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标题: 【求助】LTQ ORBITRAP 液质联用仪定量分析氨基酸代谢物线性差 [打印本页]

作者: 晶晶亮    时间: 2015-5-19 17:49     标题: 【求助】LTQ ORBITRAP 液质联用仪定量分析氨基酸代谢物线性差

我实验室质谱是LTQ orbitrap, 主要用来做蛋白组学,最近有客户要做氨基酸代谢物定量分析,我建立分析方法,采用一级MS全扫,提取离子定量,做标准曲线(不含基质)发现6个物质只有一个线性在99%以上,其余在96-99之间,标曲6个点最高2ug/ml,最低2ng/ml, 在高浓度区域的点(2ug,1ug)总是在线性下面,响应偏差,形成往上抛物线状,高中低浓度的精密度均很好。是不是浓度过高造成离子抑制,做了些改进,在样品和流动相中均提高甲酸浓度,并在离子源部分提高气流,电压等,线性并未改善。我的样品采用5%DMSO溶解(含甲酸, 不好溶解,所以用DMSO), 流动相采取乙腈-水(含甲酸)。我看到很多文章在用此方法标曲线性均在99以上,可是我总是达不到。是不是离子阱不适合分析这类样品,或者确实是非线性,要用加权最小二乘进行处理。各位有什么建议,做哪些改进能提高线性呢?先行谢过。
作者: woshi    时间: 2015-5-19 17:49

换流动相试试?比如用甲醇和水(含甲酸),或者干脆缩小线性范围吧
作者: 晶晶亮    时间: 2015-5-19 17:49

流动相可以换换试一下,还有把2ug点去掉试试
作者: whitesheep    时间: 2015-5-19 17:50

你设的浓度点范围是不是有点宽了?
作者: xevin    时间: 2015-5-19 17:50

浓度点范围有点宽了,把2ug点去掉也好。
作者: 晶晶亮    时间: 2015-5-19 17:50

我把流动相换成甲醇和水(含甲酸),去掉2ug的点,有的检测信号增加有的下降,线性还是基本在95-99之间,抛物线状,不解高浓度信号为何总是下降
作者: xuuuu    时间: 2015-5-19 17:51

线性范围有点宽了
作者: zbboom    时间: 2015-5-19 17:51

你是ft的扫描?还是ltq的扫描?建议修改一下分析时间
作者: 晶晶亮    时间: 2015-5-19 17:51

FT扫描,LTQ精度不够,范围太宽了,改为5-500,线性良好
作者: yes4    时间: 2015-5-19 17:52

orbi能进的离子数目很有限,用FT来定量的话很容易就饱和了
作者: is2011    时间: 2015-5-19 17:52

LTQ orbi  这玩意  跟tof 一样 线性窄了点,要做定量不要范围太宽了。
作者: is2011    时间: 2015-5-19 17:52

同样是orbi,为何QE的定量能力非常好,可以5个数量级,跟串接一样,求教
作者: ujne    时间: 2015-5-19 17:53

呵呵,QE的英文指标是3个半数量级!我觉得5个数量级可能是在目标化合物SIR的模式下,即一级的选择离子情况下可能可以达到5个数量级。但我看QE很多应用文献,针对目标化合物,也就2-3个数量级,且在前年美国ASMS会议上热电的QE推荐会上举例的应用也是不到3个数量级。不解
作者: ujne    时间: 2015-5-19 17:54

总结一下,就是说LTQ-Orbi仪器中,Orbi本身线性不好,而LTQ线性也不好,所以LTQ-Orbi无论在哪种工作模式下线性可能均不太宽喽。而QE当针对目标化合物做SIR时,即Q开始发挥作用时,此时经过四级杆选择后进入Orbi的东西很干净,因此有可能做到更宽的线性,而做未知物全扫描时,基质非常复杂,而Orbi的容量又是有限的,所以线性会差。
其实QTOF也是一样,做full scan时差不多4个数量级左右,当做TOF-MRM模式时也是能到5个数量级

作者: kulee    时间: 2015-5-19 17:54

看来用orbitrap做定量proteomics 也是任重而道远啊。
作者: qianqin1977    时间: 2015-5-19 17:55

浓度过高了,去掉高点就可以了。
作者: xue258    时间: 2015-5-19 17:55

空间电荷效应太强,浓度不要做太高,2-500ng/mL就够了,另外曲线增加权重1/x拟合




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