达信号网络都需要做哪方面的工作？请各位大虾指点！

作者: ukonptp 时间: 2013-8-5 18:03

个人觉得，蛋白质组学后续的研究很多。但是很多实验室目前只是集中在蛋白质组学研究本身，并没有考虑到相关蛋白的真正功能。尤其是差异蛋白质组学研究，找到相关的差异蛋白，要弄清这些个蛋白的功能，并不是一件易事。
但是，如果真的能找到相关起作用的蛋白，应该集中研究如何让这些蛋白从理论走向应用。缺少了应用，研究也就失去了价值。

作者: yes4 时间: 2013-8-5 18:04

已知的蛋白质功能还能从数据库里查到相关的功能，但是未知的蛋白呢？功能该如何去研究呢？关键是蛋白不是一个两个，作为组学，有很多蛋白，不知道有没有什么批量的研究方法！
期望大家参与讨论并得到解答！

作者: wsll 时间: 2013-8-5 18:05

如果选一测序的材料可能就不存在这些问题了

作者: ukonptp 时间: 2013-8-5 18:06

已知的蛋白质功能还能从数据库里查到相关的功能，但是未知的蛋白呢？功能该如何去研究呢？关键是蛋白不是一个两个，作为组学，有很多蛋白，不知道有没有什么批量的研究方法！
期望大家参与讨论并得到解答！
批量去研究蛋白的功能可能很难实现。
所以，相关的研究工作不是某一个人或某一个实验室能做完的。需要全球的合作，呵呵

作者: cocacola 时间: 2013-8-5 18:07

菜鸟随便说两句：这一问题应该包含在蛋白质芯片和蛋白质功能组学中。实验需要用到功能型蛋白质芯片。它与用于表达谱研究的结构型芯片不同，功能芯片可用于蛋白质特性研究，包括结合能力、复合物的形成能力、生化功能。

作者: 大脑门儿儿 时间: 2013-8-5 18:07

我也认为应该讨论这个问题，现在找到差异蛋白后，做实时定量PCR怎样？必要行如何？

作者: NBA 时间: 2013-8-5 18:09

做real time不错，可以分析基因水平的表达，从而更好地确定蛋白质的差异

作者: 33号 时间: 2013-8-5 18:10

感觉大家吵吵闹闹地要作蛋白质组分析, 可是, 好多都是跑胶, 质谱/测序, 完了以后就傻眼了, 不知道怎么分析了. 蛋白质组分析需要很厚的功底, 融会贯通, 不简单. 我以前想得太理想化了, 现在只能一步一步走了

作者: ritou1985 时间: 2013-8-5 18:11

对哦，就想问问大家，找到差异蛋白之后测序完了以后干吗？

作者: summerxx 时间: 2013-8-5 18:12

做差异蛋白质组学关键是材料要设计好,不然后续的验证会很麻烦的

作者: zwsyrt 时间: 2013-8-5 18:13

做差异蛋白质组学关键是材料要设计好,不然后续的验证会很麻烦的上面楼主说的很好啊！不错啊，方法越来越成熟，可是后续工作要做好才能真正说明问题．往往是测序鉴定完就没了有没有好的例子介绍一下啊

作者: avi317 时间: 2013-8-5 18:14

我刚实验室~ 听了几次组会就是觉得蛋白质组做的都是些基础工作网撒的很大但出来的东西还是很表浅给出了很多线索但后面就做不下去了高通量的东西一定程度上节约了人力物力但后续深入的工作涉及的东西很多还是要通过合作完成~

作者: xiaoxiaoniao 时间: 2013-8-5 18:15

我认为蛋白质组学后续工作应该找一些功能上比较特殊的蛋白，搞转基因研究

作者: bohe221 时间: 2013-8-5 18:15

总体感觉蛋白质组学目前入门容易，但是想要做出杰出的成果非常困难！进行完测序工作以后就是查文献，推测差异蛋白质的作用以及相互联系，而真正验证差异蛋白质功能非常困难，这个缺陷大大限制了目前蛋白质组学的发展。

作者: zhihui小新 时间: 2013-8-5 18:16

我的课题也是关于这个的,感觉前期的工作其实都很好解决,重点是后面的,胶跑出来了,分析是个难题,估计知识储备严重不够用的

作者: 911 时间: 2013-8-5 18:16

我做的是未知蛋白，因为我们的材料数据库没有完全测序的，质谱后很多为未知蛋白，我们的ideal是由一篇文章看到的，我们准备拿去测序，然后根据其中的N端氨基酸序列做RT-PCR，然后获得我们的特异表达目的基因，并探索其调控序列。我们是想找到调控序列的调控特点然后做应用的。我觉得这个方法还是可行的不知道大家有什么建议和看法

作者: uuooii 时间: 2013-8-5 18:17

对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研究在一定程度上有助于了解蛋白质的功能，Clontech的荧光蛋白表达系统就是研究蛋白质在细胞内定位的一个很好的工具。

作者: 2541 时间: 2013-8-5 18:17

不同培养条件——双向电泳——质谱——差异蛋白——1.已知蛋白：查询数据库，功能、代谢分析；2.未知蛋白：测序？细胞内定位？磷酸化研究？——？请大虾帮忙完善下蛋白质组学研究思路哈

作者: birdfish 时间: 2013-8-5 18:18

Before you do, you should know why you do that and what you want to get!

I give a example of myself. I am in a group which working on crystallography and cryo-EM. We see the virus particals and constracted the whole virus particals, especially the surface. After that, we need to study the protein on the surface. If it have 10 proteins, then try to identify all these proteins and solve its crystal structure, after that, build the molde in cryo-EM structure. I mean, you know, we can not do all the proteins even we can determine all the genes. Protein is much more complicated than gene. But before we really started to study proteinome, we should think about what we want to know,. If you just go and see, woo, it is very hard to draw some conclusions in this area.

作者: popo520 时间: 2013-8-5 18:18

筛选蛋白是很浪费时间的事，尤其是还要面对很多假阳性结果

作者: huifeng0516 时间: 2013-8-5 18:19

同意以上各楼的意见，学习了不少。要是科研没有明确的目标，就是在走大流！就导致了今天蛋白质组学的结局。蛋白功能和互作的研究还需要加强啊，希望高手指点阿！

作者: hulu呼噜 时间: 2013-8-5 18:19

很多都是在做细胞内可溶的蛋白~~~那么不溶的蛋白有什么好办法呢？

作者: zranqi_1 时间: 2013-8-5 18:19

是个好贴，大家积极讨论呵，不要沉了。质谱鉴定后面对一大堆上调、下调的蛋白点，除过根据功能和代谢进行分类，还能做些什么，有一篇发表在PROTEOMICS上的文章通过多个时间点的细胞蛋白组学分析研究了其动力学特征，即使用适当的聚类方法根据蛋白随时间变化的曲线对检测的蛋白进行了分类，得到细胞的protein kenetic profiling。不过这篇文章并没得出比较清晰、有意义的结论，最大的启发或许是对蛋白数据处理方式的尝试吧，可能这就是能发表在proteomics上的原因之一。

作者: nn255 时间: 2013-8-5 18:20

请问
蛋白质组学和结构生物学关系如何？

作者: NBA 时间: 2013-8-5 18:20

蛋白质组学和结构生物学有交叉，蛋白质组学的分析方法可以运用到结构生物学研究中去，利用双向电泳技术分离待研究的蛋白质，进而用结构生物学的方法分析其结构，在研究其结构与功能的关系，其乐无穷也！

作者: DDD 时间: 2013-8-5 18:20

我们做得是测序的细菌蛋白质组学

作者: yueban-1147 时间: 2013-8-5 18:21

目前已完成质谱鉴定，差异蛋白找到了，难道我就可以说出现差异蛋白就可能致病吗？如何才能明确存在差异蛋白的原因呢？

作者: avi317 时间: 2013-8-5 18:22

我做过所谓的蛋白质组学研究方向

做过所谓的蛋白质组学研究, 2-DE,MS,-PMF.数据库搜索.就完了我的收获是知道怎走这路线,但下面的分析及RT-PCR 我没作过,,,

作者: ROSE李 时间: 2013-8-5 18:23

做real time不错，可以分析基因水平的表达，从而更好地确定蛋白质的差异，这个方法在很多实验室都可以做，赞成！

作者: orangecake 时间: 2013-8-5 18:23

从组学角度研究蛋白，很大程度上依赖于仪器以及生物信息学的发展

作者: 分子式 时间: 2013-8-5 18:24

分离到了差异蛋白，再以后呢？再接着向下做，将会做什么呢？找到这个蛋白所对应的基因？那由蛋白分析反向推向基因最好的办法是什么呢？

作者: NBA 时间: 2013-8-5 18:24

两头延伸：一方面拿到蛋白所对应的基因，主要是设计引物，基因克隆，基因功能验证另一方面可以收集大量的蛋白质进行结构分析，作为一些药物设计的靶点

作者: gmjghh 时间: 2013-8-5 18:24

但RT后RNA的表达量和蛋白的表达量之间并不是所有的都存在直接的关系

作者: 大脑门儿儿 时间: 2013-8-5 18:25

“缺少了应用，研究也就失去了价值。”太对了，从小的理想就是做个科学家，可能目标太明确了，从没考虑过自己研究的东西有什么意义，当然文章或者论文中的创新点研究价值意义写了一大堆，但感觉那些好空，最近一直在思考，自己做的东西到底有没有意义，做些什么东西比较实在。

作者: 大脑门儿儿 时间: 2013-8-5 18:25

感觉大家吵吵闹闹地要作蛋白质组分析, 可是, 好多都是跑胶, 质谱/测序, 完了以后就傻眼了, 不知道怎么分析了. 蛋白质组分析需要很厚的功底, 融会贯通, 不简单. 我以前想得太理想化了, 现在只能一步一步走了

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非常同意你的观点，蛋白质组分析需要很厚的功底, 融会贯通。蛋白质不是那么容易研究清楚的，表达，调控，蛋白功能等等各个环节都很有内容。我们实验室有个博士，她没有从蛋白质组学做（找差异蛋白-。。。），而是先pcr了个功能基因（RNA片段），然后反转录，然后克隆到一个表达系（可能表达不是很准确，就是把DNA转录/转导到低等生物中，例如酵母），表达蛋白，把蛋白提取纯化复活，注射到实验动物中检查该蛋白是否实现原来PCR的基因的功能。感觉还有点意思。

作者: uaubc 时间: 2013-8-5 18:25

个人认为DIGE不错，可以研究蛋白质修饰的情况，有些蛋白做定量PCR并没什么差异的

作者: uaubc 时间: 2013-8-5 18:26

下一步研究的话，就该RNAi 登场了

作者: windy+++ 时间: 2013-8-5 18:26

一，从蛋白水平来验证差异蛋白，如免疫组化，western bioting等;
二，从分子水平验证差异蛋白如PCR ,souther,norther 等；但蛋白水平验证是比较可靠的

作者: tuomu45 时间: 2013-8-5 18:27

我也有同感，蛋白质质谱测序后，好像再没法继续做，现在大多研究也在这一步，有高人指点以下阿

作者: zranqi_1 时间: 2013-8-5 18:27

疾病蛋白质组学

请问：疾病蛋白质组学与一般的蛋白质组学在研究策略上有什么不同？

作者: NBA 时间: 2013-8-7 15:55

可以参考北京师范大学何大澄先生的研究方法，将疾病相关蛋白敲除，研究下面表达的差异蛋白，再将差异蛋白敲除，研究再下面的差异蛋白。。。 n+1的方法

作者: owanaka 时间: 2013-8-8 11:59

现在很多人做蛋白质组就是找差异，然后鉴定，往下很难继续。其实后续工作的意义、难度以及工作量要远远大于寻找、鉴定差异。

作者: ffooll 时间: 2013-8-8 12:39

蛋白质组学现在看来只能作为一种技术来被生命科学家应用而一个生命科学界的主流问题就是 illucidate the mechanism how alterations in genotype results in the veriation in phenotype, 换句话说，就是要做功能鉴定现在这个观点已经被广泛的接受最典型的例子就是现在纯做蛋白质组学方面的研究发不了点数太高的paper 单纯的分析基因表达量的多少或者蛋白质表达量的多少，实际上对于功能学研究起不了多大作用我现在的想法是能不能利用蛋白质组学进行一些信号通路方面的研究当然也包括其他分子生物学的研究手段结合在一起分析

作者: ffooll 时间: 2013-8-8 12:40

就是一些分子生物学和生物化学方面一些常用的敲定蛋白质基因功能的分析 Gene knock-out, knock down, 酵母双杂交, GST pulldown 等等

作者: qqq111 时间: 2013-8-8 12:41

个人觉得，蛋白质组学后续的研究很多。但是很多实验室目前只是集中在蛋白质组学研究本身，并没有考虑到相关蛋白的真正功能。尤其是差异蛋白质组学研究，找到相关的差异蛋白，要弄清这些个蛋白的功能，并不是一件易事。但是，如果真的能找到相关起作用的蛋白，应该集中研究如何让这些蛋白从理论走向应用。缺少了应用，研究也就失去了价值

作者: qqq111 时间: 2013-8-8 12:41

就是一些分子生物学和生物化学方面一些常用的敲定蛋白质基因功能的分析 Gene knock-out, knock down, 酵母双杂交, GST pulldown 等等

作者: yonger 时间: 2013-8-8 12:42

也在做蛋白质组学一头雾水不知道找出之后怎么研究即使是重要作用蛋白又如何应用

作者: 33号 时间: 2013-8-8 12:42

做转录组分析

作者: 66+77 时间: 2013-8-8 12:43

现在没办法却少后续的研究工作也是现在很多课题组的断层研究有的纯分子有的就纯蛋白

作者: star#room 时间: 2013-8-8 12:44

是的现在的研究多集中在找寻疾病的生物标志物用于疾病的诊断，但对于标志物为何是标志物及标志物蛋白质的功能结构研究比较少，个人感觉应该和细胞信号通路有密切联系。可以借助免疫学和生物信息学的方法来研究相关问题

作者: KGZ564 时间: 2013-8-8 12:44

可是我觉得入门也很难啊，对于HPLC和双向电泳的实验技巧很难掌握

作者: u234 时间: 2013-8-8 12:45

你好，我很需要知道大体的流程，请问你是做血液方面的吗

作者: zzzz 时间: 2013-8-8 12:46

蛋白质组分析需要很厚的功底, 融会贯通。蛋白质不是那么容易研究清楚的，表达，调控，蛋白功能等等各个环节都很有内容。我们实验室有个博士，她没有从蛋白质组学做（找差异蛋白-。。

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...
功能rna就是成熟的编码片断吗，她在低等动物中表达能保证蛋白后的修饰加工正确吗？还有把表达的蛋白直接注射入动物，它能到达发挥作用的位置又保证不被降解吗？而且它也不想蛋白质组学那样从总体上把握问题啊

作者: zzzz 时间: 2013-8-8 12:46

我认为对于未知蛋白的功能研究不可能仅仅依靠研究生期间短短几年就有结果的，而且在老板巨有钱的前提下，放任你花票子能有一个初步的端倪旧不错了无论是2-D还是其他的HPLC等等只能做为工具掌握，关键是目的性明确。总的感觉就是国人太好大喜功了，所谓的XX物种蛋白质组学研究，目前的技术水平根本就达不到，就像前面讲洋文的那位朋友说的很明确，把研究范围已经缩小到表抗了。这样只要经费足够，肯下功夫，出点成果还是有希望的。 2-D我也曾经做过，但目的性很明确，筛选蛋白酶。常规2-D电泳结合活性染色2-D电泳可以很方便的找到需要的dot，然后就是蛋白点测序，RT-PCR后将所需要的功能基因克隆到不同的表达体系，如大肠杆菌，甲醇酵母等。寻找最合适的生产体系。

作者: hulu呼噜 时间: 2013-8-8 12:46

我做了一段时间双向电泳，差异点送公司测了一部分，我是做免疫相关蛋白，找出一些上调，下调蛋白，不知道后续应该怎么做？

作者: jrwyyplt 时间: 2013-8-8 12:47

蛋白组的研究仅仅是科学研究领域里的一滴水，要看你想达到什么目的，选择性的用好蛋白组学里的研究方法！如我想研究杂交领域里胚胎细胞生物化学现象，希望用到蛋白组学里的研究方法，用蛋白的变化来阐述该植物胚性生化机理。

作者: youyou99 时间: 2013-8-8 12:48

质谱鉴定出来的蛋白很少,很多都死未命名蛋白,该如何处理

作者: cocacola 时间: 2013-8-8 12:48

看了您的回答，很感兴趣，不知是否可以向您请教您说的clontech技术，我是个初学者，想研究某个蛋白在细胞内的定位和作用。

作者: xiaoxiaoniao 时间: 2013-8-8 12:49

好像这个东西难度不是很大，意义是什么呢？生产抗体吗？不好意思我是个初学者

作者: guagua 时间: 2013-8-8 12:50

看了大家的帖子，我学习了很多的东西。不知道，这个处理方法可行不可行？当我们或得了差异蛋白质点以后，我们可以对其进行测序，并根据测序的结果，从而合成相关的引物，用该引物利用PCR技术，从而从总遗传物质中调取目的基因，这样的话，就可以将蛋白质和基因对应起来了，这样更有利与生物基因与蛋白质的研究。有可能的话，可以将基因转移到相关的模式生物上，从而检测相关蛋白质的功能。

作者: summerxx 时间: 2013-8-8 12:51

在蛋白组学研究手段上，发展可替代或补充双向凝胶电泳的新方法和新的生物质谱技术已成为蛋白质组研究技术最主要的目标。目前，二维色谱 (2D—Lc)、二维毛细管电泳 (2D-CE)、液相色谱一毛细管电泳 (Lc—cE)和二维色谱～串联质谱 (2D—HPLC／MS—MS)等新型分离和鉴定技术都有补充和取代双向凝胶电泳之势；开发新的质谱技术，可以在不需要对蛋白质混合物进行分离的前提下，直接分析和鉴定全蛋白质组样品。相信在不久的未来，高通量、高精度和自动化的蛋白质相互作用检测技术将会出现！

作者: www.1 时间: 2013-8-8 12:52

未知功能的蛋白怎样去验证它的功能呢？尤其是在预测的活性检测不到之后，应该怎么做呢？

作者: INK 时间: 2013-8-8 12:53

。个人觉得，蛋白质组学后续的研究很多。但是很多实验室目前只是集中在蛋白质组学研究本身，并没有考虑到相关蛋白的真正功能。尤其是差异蛋白质组学研究，找到相关的差异蛋白，要弄清这些个蛋白的功能，并不 ...

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同意这个观点，我的理解是蛋白质组学只是一个提供研究目标的工具，真正要解决实际的生物问题还是通过基因及其功能研究来完成，蛋白质组学只是为你提供潜在的研究目标

作者: DONT 时间: 2013-8-8 12:53

主要是研究这个蛋白质的功能，而蛋白质相互作用的关系网络又十分复杂，还有蛋白质的一些修饰等，对于某一个特定PRO的研究最终还是要放到一个整体中去的，像一些信号传递的通路，这些机制是相当复杂的。

作者: DONT 时间: 2013-8-8 12:54

谁有关于microarray的教程?

作者: viviwang1987 时间: 2013-8-8 12:55

我是新手，不太懂这个怎么找到差异蛋白？

作者: qianqin1977 时间: 2013-8-8 12:56

已知的蛋白质功能还能从数据库里查到相关的功能，但是未知的蛋白呢？功能该如何去研究呢？关键是蛋白不是一个两个，作为组学，有很多蛋白，不知道有没有什么批量的研究方法！期望大家参与讨论并得到解答！批量去研究蛋白的功能可能很难实现。所以，相关的研究工作不是某一个人或某一个实验室能做完的。需要全球的合作，呵呵

作者: lixi559 时间: 2013-8-8 12:56

可以研究下蛋白的时间和空间的表达差异性，以及蛋白与其他分子间的作用如RNA，DNA，另外还可以从蛋白网络的拓扑结构出发，发现新的特性，个人意见

作者: zhihui小新 时间: 2013-8-8 12:59

我觉得研究idea需要看具体的实验要求，像我的实验就是找到差异蛋白，然后回到上游也就是基因去做更深入的研究。我觉得往下游去做是为寻求未知蛋白的必然趋势，虽然难了些，但又句话说得好：“有困难要上，没有困难创造困难也要上嘛！”

作者: am10 时间: 2013-8-8 13:00

应用iTRAQ技术进行定量研究，在journal of proteome research 发表的一篇处理数据的文章题目：A Statistical Model for iTRAQ Data Analysis 给你提供新思路

作者: am10 时间: 2013-8-8 13:00

也可以应用酵母双杂交的技术鉴定差异蛋白的功能，进而联系基因的功能

作者: lgm 时间: 2013-8-8 13:00

我也是把蛋白质测序了以后就没有后续了。尤其是对那些现在还没有测序完基因组的生物来说，很多蛋白质可能前面搜索鉴定出来是某个蛋白质，等后来数据库越来越丰富了，到头来重新搜索一下，又把自己以前鉴定的结果给推翻了。真不知道真正的蛋白组学到底该怎么来做。请高手多指导，多引导。

作者: owanaka 时间: 2013-8-8 13:01

对于非模式物种，有时候MS结果实在是不敢恭维啊我打了近100个差一点重复了两次结果都好差啊郁闷啊

作者: BOSS2011 时间: 2013-8-8 13:01

个人还没有做过蛋白质组学方面的东西，但是导师的研究主要集中在这个方向，所以以后想走蛋白质组学这条路，我觉得蛋白质组学不应该是在鉴定结果出来后再去找差异点做分析，应该先确定研究对象然后有针对性的去比较差异，这样后面就比较容易了。

作者: jiushikeshui371 时间: 2013-8-8 13:01

2009年发表的一篇关于定向蛋白质组学（targeted proteomics）的文章，目前的质谱技术理论上可以从样品中鉴定所有的蛋白质，实际操作过程中并非是这样，因此就有专门研究低拷贝蛋白的定向蛋白质组学概念的提出。可以下载原文研究下.

作者: wmp1234 时间: 2013-8-8 13:02

未知的可以通过建模，找相似结构的蛋白，结构相似的话功能叶可能相似

作者: eric930 时间: 2013-8-8 13:02

请问这篇文章具体是哪篇，做大小鼠脑蛋白组学与一般的蛋白组学有什么差别呢，要注意什么呢？

作者: 49888 时间: 2013-8-8 13:03

学到很多，是否考虑其基因在不同时段不同组织的表达，在基因组和转录组上做一下

作者: lgm 时间: 2013-8-8 13:03

我现在郁闷了，鉴定了50个点，花了不少钱，可找出来的差异点给我的研究方向相差太远，想请教一下蛋白功能和亚细胞定位怎么分析，急用

作者: gogo 时间: 2013-8-8 13:04

对于新的蛋白：获取蛋白序列、核苷酸序列、表达特异性分析、体外功能分析、转基因功能鉴定

作者: 了了 时间: 2013-8-8 13:04

不知如何让这些差异蛋白从理论走向应用呢？有哪些应用呢？请教中。。。

作者: 了了 时间: 2013-8-8 13:05

“感觉大家吵吵闹闹地要作蛋白质组分析, 可是, 好多都是跑胶, 质谱/测序, 完了以后就傻眼了, 不知道怎么分析了. ”
只知道基因水平检测一下表达。我确实不知下一步该如何走了？。。。

作者: 了了 时间: 2013-8-8 13:05

我认为蛋白质组学后续工作应该找一些功能上比较特殊的蛋白，搞转基因研究

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能继续应用于转基因么？怎么应用呢？急！！！

作者: NBA 时间: 2013-8-8 13:05

目前从事生命科学产品的销售工作，如果大家对蛋白质组学这块的产品感兴趣的话，我可以提供GE（通用电气医疗集团）的，我负责天津地区，天津地区的朋友们可以直接找我，电话022-23526719。

作者: dongdongqiang 时间: 2013-8-8 13:06

这个我也不清楚啊，是不是做一些关键位点的氨基酸突变体就可以了呢？

作者: hyuu 时间: 2013-8-8 13:06

鉴定后要深入分析每一个蛋白的功能才行

作者: 49888 时间: 2013-8-8 13:07

对，我觉得就是在做完质谱后，在各个数据库中进行查找，但只能找到已知的蛋白，但还有好多未知的蛋白，在数据库中都找不到，所以有点损失。

作者: popo520 时间: 2013-8-8 13:40

我也是在做蛋白质组学，选的材料属于缺少关注的动物，质谱分析出来就更难找到对应的蛋白了。

作者: taoshengyijiu 时间: 2013-8-8 13:40

同问，在找出差异蛋白后，该怎么验证，做后续的分析，还有就是蛋白质组和表达谱的关联分析，各位有什么好的建议没

作者: vcve 时间: 2013-8-8 13:41

这个应该是做共定位免疫荧光之类的吧

作者: moonlight45 时间: 2013-8-8 13:42

你可以试一下blast2go这款软件要是做信号通路分析就更好了现在又很多软件 metacore等都是但是需要付费很麻烦

作者: ha111 时间: 2013-8-8 13:42

你们说的都很好
我觉得组学只是一个工具
我们更多的还是要依赖于分子生物学的研究手段
从组学再回到分子

作者: ROSE李 时间: 2013-8-8 13:43

我做的是未知蛋白，因为我们的材料数据库没有完全测序的，质谱后很多为未知蛋白，我们的ideal是由一篇文章看 ...

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感觉是好办法，可以试试，功能相似蛋白的表达调控方法可能也有联系，如果能在细胞基因组内找到蛋白翻译特异的基因，能活细胞观测其表达活动和细胞生活状态，找到之间的联系，是不是就会对未知蛋白的功能和分来更直观了

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