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标题: 【求助】3KD以下蛋白跑不出电泳 [打印本页]

作者: duoduo    时间: 2014-6-21 09:42     标题: 【求助】3KD以下蛋白跑不出电泳

各位好,本试验碰到一难题,一33个氨基酸的多肽(原核表达)跑不出电泳来(20%Tri-glycin SDS-PAGE) ,但是提取的样品有活性。因此我们认为蛋白有表达,但就是没有电泳结果,这个难题5年都没有解决,请各位指点一下!
作者: guagua    时间: 2014-6-21 09:43


用Tricine SDS-PAGE肯定跑得出来。
因为我做过,对于1KD的短肽是有难度,但3KD的就很好作了

作者: 耗子===    时间: 2014-6-21 09:43

可以试试夹层胶或者尿素胶
我以前跑过7kd的 再低的就不知道怎么样了
你可以试试看

作者: wawa    时间: 2014-6-21 09:43


我刚刚跑过了5KD大小的蛋白.完全可以的到很好的结果.你的配方是什么?好象有几种不同的protocol.
还有你的胶跑别的小分子蛋白可以吗?如果不行.那就是你胶的问题了

作者: duoduo    时间: 2014-6-21 09:44


用Tricine SDS-PAGE也跑过了,还是没有跑出来,我们有一作7年蛋白的蛋白王子都没有u跑出来,他就是用的这种方法,还有就是20%浓度的胶液试过了

作者: duoduo    时间: 2014-6-21 09:44

用Tricine SDS-PAGE肯定跑得出来。
因为我做过,对于1KD的短肽是有难度,但3KD的就很好作了

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这个方法试过了,也没有成功。我看到有方法是提高丙烯酰胺浓度和加甘油,但不知具体方法。不知道是不是这个多肽有其他毛病,我刚接手这个东西,害怕呢,老板很凶,以前的人都挨批啊。
作者: vcve    时间: 2014-6-21 09:45

我的胶就要加甘油.效果很好。如果不行那是不是你的蛋白浓度太低了啊??我的分离胶49.5%T。6%C 。浓缩胶49.5%T。3%C
作者: flower-201    时间: 2014-6-21 09:45

中国生物工程杂志上(2004年1月)有一篇曹佐武的文章,就是用5T+3C的方法,加尿素可以跑到1K,一般的6T+3C+甘油的方法跑3K很清楚,我刚跑的。你要注意的问题是:阳极缓冲液、凝胶缓冲液的PH值(测Tris的PH值的探头和一般试剂的不一样,)丙烯酰胺在4度会沉淀,用锡箔纸包的时候不容易发现,用的时候在55度加热融解。我犯了这样两个错误,一直没有跑出来,注意一下,应该可以跑出来。
作者: duoduo    时间: 2014-6-21 09:45


谢谢你啊,你采用的是6T+3C+甘油的方法跑3K这个方法吗,前面的5T+3C+加尿素的方法试过吗?你说的那篇文章我也下载了。我可以将用前面2方法同时做一下。

作者: duoduo    时间: 2014-6-21 09:46

我的胶就要加甘油.效果很好。如果不行那是不是你的蛋白浓度太低了啊??我的分离胶49.5%T。6%C 。浓缩胶49.5%T。3%C

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你跑的蛋白是多大的,加多少甘油11%吗?可不可以把你的配方给我试试?
多谢!

作者: duoduo    时间: 2014-6-21 09:46

我的胶就要加甘油.效果很好。如果不行那是不是你的蛋白浓度太低了啊??我的分离胶49.5%T。6%C 。浓缩胶49.5%T。3%C

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也是配的3段胶“小孔胶+ 夹层胶+ 浓缩胶“还是 2段”分离胶+浓缩胶“。我看你的方法可能是2段胶,还有中间有需要注意的问题吗?比如PH,电极缓冲液等。不好意思,多多麻烦了。

作者: linlinstar    时间: 2014-6-21 09:46


堆积胶 0.16ml 丙烯先按 (49.5%T。3%C)
0.5ml gel buffer (3M Tris.cl 0.3%SDS ph8.45)
1.34ml ddw
10ul 10% APS
4ul TEMED
分离胶 2ml 丙烯先按 (49.5%T。6%C)
2ml gel buffer (同上)
0.62 100%甘油
1.38 ddw
40ul 10% APS
8ul TEMED
阳极电泳缓冲液 0.2M Tris.cl ph 8.9
阴极缓冲液 0.1M Tris.cl 0.1M tricine 0.1%SDS PH8.25
以上就是我的胶的配方.祝你实验顺利





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