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标题: 【求助】帮分析一下表达蛋白的含量 [打印本页]

作者: pulala 时间: 2014-6-21 11:02 标题: 【求助】帮分析一下表达蛋白的含量

各位师兄师姐：
帮忙看看表达蛋白含量占细菌总蛋白的多少，是要经验分析还是软件分析？还是别的方法？我只要粗略的估计一下表达蛋白的含量，不需很具体。
万分感谢！

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作者: wood533 时间: 2014-6-21 11:20

还是用软件分析吧
目测觉得是在5%左右

作者: pulala 时间: 2014-6-21 11:20

这么低啊？看来表达的不够好。我这里没有软件，因为本专业运用该方面的技术很少，但急于知道含量，求各位高手帮忙分析一下！！！
谢谢！

作者: qhyu 时间: 2014-6-21 11:21

你的上样量有点偏大了，而且中间的带挤在一起，就是用软件分析，误差也会比较大的。
建议重新跑一块胶，减少上样量至以前的1/3至1/2
并且适当降低胶浓度，使中间比较多的几条蛋白带能分得更开一些。

作者: jkobn 时间: 2014-6-21 11:21

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我用Quantiscan分析了一下，但由于胶颜色深，不太准确，仅供参考吧。
另外是使用Net Area 还是 Bgnd Area分析我也不太清楚望高手讲解
Peak  Position  Units  Net. Ht.  Calc. Ht.  Net Area  Bgnd Area  Calc Width  Calc Area
Peak 1  175.00  175.00  53.84  N/A  658.49  525.41  N/A  N/A
Peak 2  184.00  184.00  64.25  N/A  544.80  250.20  N/A  N/A
Peak 3  197.00  197.00  76.35  N/A  1190.63  475.37  N/A  N/A
Peak 4  215.00  215.00  75.98  N/A  654.84  250.20  N/A  N/A
Peak 5  239.00  239.00  130.63  N/A  3326.69  800.63  N/A  N/A
Peak 6  263.00  263.00  131.24  N/A  2041.90  450.35  N/A  N/A
Peak 7  276.00  276.00  129.59  N/A  1384.00  275.22  N/A  N/A
Peak 8  311.00  311.00  59.98  N/A  684.53  375.29  N/A  N/A
Peak 9  331.00  331.00  55.02  N/A  731.55  475.37  N/A  N/A
Peak 10  355.00  355.00  86.86  N/A  2688.90  975.76  N/A  N/A
Peak 11  382.00  382.00  72.14  N/A  898.96  400.31  N/A  N/A

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作者: zwsyrt 时间: 2014-6-21 11:23

这是什么软件？？　挺好的，
caron_zk 可否把软件上传共享．谢谢

作者: DONT 时间: 2014-6-21 11:24

只是以前没有接触过这个软件，研究了半天还是没有判断出来表达量，哪位高手可以帮忙看一下上面的结果？
时间条件关系，目前无法再跑一块胶，先粗略的帮忙估计一下吧！

作者: pencil菲 时间: 2014-6-21 11:24

再跑一块胶也只需要几个小时时间啊，
这样的图片scan出来误差很大的，目测估计是5%－10%的表达量

作者: pulala 时间: 2014-6-21 11:24

不好意思，主要现在不在实验室了，过一段才回去，同时跑了几块胶好像都差不多，新手没有经验，跑得都不好，同样的样再发一张，看看是否好一点，多麻烦各位指点了！

作者: 小糖块 时间: 2014-6-21 11:25

不好意思，主要现在不在实验室了，过一段才回去，同时跑了几块胶好像都差不多，新手没有经验，跑得都不好，同样的样再发一张，看看是否好一点，多麻烦各位指点了！

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帮你用QUANTITY ONE 弄了下，黄色方框内是你的蛋白，含量为9.01%，看看怎么样

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