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标题: 【求助】寻求从血清中确定病毒特异性蛋白的研究思路 [打印本页]

作者: sunbent 时间: 2014-5-20 13:19 标题: 【求助】寻求从血清中确定病毒特异性蛋白的研究思路

那位大虾帮忙提示如何从感染动物的血清中确定该病毒的特异性蛋白的研究思路？不胜感激！！

作者: leifengta 时间: 2014-5-20 13:20

比较蛋白组，可以用正常的动物血清与感染后动物的血清分别进行2D，挖下差异点质谱鉴定。
但说实在的，说起来容易做起来要看命了。一是血清里IgG等蛋白的丰度太高，会影响别的蛋白的分辩率；二是差异点不一定是病毒的特异蛋白，能不能测到，要看你老板的钱钱和你的命了。

作者: leifengta 时间: 2014-5-20 13:20

相关疾病：
感染
最近，我们小组在做病毒感染细胞前后的比较蛋白组，前途难料。。。

作者: xyw5 时间: 2014-5-20 13:20

QUOTE:

原帖由 leifengta 于 2014-5-20 13:20 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
比较蛋白组，可以用正常的动物血清与感染后动物的血清分别进行2D，挖下差异点质谱鉴定。
但说实在的，说起来容易做起来要看命了。一是血清里IgG等蛋白的丰度太高，会影响别的蛋白的分辩率；二是差异点不一定是病毒的特异蛋白，能 ...

这可能很困难
目标蛋白浓度会很低,难以用银染等方法测到
何况还要去高丰度蛋白

作者: ladyhuahua 时间: 2014-5-20 13:21

你是要找病毒蛋白还是人体对病毒反应产生的蛋白,研究蛋白不同思路不同.

作者: sunbent 时间: 2014-5-20 13:21

十分感谢各位的意见，我要找得是动物血清中的病毒蛋白。

作者: ladyhuahua 时间: 2014-5-20 13:22

你如果找病毒蛋白，2D Gel的方法就不要考虑了，我认为找不到。
我有2个主意供你考虑：
1。你先做一次病毒蛋白的蛋白质组，或用理论的方法产生病毒蛋白的多肽列表，然后做动物学清的蛋白组，最好用白蛋白分离柱，清除一部分白蛋白，用1D, 或 shotgun的方法，然后把你的病毒的多肽输到质谱的列表里，让质谱只找病毒蛋白，这样成功性比较大。
2。如果动物会对病毒产生免疫，你可以分离免疫球蛋白，这样会把结合在抗体的病毒蛋白分离出来，会增加你发现病毒蛋白的几率。
有没有道理？

作者: sunbent 时间: 2014-5-20 13:22

十分感谢ladyhuahua的宝贵建议！！因我是刚刚做蛋白质组的一个菜鸟，还有很多不懂，老板前几天刚刚布置了课题，所以打算毕业回家之前最好拿出个试验方案来。再次感谢ladyhuahua的宝贵建议！！还望以后您多多赐教！！

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