这两天灌胶又出了点小问题:下胶灌完后,压正丁醇,在水平的折光线上出现了弯弯曲曲的、薄薄的一小层胶,而且很不齐,为什么呀?以前从没有出现过这种情况。是扳子没有刷干净吗?我用清洁精刷了很多次,又用自来水冲净,再用去离子水冲,很干净了呀!这样会影响电泳吗?作者: NBA 时间: 2013-9-5 18:42
在Stacking gel (不加Temed 和 Aps)加8MUrea, 待溶解后,加Temed 和 Aps,即可。作者: NBA 时间: 2013-9-5 18:42
最近做GST融合蛋白的WB,我的蛋白表达量很低,加大了上样量,延长了时间,2.5h,转膜后染胶发现目的条带几乎还在,而其它部分都已转移,用的是GST多抗,结果只有GST对照有条带。这是怎么回事?我第一次是用我目的条带的单抗做的,发现也是转不动,但最后有弱条带出现。是转膜有问题吗?作者: NBA 时间: 2013-9-6 16:15
可以干放,没有问题。作者: NBA 时间: 2013-9-6 16:16
1. 一般跑变性胶是要煮的,非变性胶不用煮。
2. 是否蛋白浓度太大,或是有其他什么成分在里面?应该是不会有沉淀的作者: NBA 时间: 2013-9-6 16:17
要想区分开膜蛋白和胞浆是比较困难的,一般是用密度梯度离心得到相应的膜蛋白,另一份再做膜蛋白和胞浆蛋白的混合物作者: NBA 时间: 2013-9-6 16:17
High yield electroblotting onto polyvinylidene difluoride membranes from polyacrylamide gels.
Mozdzanowski J, Hembach P, Speicher DW.
Optimal conditions of electroblotting that led to high protein recovery on polyvinylidene difluoride (PVDF) membranes were determined for sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). SDS concentrations in the gel and transfer buffer were found to be the most important factors affecting the amount of protein recovered on the PVDF membrane. The largest loss occurred during the first 10-30 min of transfer due to the relatively high initial SDS concentration in the gel. During this initial stage of transfer, most of the protein passed through the primary membrane and was partially retained on secondary and tertiary membranes. The value of presoaking gels prior to transfer to reduce the amount of SDS was evaluated by quantitating free SDS densitometrically and by correlating the reduced SDS concentration with increased electroblotting efficiency from presoaked gels. Transfer time was evaluated and no "overtransfer" was found even after very long transfer times. These results clearly indicate that proteins electroblotted onto PVDF membranes were tightly bound and could not be released by extending the transfer time. The effects of methanol and SDS concentrations on protein adsorption from solution to PVDF were also determined quantitatively. The results of this study strongly suggest that proteins fully saturated with SDS cannot bind efficiently to PVDF membranes. Since SDS is necessary for high protein mobility, the challenge in efficient electroblotting is to maintain an optimal SDS concentration which is high enough to permit effective removal from the gel and low enough to permit effective binding to the PVDF membrane. For 1.5 mm thick gels containing 0.2% SDS, presoaking the gel for 15-20 min in transfer buffer with 10% methanol prior to electroblotting provided the best recovery on the primary membrane.作者: NBA 时间: 2013-9-6 17:02
最近我在做Western,但结果一直不理想,出来的只是浅浅的带,甚至现在什么条带也没有了!我每次转膜后都用了立春红染色,出现的蛋白条带还是很清晰,唯一的一点是在我需要的分子量附近并没有很清晰的条带出现,只是很模糊的多条带,是不是从这里就可以推断出我的结果就会不理想!郁闷中,请您指教!!!!!谢谢您作者: NBA 时间: 2013-9-6 17:08
“我想请教一下细胞裂解液选择蛋白酶抑制剂时有什么原则吗?
受不受组织来源的影响?胞膜和胞浆有区别吗?”
一般来说提取时加入光谱的蛋白酶抑制剂就可以了,操作时保持低温。
除非有文献特别指明用特殊的方法,一般来说都没有区别。 作者: NBA 时间: 2013-9-6 17:09
你可以适当加大一抗浓度,增大蛋白上样量。更有效的办法是采用酶标三抗,可以放大抗原抗体结合效应。
你的蛋白分子量多大?如果<30kd的话,电流肯定大了。作者: one 时间: 2013-9-9 13:22
怎么我连marker都转不上呢?我用的是BIO-RAD公司的半干转印仪。公司推荐的条件:
mini-gel 10v for 30minutes or 15v for 15 minutes.
large ge 25v for 30minutes or 15v for 60 minutes.
而且讲:
do not exceed 25v and 3mA/cm2 current for large gels or 5.5 mA/cm2 for mini gels
1,加甲醇起着一定的固定作用,因为小分子蛋白质容易转出去.(特别是在硝酸纤维素膜上,因为NC膜结合蛋白质的能力较弱)
2,是tween,配方如下:Tris-Buffered Saline Tween-20 (TBST)
Dissolve 8.8 g of NaCl, 0.2g of KCl, and 3g of Tris base in 800ml of distilled H2O.
Add 500ul of Tween-20
Adjust the pH to 7.4 with HCl.
Add distilled H2O to 1L.
Sterilize by autoclaving.
我是做western blot 的新手,迫切的想知道从人组织中提取IL-6的western blot 跑出的带子应该出现在什么地方,它是糖蛋白,分子量大概是26kD,是不是就应该在26kD处?可我做了很多次(至少15次),在26KD处没有带,但每次都在60处有很明显的带,这是为什么?我现在很着急,不知道该如何办?求各位老师帮帮我。作者: 66小飞侠 时间: 2013-9-9 16:40
求助!!我的western方法按《蛋白质方法》,一抗1:5000,1:2500,1:2000,都无条带,换成1:1000,4度过夜,有条带可背景很高,煮膜后用此旧一抗,4度8小时,二抗也是旧的,多洗了1次,10分钟,却只剩下背景,条带完全看不到了!!是一抗还是二抗的非特异结合太高了呢?还是抗体只能用新的??一抗很贵的,都快被我用完了……哭作者: NBA 时间: 2013-9-9 16:41
经常麻烦,很过意不去,我的6KD蛋白的WB一直作不出,快晕掉了! 作者: NBA 时间: 2013-9-9 16:51
我给你发过帖子,(可能是你,也是一个要做6kd蛋白的Wb, )我个人觉得做出来的可能性很小,
你实在要试可以改进:
1. 用0.2um的膜
2. 用30%gel
3. transfer buffer 不加SDS或减为原来的25%, 加30%甲醇
4. 转移时间用 半干(0.2 mA / cm2, 2mins- 10mins)作者: 研究僧112 时间: 2013-9-9 16:52 标题: 回复 #455 NBA 的帖子
多谢!我已经用的是0.2的PVDF membrane,分离胶用16.5%,由40%丙稀酰胺(37.5:1)灌制,现在我的电泳这步是成功,问题出在转膜,我们的转膜液配方是:Tris-base 3.03 g
甘氨酸 14.4 g
methanol 150 ml
ddwater to 1000 ml
因为用的PVDF膜,所以红宝书上说含15%甲醇,NC膜含20%甲醇,那么将甲醇加到30%的目的是否是增加对蛋白的固定和膜的正电荷,利于对小分子蛋白的吸附?作者: 8princess8 时间: 2013-9-9 16:53
Thank you very much !
如果用普通滤纸,湿式转移时应用几层,因为我看到前边有人推荐半干转移时用了3层。
您推荐的电压与我原来用的相比有很大差别,原来是用100V,湿转2小时(用冰降温),而且没有考虑过分子量大小,因为我总共也就做了3次,这个时间对小分子来讲,会不会转过?而对170Kd来说,转移时间可能不够?
170kd您推荐使用48V,10hrs-16hrs,常温?还是要采取降温措施,或塞到冰箱里去?
再问一个菜鸟级的问题,我们用的是硝纤膜,转移前应该常温预平衡,还是低温?
企盼回复! 作者: NBA 时间: 2013-9-9 17:20 标题: 回复 #479 kuohao17 的帖子
thank you for your such many answers for the newcomers. And I have some problemswhich I could not found the answer in here.
I am doing the WB with the cell samples. Before you said may be we can use the loading buffer to get the protein from cell, I just want to know what is the loading beffer?Now my protocol is that wash the cell after procedure with PBS once and overlay it ith 2mMEDTA/PBS(-) , incubate 5 min on ice and scrape into the collection tube, centrifuge and discard the supernatant ,then add one kind of lysis buffer into the cell pellet to get total protein samples from total cell. The problem is that I check and found the cells were already
damaged after scrape before adding lysis buffer, so I am worry about if in here the cells were already damaged ,and after centrifuge the protein in
cytoplasma would be lost , so the protein I got finally can not be said total protein, and may be just can be said as total protein in nuclear.But I need the total protein from total cell!
Can you understand my problem?作者: dongdongqiang 时间: 2013-9-10 08:41
我的抗体是用细胞粗提物做的抗原,做了个Western,只有针对其他蛋白的非特异性的条带出现。我的目的条带,15KD,却没有出现。想请问会不会是我的抗体有问题?作者: NBA 时间: 2013-9-10 08:42
I list a new protorol . You can try it, may be it is useful .
1, washing the cell by iced pbs, more than 6 times , 2mins per times.
2, add 5x stop buffer (10000000 cells add 0.4-0.8ml ), let it cover the cell s , incubate 5-10 mins on the ice.
3, scrape lysis into collection tube.
4, sonicate ( damaged the DNA)
5, centrifuge and discard the pellet .
6, collect the supernatant .
5x stop buffer
20% Glycerol
10% sds
250 mM tris-base
PH=6.7作者: NBA 时间: 2013-9-10 10:37
Check the iron concentration in your samples. Generally if the iron concentration is too high, it can cause the result as you were saying.作者: orangecake 时间: 2013-9-10 13:35
那如何check和adjust iron concentration呢?作者: hold住 时间: 2013-9-10 13:36
请问ptglab高手:
公司里提供的一抗抗体有几种,有的只适于做WESTERN,有的只适于做免疫组化,而有的两者都适合。我现在手头上的一抗是适于做组化的,而且组化我也做出来了,但我想用它来做WESTERN,试了几次都没有作出,阳性对照也没出来,不知是否抗体不适合,还是有其他什么原因,请予指点。作者: NBA 时间: 2013-9-10 13:37
你理解错了,或者是我没有表说清楚, 这里的 you shouldn't loading more than 0.3ug/mm2 for one well.
指的是每个单个的条带(或者说对某一个的蛋白,比方说Actin)的最大上样量不能超过0.3ug/mm2 ,否则这个蛋白的电泳条带就会变型。对于一次总蛋白的loading的量来说,15ug-30ug/mm2 ,是可以的,再多也就不行了作者: NBA 时间: 2013-9-10 13:37
Do you mean the size shows same? Did you set a Lane as negative control? What's the size difference between your fusion protein and GFP?作者: 8princess8 时间: 2013-9-10 13:47
1. Closely related. It appears that the trans-membrane is not good enough, most likely the transfer time is not long enough since smaller marker is transferred rather than bigger size marker. For a certain marker, since the MW is not too small, general-used membrane is fine for marker transfer. So in your case, elong the transfer time.
2. sure
3. Your transfer buffer, iron concentration, PH etc are factors to affect the transmembrane.作者: she 时间: 2013-9-10 13:48
There are two possibilities: one is as mentioned above, time is not long enough for the transmembrane; the other one is the marker. If this result shows again and again even you change the transmembrane time, you could probably consider the problem could be from the marker itself. You could try to ask for a marker from another company or lab to try it it happens again. Generally, small protein can't pass through the membrane if the size is not dramatically small (I can't remember the size number). For maker it is fine. THink about it, even small marker can stay on membrane, it is no possiblity that the bigger marker passing through, isn't it?作者: 8princess8 时间: 2013-9-10 13:50
Several steps can give you clues. Did you use pre-stained marker? After you transfer, can you see marker on the membrane or on the gel? Did you use HPR-coupled marker, after you do film development, did you see marker? If all of these steps are normal, it could be the problem of your sample or antibody.作者: 911 时间: 2013-9-10 13:57
,让你费解了,不好意思!!是这样的:我制备了一个家族两成员的多抗,抗原是原核表达的GST融合蛋白,两者之间一级结构有50%左右的相似性(是不是注定会有交叉反应?)。目前免疫组化的结果显示:其中一个抗体A'可以识别该抗原A不应表达的部位(如,小脑),而另一个成员B恰好表达于该部位。对于这样的结果是不是应该用抗原吸收实验处理A抗原的抗体A‘,并用处理过的抗体进行组化染色,以判断是否确实可以识别B。作者: NBA 时间: 2013-9-10 18:19
请问67kda的蛋白及46kda,35kda的蛋白各需用多大浓度的丙烯酰胺凝胶?谢谢作者: one 时间: 2013-9-11 15:17
问题:我用超滤管浓缩无血清1640培养的细胞培养液后,蛋白定量后做WESTERN,发现蛋白上样量较大时,跑电泳则看见该处总跑出一个峰来(严重滞后),而且分离胶似乎有一种被破坏的感觉,后来我用考马亮兰染色发现分子量70-80KD处总有一团很浓的东西,请问该现象到底是什么?不知道1640培养基(无血清)浓缩后是否有蛋白?另外问一下超滤浓缩需要在低温离心机进行吗?常温下离心30分钟会不会降解蛋白?另外问一个问题用2*SDS能否裂解细胞检测一种正常情况主要存在于染色质上的蛋白?谢谢作者: one 时间: 2013-9-11 15:22
才开始做Western,有以下问题想请教你。
1.丙烯酰胺的储存液出现沉淀了,可以过滤以后再使用吗?会对电泳的结果有影响吗?
2.我需要的是45kd和55kd的蛋白,分离胶浓度10%,用的Bio-Rad mini gel,胶厚0.75mm,恒压150V,曾经跑出来条带,但是现在条带跑不出来了,是在过滤丙烯酰胺以后,一条带也没有了,只是在溴酚蓝的条带下面隐约有一条带。条带跑不出来的原因有哪些呢?是不是有可能蛋白质降解了?另外电压是否偏高?胶的浓度是否合适或是用12.5%的更好?
3.上样缓冲液应该怎么加?用多少的?和样品的比例怎样?作者: DNA 时间: 2013-9-11 16:22
你如果想测actin 蛋白的变化可以选择house keeping类的蛋白做为内参,即那些可以维持细胞基本生命所需的蛋白, 有很多种,但是我说不出具体的来作者: DNA 时间: 2013-9-11 16:24
请问WB是否只能定性,很难定量!
我想做STAT3活化测定,能否采用同位素法进行?我查得资料显示,国内STAT3磷酸化水平的测定可能还没有用同位素法测定的,现在我从何处能获得相关资料呢?谢谢!作者: NBA 时间: 2013-9-11 16:52
我给你发过帖子,我觉得最有可能的是你的gel solution 的浓度变低了,导致胶浓度变低。
你通过实验是否排除了呢?
检测磷酸化抗体没有什么区别,只是最好封闭液用BSA就可以了。作者: NBA 时间: 2013-9-11 16:52
你将一抗浓度稀释到1:100-1:200试一下,你用的一抗浓度太高了。再有就是要排除抗原和2抗能直接结合这一可能。作者: NBA 时间: 2013-9-11 16:52
WB可以半定量,
另外stat3,我没有研究过,我只做过几个相关蛋白的WB和IHC如:
stat1 ,stat3, stat6,scos3(suppressor of cytokine signaling 3; STAT induced STAT inhibitor 3; cytokine-induced SH2 protein )(磷酸化)。
I am doing western blot now. However, when I load sample and begin to run them. There will be smiling effect. Could you tell me the causes作者: mysmdbl 时间: 2013-9-11 17:12
你做内参的目的是什么?
Western的内参照不是外加的吧,一般是作为辅助证明跑电泳的上样量各个lane是一样的。至于actin的特性,你上个卖抗体的生物公司网站(如scbt, sigma),看看他们有关actin抗体的说明书,里面都会有介绍的
All eukaryotic cells express actin, which often constitutes as much as 50% of total cellular protein (1-6). Actin, a 42 kD peptide chain, assumes two physical forms: globular actin, which may serve as a cytoplasmic storage pool, and fibrous actin, which, in conjunction with myosin, generates muscle contraction filaments . While lower eukaryotes, such as yeast, have only one actin gene, higher eukaryotes have several isoforms encoded by a family of genes (1,4). At least six types of actin are present in mammalian tissues and fall into three classes (5). Alpha actin expression is limited to various types of muscle, whereas beta and gamma are the principle constituents of filaments in other tissues . Members of the small GTPase family regulate t he organ ization of the actin cytoskeleton. Rho controls the assembly of actin st ress fiber s an d foca l ad hesion, Ra c r egulat es a ctin f ilament accumulation at the plasma membrane and Cdc42 stimulates formation of filopodia (7).作者: 8princess8 时间: 2013-9-13 10:13
多谢兄弟们的热心指教!
我用的膜是KPL公司0.45um的,一抗是Cell signaling 的,封闭液和二抗是KPL公司的pretain detecter western blot kit中自带的,用HRP 和TMB底物显色.我一定要用ECL和化学显色吗?在目前的基础上还有什么改进的措施?谢谢!作者: NBA 时间: 2013-9-13 10:19
我是做western的新手,目前还没有作出结果,很郁闷。我们买了低分子量marker,应该出6条带,不幸的是我们只看到3条!起初以为是marker有问题,可是用了同学的照样是3条带,不知有人碰到过这种情况没有?请指教!我们用的是Bio-rad公司的电泳仪,10%的分离胶。作者: NBA 时间: 2013-9-13 11:00
2。封闭采用含3%BSA的TBS封闭了近三个小时。然后一抗过夜,二抗孵育了大概六个小时。用碱性磷酸酶的显色方法按分子克隆做的。显色后的膜竟然与电泳结果相似,甚至可以看到泳道?就像刚转完的膜用丽春红染了一样。
出现这样的结果有几个可能。如下:
a 一抗的特异性不好。
B 一抗的稀释度太低了(要多稀释一抗)
C 2抗可以跟抗原直接结合。
D 2抗没有洗干净。
我是新手,问题简单请不要笑。我有两个蛋白,一个32KD,一个14KD,能同时转膜吗?转膜条件如何设定?一抗是不是单抗或多抗都行,浓度如何调节?二抗做ELISA时为1:4000稀释,做WESTERN时应该如何稀释?由于做SDS-PAGE时,蛋白经过煮都已变性,如果抗体是用复性好的蛋白制备的,还能与膜上的蛋白结合吗?作者: NBA 时间: 2013-9-13 17:41
你所问的这个问题现在没有定论,要具体情况具体分析。甚至要做了以后才知道结果。作者: NBA 时间: 2013-9-13 18:14
1 是一抗的问题。
2 是底物和2抗的问题。
你可以根据我前面的帖子里说到的东西来排除。作者: NBA 时间: 2013-9-13 18:15
1 提高抗原量
2 提高1抗量
3 提高2抗量
其实我前面的帖子里都有,希望你能看看作者: one 时间: 2013-9-13 18:15
I detected two preoteins using western blot (one protein is 68KD, and another is actin, which is 42KD) , but I found every protein has two bands, and the two bands are very near( two bands are around 68KD, and the other two bands are around 42KD). The background was clear. I don't know why it happened.
thanks a lot!作者: bring 时间: 2013-9-13 18:15
我已做了几个月的WB,一直以来比较顺,条带也比较漂亮。可是二个月前因丙烯酰胺和Tris-HCl用完,换用另一家公司试剂后发现电泳时电流很不正常,下降特别快,另外电泳速度变快,原先电泳须五个小时(浓缩胶一个半小时,分离胶三个半小时),现在全程三个小时就到底了,转膜后丽春红染色发现条带没分开,而且小分子量蛋白成了一片均匀的红染,其余试剂及操作同前,但没再出现条带。换回原先厂家试剂还是无济于事,折腾了两个月,真是身心俱疲。盼高手给予指导。不胜感谢!作者: NBA 时间: 2013-9-14 15:30
看到你的消息让我兴奋不已,我已连续做了3个星期的Western了,没有结果啊!我表达了GST融合蛋白,SDS-PAGE可见目的条带,可是在w时,我的抗GST一抗1:500稀释,二抗1:1000稀释,只有许多非特异条带而没有目的条带,如果一抗1:1000,二抗1:2000,则是白片,转膜都是好的,那么问题出在哪呢?作者: NBA 时间: 2013-9-14 15:46
你的膜转移后用考染一下,看看是否你所说的”一块一块的“都是蓝色的?
我觉得你有可能是三明治没有做好,是气泡造成的,另外,你是否检测过转移后的胶呢?作者: NBA 时间: 2013-9-14 16:39
"有没有将胰岛素标记过氧化物酶的方法? "
应该是很简单的事情,有现成的kit,或者用across linker完成这个,最好是用kit,里面的HRP是处理过的,但是连接后胰岛素是否有活力就不知道了。作者: NBA 时间: 2013-9-14 16:39
to 遥望
”某某基因表达的天然蛋白大小是35KD,我用它前面300bp做了一个真核表达载体,现在要做一个wb检查转染的目的蛋白是否有表达;我做的是稳定转染,用G418筛选过,但是是混合克隆,目的蛋白的分子量估计在12KD,抗体是自己实验室做的多抗,针对蛋白的前面部分,就是说理论上是可以匝出我得蛋白的;请教一下应该注意什么问题。
之前做过一次,用15%的sds-page,转摸后用力春红染了,看见很多蛋白条代,但是blot之后,没见到目的条代,也没看见细胞内源性表达的35KD条带;师兄用抗体作出来了的。我用的是师兄的条件
蛋白大小是否适合用15%的胶进行分离?跑胶跑到何种程度适合?是不是应该先做一个考马司亮蓝染色?“
可以用15%的胶,但是最好用20um的膜做转移,但是如果你用丽春红染色证明是好的,则可以继续往下做。
可以用更浓的一抗来杂交试试,提高1-2倍,(比方说原来是1:1000, 现在做1:500,或1:300试试)。作者: NBA 时间: 2013-9-14 16:40
转膜条件:45mA, 2h,半干转膜(24*2滤纸的那种),电泳过程中电压15v~52v NC膜
转膜缓冲液(参照CST公司的protocol):转膜缓冲液(PH 8.5):25 mM Tris ,0.2 M 苷氨酸,20% 甲醇;
目的蛋白为:磷酸化stat3,分子量87kd
我想问一下我的问题出在哪?有的转膜缓冲液中含有SDS作用是什么?在我的现有转膜条件下是不是大分子蛋白不好转?有什么改进的措施吗?电泳过程中电压的变化能说明转膜的好坏吗?以前有人做过电压上升到250v和我的相差太多...
看了你的方法觉得问题不是太大,建议,开始用 30mA的电流,转移40mins,之后将电流提高到 55mA,时间80mins ,如果这样不行,你可以将transfer buffer中的甲醇含量降低到10%,另外加0.1%SDS在transfer buffer里,再试试条件。作者: NBA 时间: 2013-9-14 18:09
免疫沉淀(IP)后作免疫印迹(I,如何证明每个lane的蛋白质是相等的
I have a problem. Could you please help me?
免疫沉淀(IP)后作免疫印迹(I,如何证明每个lane的蛋白质是相等的?
譬如说做IR的tyrosine phosphorylation,我们先用anti-IR作免疫沉淀,再用PY99(抗tyrosine磷酸化抗体)作免疫印迹,可得到
结果。这时需要做strip,我想肯定不能用β-actin(可以吗?)。那么可以将膜清洗,用anti-IR重新沉淀,对吗?
可这又能说明什么问题?如果reprobe后,every lane的印迹相同,可以认为上样量一致。但如果不同,能说明上样量不一致吗?有可能是上样量一致,但处理因素将IR的蛋白量改变。那么?如何是好作者: mamamiya 时间: 2013-9-18 16:24
请问楼主,WESTERN转膜时,用湿法转,应如何控制转移电压和时间,与哪些因素有关呀作者: NBA 时间: 2013-9-18 16:32
200kd的蛋白用半干转,恒流150mA,2h
湿法转移30伏,6h作者: NBA 时间: 2013-9-18 16:37
转移完后,用TBST-脱脂牛奶封闭。
加1抗可以与4度孵育过夜,在进行后面的实验。作者: NBA 时间: 2013-9-18 16:37
提高1抗稀释度(降低1抗的上样量),wash时间长一些。作者: NBA 时间: 2013-9-18 16:40
提高1抗稀释度(降低1抗的上样量),wash时间长一些。作者: NBA 时间: 2013-9-18 16:42
你的转移时间过长。
这种情况,你可以再膜的背面显色或曝光。作者: NBA 时间: 2013-9-18 16:43
如果免疫小鼠制备单抗,准备1mg(包括检测)左右。如果多肽的话,量需要4-5mg。
免疫兔子进行多抗制备,最低准备2mg蛋白(包括检测)。作者: NBA 时间: 2013-9-18 16:43
这个根据你的蛋白分子量决定,10%的胶30伏转移3h一般可以转移完全。作者: NBA 时间: 2013-9-18 16:48
太好了,终于有高人可问了。我做了好几次的western了,总是没有条带。我实验的目的是定性检测MHC I 类分子单体的存在,跑的是非变性胶,用的是NC膜,转完之后用立春红染色,可以看到很明显的目的蛋白条带(目的蛋白已经纯化过的),3%的BSA4度封闭过夜,再按我们师姐他们的方法加一抗二抗后,用 DAB显色,却看不到条带,而用相同的一抗做ELISA却可以做出结果,请问问题有可能出在哪里?怎么检测我的二抗是否有问题?怎么确定一抗的浓度?因为我们用的一抗是买的杂交瘤细胞自己取的上清,有没有可能是一抗浓度太小?师姐建议用化学发光法,我们还没有试。多谢了!作者: NBA 时间: 2013-9-18 18:08
条带多,不是显色液的问题。
应该是你的抗原抗体结合的问题。作者: NBA 时间: 2013-9-18 18:08
10ug足够。作者: NBA 时间: 2013-9-18 18:09
1.7kd的蛋白无法在sds胶的分布,15aa的多肽不适合WB检测。作者: NBA 时间: 2013-9-18 18:10
200kd的蛋白,一般用7%左右的sds-page胶。
150mA转移1.5h。作者: NBA 时间: 2013-9-18 18:11
如果蛋白量较大的话,建议10ug,1ug,0.1ug,0.01ug点样。
蛋白量小的话则做2-5倍的梯度上样。作者: NBA 时间: 2013-9-18 18:14
恒流,150mA,1.5h。作者: NBA 时间: 2013-9-21 11:19
你的TBST溶液的PH值最好调整一下。作者: NBA 时间: 2013-9-21 11:19
换用1.0mm的胶。
或者将样品低速离心一下。作者: NBA 时间: 2013-9-21 11:20
恒压。
5%的胶。电泳时间加长。作者: NBA 时间: 2013-9-21 11:20
分子克隆试验指南
上提供好几个配方可以参考。作者: NBA 时间: 2013-9-21 11:20
如果是PVDF转移前将膜用100%的甲醇浸泡30秒。
转移时间加长。一般100mA,1.5h对50kd的蛋白可以转移完全。作者: NBA 时间: 2013-9-21 11:21
这看你的试验需要以及手头试剂。
就检测来说多抗比单抗效果好一些。作者: NBA 时间: 2013-9-21 11:25
如果转移小分子20kd以内,用psq膜,效果较好。
我不知道你说的小条带消失了是什么其情况。作者: NBA 时间: 2013-9-21 11:25
胶浓度8%
跑胶时间加长0.5h。
150mA,转移1.5h。作者: NBA 时间: 2013-9-21 11:26
您好,我需要做的是先提取系膜细胞的总蛋白,然后再做WESTERN 使其中的ERK显出条带.想请问:
1.因为我的实验分组有很多,有10组.我不清楚要做出结果需要多少蛋白量呢?资料上写的是需要20ug总蛋白.书上写10ug总蛋白.可是要提取这么多蛋白所需要的细胞应该大约是多少呢?不知道用孔板培养细胞里面提取的蛋白够不够
2.you shouldn't loading more than 0.3ug/mm2 for one well.
您的意思是:每个孔不能超过0.3微克每平方毫米?也就是依据孔的面积计算?
3.请问您MARKER的意义只是提供一个标准分子量的参照,对于我的实验只是比较各个组之间ERK的表达多少,有什么意义呢?
谢谢!!! 作者: mamamiya 时间: 2013-9-21 14:08
Wu, X. et al. Immunofluorescent labeling of cancer marker Her2 and other cellular targets with semiconductor quantum dots. Nature Biotechnol. 21, 41-46 (2003)
Jaiswal, J. K. et al. Long-term multiple color imaging of live cells using quantum dot bioconjugates. Nature Biotechnol. 21, 47-51 (2003)
您好,
向您请教WB中间的问题。
我现在做WB,以不加一抗作为阴性对照。组织来源大鼠的脑。
步骤如下:
Tissue was harvested from rat brain and lysed in lysis buffer(10 mM Tris-HCl, pH 7.2, 150 mM NaCl, 0.1% SDS, 0.5% sodium deoxycholate, 10%NP40).100ug of protein from total cell lysates, determined by using the Braford assay were boiled in 2*SDS sample buffer for 5 min, electrophoresed on a 10% polyacrylamide . and then transferred onto a PVDF membrane. After blocking with 5% free flat milk in TBST, the membrane was incubated with primary antibodies CHL (1:250) for 2 h at room temperature and 4℃ overnight. The membrane was washed with TBS and probed with HRP-conjugated anti-mouse IgG (1:3000) for 1 h at room temperature. After the membrane was washed with TBST, protein bands were developed with ECL reagents.
我目前在做一个糖蛋白的WESTERN, 它有两个subunit,经去糖基酶处理后,一个分子量为102KDa,另一个分子量为95KDa.我用了7.5%Tris glycine gel, but they run to the very close postion. I am wondering how I can separate them in one gle clearly. Any special gel available? Thanks in advance.作者: XYZQ 时间: 2013-9-21 18:14
各位前辈,小妹有疑问:我要的目的蛋白是56和66KD的膜蛋白,心脏组织采用RIPA裂解30min,我用的60V浓缩胶和120V的分离胶电泳,90V湿转2小时.5%BSA封闭1小时,一抗1:1000,1小时,洗三次后加二抗1:2000,1小时后洗三次,然后显影,却没有结果.请问是哪里出问题了?还有,组织和裂解液的比例为多少比较合适呢?实在急!作者: DNA 时间: 2013-9-22 09:49
请教:我的是120和40KD的蛋白,之前第一次做都很好,结果现在曝光都没有,之前的条件是12%的分离胶,电泳大概200分钟,转膜湿转恒流400mA,90min.我用的是BIO-RAD的电泳和转膜系统,PVDF膜用的是MILLIPORE的0.45uM的膜,是不是转膜时间太短了?我染过胶和膜,胶的下面没有条带,上面是有的,膜也差不多呢!多谢了!作者: one 时间: 2013-9-22 12:42
我在做western,现在遇到了一个怪问题,就是加一抗4度过夜,第二天洗过之后加1:10000(1:20000:1:8000;1:15000也试过了)的二抗室温1小时和半小时都试过了,之后在洗20分钟,ECL染曝光,总是雾蒙蒙一片,更本看不见任何条带,之后用锡纸包好放入4度冰箱,又过一夜,第二天从锡纸中取出膜TBST洗了后,再加一次二抗1:10000一个小时,再曝光,就会曝出清晰的条带,很奇怪的现象,已经重复三次都这样,不知道为什么。作者: TAT 时间: 2013-9-22 13:36
最近做WB遇到了很大的问题。GST-PULL DOWN 样品跑电泳转膜后杂某种蛋白,结果出了如图所示的结果。背景的杂带几乎把目的条带淹没了,根本找不到我要的带在哪里。 4度过夜封闭,一抗1:1000室温1小时。二抗1:1000室温50分钟。洗膜都是三次,每次10分钟。(我做免疫沉淀的样品也是按照这个条件做的,虽然有杂带但是很少。结果还可以)