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标题: [好书]生物软件选择与使用指南+纳米+115优盘 [打印本页]

作者: 实验技术 时间: 2010-5-13 15:55 标题: [好书]生物软件选择与使用指南+纳米+115优盘

作　　者：李军等编著
出版社：化学工业出版社

* 出版时间： 2008-4-1
* 字　　数： 321000
* 版　　次： 1
* 页　　数： 249
* 印刷时间： 2008-4-1
* 开　　本： 16开
* 印　　次： 1
* 纸　　张：胶版纸
* I S B N ： 9787122023179
* 包　　装：平装

内容简介
本书提供了生物软件的选择、获取和使用建议，旨在为生命科学工作者更好地开展自己的研究工作打开方便之门。作者在撰写过程中，体现了下列特色：
所涉及的软件以免费软件资源为主，包括本地软件和在线软件，亦包括部分使用广泛的商业软件。
所涉及的软件范围较宽，如核酸序列分析、蛋白质序列分析、蛋白质结构分析和新药设计等。
所有类型的软件均提供了典型实例，且这些实例均在计算机上实际运行通过。
本书可以作为生物类专业的本科教材，也可供生命科学、医学基础和药学等领域的高校及科研院所研究人员参考。

目录
第1章生物软件选择指南
1.1 生物科学工作者常用软件
1.1.1 实验准备阶段
1.1.2 实验实施阶段
1.1.3 实验结果输出阶段
1.2 因特网上的生物软件资源
1.2.1 通过搜索引擎进行搜索
1.2.2 通过生物信息学数据库进行查找
1.2.3 通过生物资源主题网站进行查找
1.2.4 软件的索取、安装及使用

第 2章综合序列分析
2.1 综合序列分析软件Lasergene
2.1.1 引言
2.1.2 用GeneQuest发现新基因
2.1.3 用Protean进行蛋白质结构分析
2.1.4 用MegAlign进行序列比对和构建进化树
2.1.5 序列组装、引物设计、限制图谱和序列编辑
2.2 综合序列分析软件BioEdit
2.2.1 引言
2.2.2 File：文件菜单
2.2.3 Edit：编辑菜单
2.2.4 Sequence：序列菜单
2.2.5 Alignment：排列菜单
2.2.6 View：视图菜单
2.2.7 Accessory Application：应用程序菜单
2.2.8 RNA：RNA序列分析菜单
2.2.9 World Wide Web：网络菜单
2.2.10 Options：选项菜单
2.2.1l Window：窗口菜单
2.2.12 Help：帮助菜单
2.3 综合序列分析在线程序
2.3.1 EMBOSS
2.3.2 SeWeR
参考文献

第3 章用BLAST进行序列相似性搜索
3.1 引言
3.2 局部比对搜索基本工具BLAST
3.2.1 BLAST简介
3.2.2 BLAST检索的基本知识
3.2.3 BLAST检索工具的分类
3.2.4 BLAST检索中采用的数据库
3.2.5 BLAST检索的步骤
3.2.6 通过BLAST搜索发现序列的生物学意义
3.2.7 用BLAST发现新基因

参考文献
第4章用Clustal(X／W)进行多序列比对
4.1 引言
4.2 Clustal X
4.2.1 Clustal X功能详解
4.2.2 用Clustal X进行蛋白质多序列比对
4.3 Clustal W

第 5章进化树构建
5.1 引言
5.1.1 进化树构建的基本程序
5.1.2 进化树构建的方法选择
5.1.3 进化树构建的软件选择
5.1.4 数据分析及结果推断
5.1.5 总结
5.2 PHYLIP——免费的集成的系统分析软件包
5.2.1 概述
5.2.2 实例：用PHYLIP软件包构建GPD蛋白家族的系统进化树
5.3 MEGA4——免费的本地建树工具

第6章序列格式转换
6.1 常见的分子序列格式
6.2 序列格式转换软件
6.2.1 SeqVerter 1.3
6.2.2 ForCon 1.0
6.2.3 序列格式转换在线程序READSEQ

第7章序列信息递交
7.1 引言
7.2 用Banklt递交新基因序列
7.3 用Sequin递交新基因序列

第8章引物设计
8.1 引言
8.2 通用引物设计软件Primer Premier 5.00
8.2.1 Primer Premier 5.00的序列编辑窗口
8.2.2 Primer Premier 5.00的引物设计窗口
8.2.3 Primer Premier 5.00的引I物检索结果输出窗口
8.2.4 Primer Premier 5.00的引物编辑窗口
8.2.5 用Primer Premier 5.00进行巢式PCR引物设计
8.2.6 用Primer Premier 5.00进行简并引物设计
8.2.7 Primer Premier 5.00的其他功能
8.2.8 Primer Premier 5.00程序存在的不足
8.3 通用引物在线设计程序Primer 3
8.3.1 Primer 3概述
8.3.2 实例：应用Primer3设计针对p53基因mRNA编码区的特异引物
8.4 简并引物在线设计程序GeneFisher
8.4.1 简并引物设计过程及原则
8.4.2 简并引物设计程序GeneFisher

第9章质粒绘图
9.1 质粒绘图软件WinPlas
9.1.1 WinPlas的操作界面
9.1.2 WinPlas的操作方法
9.1.3 WinPlas的操作实例
9.2 质粒作图在线程序PlasMapper 2.0
9.2.1 PlasMapper 2.0的基本功能与操作方法
9.2.2 PlasMapper 2.0程序运行实例

参考文献
第10章用ANTHEPROT进行蛋白质序列分析
10.1 引言
10.2 工具栏与基本功能
10.2.1 工具栏
10.2.2 基本功能
10.3 蛋白质序列编辑功能
10.4 蛋白质基本分析功能
参考文献
第11章用同源建模服务器SWISS-MODEL进行蛋白质三维结构预测
11.1 SWISS-MODEL
11.2 运行实例：用SWISS—MODEL服务器进行蛋白三维模型构建工作
11.2.1 实例之一：用首选模式进行牛血清白蛋白的同源建模与结构解析
11.2.2 实例之二：利用项目模式进行蛋白的同源建模
11.2.3 实例之三：利用比对模式进行蛋白的同源建模
11.2.4 实例之四：寡聚蛋白的同源建模
11.3 蛋白质分子结构预测方法
11.3.1 同源建模
11.3.2 反相折叠
11.3.3 从头预测

参考文献
第12章蛋白质结构比对
12.1 蛋白质结构分类
12.1.1 按结构域分类
12.1.2 系统性分类
12.2 蛋白质结构比对工具
12.2.1 VAST——矢量比对工具
12.2.2 DALI距离矩阵(distance matrix alignment)
12.2.3 Structure
12.2.4 SSAP

第13章用RasMol／PyMOL／Swiss-PdbViewer进行生物分子三维结构显示和分析
13.1 引言
13.1.1 分子坐标表示方法
13.1.2 分子表面
13.1.3 分子图形显示模型
13.1.4 蛋白质结构测定方法
13.2 RasMol
13.2.1 RasMol的操作窗口
13.2.2 RasMol的命令行窗口
13.2.3 RasMol应用实例
13.3 RasTop简介
13.4 Swiss-PdbViewer
13.4.1 Swiss-PdbViewer简介
13.4.2 Swiss-PdbViewer运行实例
13.5 PyMOL
13.5.1 PyMOL简介
13.5.2 PyMOL应用实例

第14章计算机辅助基因识别
14.1 引言
14.2 GENSCAN——基因预测的首选工具
14.2.1 影响GENSCAN预测准确度的因素
14.2.2 GENSCAN的操作流程
14.3 WebGene——基因结构分析和预测工具集
14.4 GeneBuilder——基因结构预测系统
14.5 ORF Finder——NCBI的开放阅读框(()RF)识别工具
14.6 CpGPlot／CpGReport／Isochore——EMBL的CpG岛计算工具
14.7 tRNAscan-SE——tRNA基因识别工具

第15章计算机辅助疫苗设计
15.1 引言
15.1.1 计算机辅助疫苗设计技术诞生的时代背景
15.1.2计算机辅助疫苗设计技术的原理与方法

15.1.3计算机辅助疫苗设计的产业前景
15.2 IMGT工具包
15.3 蛋白酶体酶切位点的预测
15.3.1 NetChop 3.0服务器
15.3.2 ProPrac
15.4 MHC结合区域的预测
15.5 T细胞表位的预测
15.6 免疫学数据库

**** 本内容跟帖回复才可浏览 *****

作者: dream_srg 时间: 2010-5-15 16:20

谢谢分享，已经找了好几天了

作者: hzh0525 时间: 2010-5-15 21:28

谢谢分享！

作者: gmccmg 时间: 2010-5-16 21:17

非常好的书，谢谢分享。

作者: wxj111 时间: 2010-5-17 08:28

多谢分享。

作者: 403382944 时间: 2010-5-24 21:48

好书，谢谢分享。

作者: biobefreind 时间: 2010-5-27 23:36

我希望得到这本书的全文！

作者: gqgyhg 时间: 2010-5-28 09:38

非常谢谢楼主的分享！

作者: 330783878 时间: 2010-5-29 00:13

申请可够麻烦了！不过支持！楼主

作者: czb002 时间: 2010-5-30 16:18 标题: ss

作者: 51movie 时间: 2010-5-31 21:01

这是个好东西呀，谢谢搂住

作者: syw1973 时间: 2010-6-1 22:49 标题: 谢谢

我希望得到这本书的全文！

作者: cd2345 时间: 2010-6-2 11:20

努力学习一下

作者: lespedeza09 时间: 2010-6-13 10:47

谢谢楼主分享！

作者: alittleboy110 时间: 2010-6-14 13:53

谢谢楼主，学习学习

作者: bluerunner 时间: 2010-6-15 14:55

非常感谢！正在寻找这本书

作者: bluerunner 时间: 2010-6-15 15:00

好像优盘那个过期了。纳米盘也下载不了。不知楼主或哪位大侠客再上传一份，谢谢！

作者: fanfuzi09 时间: 2010-6-19 15:36

非常感谢，下来看看。

作者: zhuxiugao 时间: 2010-6-22 09:14

呵呵，好东西，看看啊

作者: dd152003 时间: 2010-6-23 15:44

谢谢楼主的无私分享，多谢

作者: grain 时间: 2010-6-24 22:59

支持！楼主,谢谢！！哈哈哈

作者: keyzhi 时间: 2010-6-29 23:11 标题: 谢谢楼主

谢谢楼主

作者: s0914104 时间: 2010-6-30 16:16 标题: 謝謝分享

謝謝分享!

作者: caujin 时间: 2010-7-9 09:16

好东东啊

作者: cau 时间: 2010-7-15 12:56 标题: 找了很久了

谢谢分享

作者: ccyybb11 时间: 2010-7-15 22:28

好书啊感谢楼主啊希望可以看到啊

作者: pcq12345 时间: 2010-7-18 11:02

谢谢分享

作者: zkylixing 时间: 2010-8-2 16:52

谢谢楼主的资源
找了很久了

作者: shuiping 时间: 2010-9-27 17:15

好好来学习学习; 好资源

作者: evan3952 时间: 2010-10-14 10:45

想要啊~~~

作者: wzhaaa2003 时间: 2010-11-25 10:20

非常谢谢楼主的分享！

作者: lim1896 时间: 2010-11-28 15:33

现在还能下载吗？

作者: simnprince 时间: 2010-12-3 19:20

楼主好人那！无私分享！

作者: rockg 时间: 2010-12-9 14:27

看看。。。。。。。。。。。

作者: a410731466 时间: 2010-12-9 16:28

真好啊

作者: 星期五13 时间: 2011-1-28 22:05

非常谢谢！！

作者: fulin5201314 时间: 2011-1-29 00:15 标题: 谢谢

谢谢找了好久

作者: madie 时间: 2011-3-4 14:35 标题: 看看~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

看看~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

作者: bbt610955189 时间: 2011-3-9 20:16

谢谢分享

作者: lmhytr 时间: 2011-3-16 11:03

能下吗，看看。

作者: zzc2211 时间: 2011-4-21 23:44

好书，谢谢分享

作者: concer 时间: 2011-6-4 11:22

多谢楼主分享

:) :) :) :) :)

作者: homerchou 时间: 2011-6-19 17:20

谢谢楼主！好东西。值得收藏！

作者: benbentangtang8 时间: 2011-6-21 16:28

找了很久了

作者: reflowercui 时间: 2011-6-22 09:07 标题: 谢谢楼主

正需要呢楼主辛苦了真是好人啊呵呵

作者: ocarina 时间: 2011-6-22 17:13

非常感谢LZ的分享！

作者: ocarina 时间: 2011-6-22 17:14 标题: 非常感谢LZ分享

非常感谢LZ的分享！

作者: ocarina 时间: 2011-6-22 17:14

非常感谢LZ的分享！

作者: emagnet 时间: 2011-6-28 12:09

下载下来好好学习学习！

作者: zzcmhxy002 时间: 2011-6-29 18:34

非常感谢，正是我找了2天的东西，再次感谢分享

作者: slszbd 时间: 2011-7-9 09:07 标题: 谢谢分享！

谢谢分享！

作者: fmuzzy 时间: 2011-7-29 13:01

正需要这样一本书，非常感谢分享！

作者: 虎啸金秋 时间: 2011-9-21 14:05

作者: yourtrees 时间: 2011-11-12 22:27

不知道书有没有过期，好东西，谢谢分享

作者: gbballack 时间: 2011-12-6 19:26

楼主支持你

作者: zhangyy985 时间: 2011-12-12 16:44

非常有用的资料，谢谢楼主

作者: 还未注册 时间: 2011-12-12 21:46 标题: 楼主好人啊

楼主好人啊！！！

作者: 还未注册 时间: 2011-12-12 21:47 标题: 楼主好人啊

楼主好人啊！！！

作者: 小笨熊敏 时间: 2012-11-28 18:39

谢谢分享啊！

作者: lhwei1987 时间: 2013-11-25 13:54

辛苦辛苦

作者: pydsn88 时间: 2014-8-12 14:51 标题: 好东西啊楼主好人

找了很久了好像只有这里才有好东西啊

作者: 18010012332 时间: 2017-12-23 14:47

棒棒哒~很有用呢，希望能下载到~

作者: 18010012332 时间: 2017-12-23 14:58 标题: 这个书已经下载不了了

辛苦楼主或者站友们能不能再发我一份呢？

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