Board logo

标题: 【求助】菌落PCR中的问题 [打印本页]

作者: iii_ii    时间: 2015-3-11 17:23     标题: 【求助】菌落PCR中的问题


我是直接在平板上挑菌加入到pcr反应体系中,试剂及反应条件都是没有问题的,我们做的是16S通用引物,结果出现了比marker最大片段1500bp大好多的条带不知道是怎么回事。求高手赐教~~~~


图片附件: 未命名.jpg (2015-3-11 17:23, 10.6 KB) / 该附件被下载次数 6
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=29806


作者: lgm    时间: 2015-3-11 17:24


我一般挑出菌落液体培养基要10个小时以后再拿菌液做PCR,直接那菌落出现这种情况个人感觉有可能是挑的菌落中的菌太多,直接跑出来细菌的质粒或者基因组

作者: qianqin1977    时间: 2015-3-11 17:24


你挑单克隆把菌摇起来以后,用菌液做PCR试一下

作者: remenb    时间: 2015-3-11 17:25

这个有可能是你的引物在菌的基因组中扩增的结果,而不是在你的质类上扩增
作者: iii_ii    时间: 2015-3-11 17:26



QUOTE:
原帖由 lgm 于 2015-3-11 17:24 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我一般挑出菌落液体培养基要10个小时以后再拿菌液做PCR,直接那菌落出现这种情况个人感觉有可能是挑的菌落中的菌太多,直接跑出来细菌的质粒或者基因组 ...

有可能,谢谢啦。不是菌太多久抑制反应了吗?但是我看16S有有P出来的。。。。
作者: gmjghh    时间: 2015-3-11 17:26


感觉菌液的纯度有问题,划线以后再挑斑重新检测

作者: iii_ii    时间: 2015-3-11 17:26



QUOTE:
原帖由 gmjghh 于 2015-3-11 17:26 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

感觉菌液的纯度有问题,划线以后再挑斑重新检测

菌不纯?
作者: gmjghh    时间: 2015-3-11 17:27



QUOTE:
原帖由 iii_ii 于 2015-3-11 17:26 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

菌不纯?

感觉有点像,可以试一下
作者: ququer787    时间: 2015-3-11 17:28


是不是菌落挑得太多了,把大肠杆菌的染色体跑出来了。

作者: yayya    时间: 2015-3-11 17:29

菌量太多了,基因组DNA或者大质粒混在里面,有的PCR酶受抑制但估计还是有活力的,




欢迎光临 分析测试百科 (http://bbs.antpedia.com/) Powered by Discuz! 5.5.0