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标题: 【求助】各家TOF的数据采集速率最高能到每秒几张谱图? [打印本页]

作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:14     标题: 【求助】各家TOF的数据采集速率最高能到每秒几张谱图?

如题,有没有高手能解答一下。
本人以前主要做LC/MS,所了解的TOF最大采集速率就是5600了,号称能达到每秒100张谱图,觉得这已经是很快了,并且Ruedi大牛还靠这个提出了(或者说改进了,没有仔细去了解)SWATH技术,一种近似对Fullscan中的所有离子都打二级的做法。
最近开始接触GC/MS,实验室也进了一台A的7200Q-TOF,想玩玩2D-GC,但是查资料发现第二维GC出来的峰宽都在100-200ms数量级,MS的数据采集速率根本跟不上。但是LECO家的商品化的2D-GC-TOF系统居然声称他们的数据采集速率能到500Hz,这是不是有点逆天了,有没有高人解释一下?    (这是Brocher中的原话:Only the Pegasus TOFMS, with continuous full-range mass spectral acquisition rates at up to 500 Hz, offers MS data with sufficient data density to address the requirements of any GCxGC separation. Spectral quality at these high acquisition rates is maintained in the Pegasus TOFMS as seen in Figure 5。    Figure 5. The 150 millisecond-wide trimethylbenzene GCxGC peak is easily defined and identified at a mass spectral acquisition of 200 spectra/second)


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作者: 紫烟    时间: 2015-5-19 18:15

液质一般都在几十赫兹,其实个人感觉采集速率对于检测没有太多影响。或者有什么我不了解的意义,还请各路高手介绍一下。
作者: panda王    时间: 2015-5-19 18:15

液质里扫描速度最快的应该是5600了,气质不了解。
作者: panda王    时间: 2015-5-19 18:15



QUOTE:
原帖由 紫烟 于 2015-5-19 18:15 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
液质一般都在几十赫兹,其实个人感觉采集速率对于检测没有太多影响。或者有什么我不了解的意义,还请各路高手介绍一下。

如果是检测已知物质可能扫描速率没啥影响,如果是复杂的未知物质扫描速率的影响就大了去了。
LCMS鉴定经常采用先全扫描,然后通过全扫描图谱,按照丰度从高到低选取母离子进行打碎并扫描这些碎片峰,得到所谓的二级质谱图进行结构鉴定。理论上来说在一个循环中,选取的母离子越多你得到的信息就越全面,不容易漏掉丰度低的物质;但在实际过程中,由于HPLC峰宽和质谱扫描速度的限制,你最多只能选择有限的几十个母离子进行扫描。Reudi用5600号称能检测所有离子靠的是将50道尔顿范围内的所有离子进行打碎,这样得到的二级扫描图谱是很复杂的,包含了多个离子的碎片信息。但他通过高分辨的二级图谱和相应软件能够将这些碎片峰还原出来,很了不起。不过我认为他会丧失部分灵敏度,如果扫描速率能更快就能解决这个问题。

作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:16



QUOTE:
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液质一般都在几十赫兹,其实个人感觉采集速率对于检测没有太多影响。或者有什么我不了解的意义,还请各路高手介绍一下。

因为LC的峰宽一般都较宽,就算UPLC得到的峰宽也得5-10秒,因此即使1Hz的速率,对于定性来说影响也不大。
但是2D-GC的第二维GC的峰宽大概在0.1-0.2秒,这样的话采集速率对检测影响就比较大了。
只是非常奇怪LECO家的TOF居然能做到500Hz,这种检测器如果应用到LC-QTOF中,Fullscan的全谱图做二级就不再是问题了,对蛋白质组学可是一大福音啊。不过按说LECO的2D-GC-TOF也已经出了有段时间了,很奇怪怎么没人关注这方面呢?

作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:17



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如果是检测已知物质可能扫描速率没啥影响,如果是复杂的未知物质扫描速率的影响就大了去了。
LCMS鉴定经常采用先全扫描,然后通过全扫描图谱,按照丰度从高到低选取母离子进行打碎并扫描这些碎片峰,得到所谓的二级质谱图进 ...

非常同意您的观点,不知道您对LECO的500Hz的TOF采集速率有什么看法呢。就我的理解来说,因为这个采集速率只是跟TOF检测器的性能相关,提高这个应该是电子学和物理学方面的事,跟前面的LC还是GC是没有什么关系的,因此这种检测器应该不难移植到LC的各种TOF检测器上,不知道我说的对不对。
个人觉得如果L能做到这些的话,AB和Agilent等似乎也应该可以做的到啊,不知道这两家为什么没有相关的进展

作者: panda王    时间: 2015-5-19 18:17



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非常同意您的观点,不知道您对LECO的500Hz的TOF采集速率有什么看法呢。就我的理解来说,因为这个采集速率只是跟TOF检测器的性能相关,提高这个应该是电子学和物理学方面的事,跟前面的LC还是GC是没有什么关系的,因此这种检测 ...

对于一台QTOF而言,最主要的指标有分辨率,灵敏度及扫描速度(当然还有精度),正常而言,在采集速度与分辨率及灵敏度必须择其一。因为LC峰宽远大于GC峰宽,因此并不需要如此快的速度,以免牺牲其他性能。LECO的这些指标可能都是在比较极端的情况下做出来的结果,当在500HZ速度下,可能灵敏度及分辨率都会较差。扫描速度与各个厂家采用的数据采集方式是息息相关的,现在最主要的QTOF厂家主要是两大类采集方式,Agilent,bruker采用DDA,AB采用IDA和SWATH,IDA就是DDA,waters采用MSE,DDA是一种比较经典但稍显落后的方式,需要设定阈值,再按照丰度从高到低进行MS/MS,这样这个占空比会受到限制,必须去提高扫描速度,所以AB到100HZ,安捷伦50HZ,bruker50HZ,定量会稍弱,且对使用者经验要求较高。SWATH及MSE是同一条路,不需要阈值,同时去采集MS及MS/MS,这样会节省大量时间,定量较好。但需要有性能可靠的软件对复杂的谱图进行解析。当然,SWATH(AB去年推出此技术)跟MSE(waters在07年推出此技术)去比就是小儿科了,SWATH是在25Da(非楼上Lics05说的50Da)范围进行MS及MS/MS同时采集,MSE是在全质量范围进行MS及MS/MS采集,完全避免占空比的问题。
作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:17

对于一台QTOF而言,最主要的指标有分辨率,灵敏度及扫描速度(当然还有精度),正常而言,在采集速度与分辨率及灵敏度必须择其一。因为LC峰宽远大于GC峰宽,因此并不需要如此快的速度,以免牺牲其他性能。LECO的这些指标可能都是在比较极端的情况下做出来的结果,当在500HZ速度下,可能灵敏度及分辨率都会较差。扫描速度与各个厂家采用的数据采集方式是息息相关的,现在最主要的QTOF厂家主要是两大类采集方式,Agilent,bruker采用DDA,AB采用IDA和SWATH,IDA就是DDA,waters采用MSE,DDA是一种比较经典但稍显落后的方式,需要设定阈值,再按照丰度从高到低进行MS/MS,这样这个占空比会受到限制,必须去提高扫描速度,所以AB到100HZ,安捷伦50HZ,bruker50HZ,定量会稍弱,且对使用者经验要求较高。SWATH及MSE是同一条路,不需要阈值,同时去采集MS及MS/MS,这样会节省大量时间,定量较好。但需要有性能可靠的软件对复杂的谱图进行解析。当然,SWATH(AB去年推出此技术)跟MSE(waters在07年推出此技术)去比就是小儿科了,SWATH是在25Da(非楼上Lics05说的50Da)范围进行MS及MS/MS同时采集,MSE是在全质量范围进行MS及MS/MS采集,完全避免占空比的问题。
您好,非常感谢您的意见,不过还是有些不太懂的地方:
1.不知道Waters的MSE的在全质量范围进行MS以及MS/MS采集具体是怎么做的,因为按照SWATH的25Da范围在m/z400-1200进行MS以及MS/MS同时采集,一个循环需要的时间大约是100ms(MS累积时间)+100ms(每个MS/MS的累积时间)*(1200-400)/25=3300ms,32张质量还可以接受的MS/MS谱图就需要三秒多,不知道Waters的MSE是怎么样的?
2.即使LECO的500Hz是极端的情况,那么50-100Hz应该是一个各个参数都能够顾及到得情况了,厂家应该不至于常用的条件是10Hz就拿500Hz的极端条件来宣传。然而50-100Hz对目前LC的MS和MS/MS同时采集来说也已经是很高很高的了。因为虽然AB宣传的是最高到100Hz,但为了谱图质量能接受,Reudi的SWATH也只是用了10Hz(每张谱图累积100ms)。如果能把LECO的检测器拿过来用的话,按照50Hz计算,在同样的3300ms时间范围内,一个MS能够得到约160张MS/MS谱图,很高的数目了。

作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:18

另外,您说的扫描数据与各个厂家采用的数据采集方式是息息相关的,这个说法我觉得是不是有些问题呢?因为我觉得扫描速度应该只跟硬件相关。对于DDA或者IDA,硬件方面扫描速度上去了的话(当然是在技术进步足以保证灵敏度 和分辨率可以接受的条件下),一个循环内按照从高到低选择离子时,可以选择的离子数目也多了,得到的信息也更丰富了;同样的,对于MSE或者SWATH,扫描速度上去了的话,同样的可以得到的MS/MS谱图的数量也多了,或者得到同样数目的谱图所花费的时间减少了。不知道我的理解正确与否?
作者: whitesheep    时间: 2015-5-19 18:18

同问,waters MSE 具体是个什么过程?AB的SWATH又是怎么样的一个过程?
我了解的waters MSe:假如waters的QTOF最大的扫描速度是20Hz,那么扫描时间最小也就是0.05S(1/20=0.05)。
当我们设定一个MSe方法扫描时间设定为0.1秒钟时,其中0.05S用于MS扫描,下一个0.05S用于MS/MS扫描,然后循环......(当然中间还有inter scan delay,lockspray snan time等,在此我们忽略这些次要因素),这样就在计算机的处理下,形成了两个数据通道,即低能量通道和高能量通道。这种办法是针对全质量范围的。不知道我的理解是不是正确?

作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:19



QUOTE:
原帖由 whitesheep 于 2015-5-19 18:18 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
同问,waters MSE 具体是个什么过程?AB的SWATH又是怎么样的一个过程?
我了解的waters MSe:假如waters的QTOF最大的扫描速度是20Hz,那么扫描时间最小也就是0.05S(1/20=0.05)。
当我们设定一个MSe方法扫描时间设定为0.1秒钟时,其 ...

AB的SWATH是这样的,一个循环中,首先100ms的MS(400-1200),接下来进行32个100ms的MS/MS,第一个MS/MS的precursor ions是400-425(对Quad进行一种特殊的tune,使其可以选择这一范围的离子送到碰撞室去进行CID),第二个MS/MS的precursor ions是425-450,以此类推,第32个MS/MS的precursor ions是1175-1200,这样一个循环下来总共花费了3300ms,得到了一张MS谱图,以及32张MS/MS谱图。(为了简化描述,这里precursor ions的选择是整数,实际上Reudi做的时候,是有一个0.5Da的偏移)
按照我的理解,Waters的MSE一个扫描循环下来似乎只得到了一张MS谱图和一张MS/MS谱图,这样的话对MS/MS谱图进行解析的话,有些难以将谱图上的碎片峰与其precursor ion进行对应。当然了WATERS对此好像有解释,但我没有仔细看,不知道有没有高手对此了解的比较详细的来给大家解惑。
AB的swath虽然也不是对某个确定的m/z的precursor ion去打二级,但他们将全部的质量范围等分成了32份,至少我们知道第一张谱图的precursor ions来自400-425这个范围。即使这样,在谱图解析的难度上,这与我们常用的DDA,IDA等还是有不小的差距的,因为DDA或者IDA是选择一个确定的m/z去打二级的,每张MS/MS谱图都有一个确定m/z的precursor ion。当然了,SWATH是对全质量范围进行了MS/MS,其结构信息还是更为丰富的,DDA或者IDA只是对TOP 5, 10,20或者甚至到50,100(已经非常困难了)进行了MS/MS。若要以每张谱图都有一个确定m/z的precursor ion的要求来对全质量范围进行MS/MS的话,一个循环中要有800张二级谱图(当然要保证谱图的质量),这对扫描速度是一个极其巨大的挑战。

作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:19

说了这么多,好像有点偏题了。
其实我想问的是:
1.有没有人对LECO的500HZ提出质疑?
2.没有的话,既然LECO可以做到,为什么其他的TOF厂家没有跟进?(如上所述,高扫描速度在蛋白质组学方面还是很有应用前景的)

作者: youyou99    时间: 2015-5-19 18:19



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AB的SWATH是这样的,一个循环中,首先100ms的MS(400-1200),接下来进行32个100ms的MS/MS,第一个MS/MS的precursor ions是400-425(对Quad进行一种特殊的tune,使其可以选择这一范围的离子送到碰撞室去进行CID),第二个MS/MS的precurs ...

您的理解很准确,waters的MSE一个Scan只得到一张MS及MS/MS图,瞬间切换(约1ms),它解析整个母离子与子离子关联的方法是依靠waters家的chromlynx的软件(设计是一个三元的高斯函数),此软件的原理是母离子应该与子离子具备相同的色谱行为,必须保证有高度稳定的保留时间,这也是waters号称只有他们有底气同时采集MS及MS/MS的原因,他家的UPLC有足够稳定的泵。
作者: youyou99    时间: 2015-5-19 18:20

同问,waters MSE 具体是个什么过程?AB的SWATH又是怎么样的一个过程?
我了解的waters MSe:假如waters的QTOF最大的扫描速度是20Hz,那么扫描时间最小也就是0.05S(1/20=0.05)。
当我们设定一个MSe方法扫描时间设定为0.1秒钟时,其中0.05S用于MS扫描,下一个0.05S用于MS/MS扫描,然后循环......(当然中间还有inter scan delay,lockspray snan time等,在此我们忽略这些次要因素),这样就在计算机的处理下,形成了两个数据通道,即低能量通道和高能量通道。这种办法是针对全质量范围的。不知道我的理解是不是正确?

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理解很准确,就是低能量及高能量两通道瞬时切换。waters的扫描速度MS和MS/MS均为30scan/sec
作者: xuuuu    时间: 2015-5-19 18:20

这些机器用的是TDC,而且是TDC里面比较老的LIST模式。数据线上传输的是HIT信息,并不是质谱的谱图。到了电脑以后再转换成HIST模式,才是谱图。理论上LIST可以记录每一个离子打击的时间,但是问题是动态范围低会失真。
如果是ADC的话,一张谱图大概至少256k点x 32bit=1Mb,如果一秒钟100张,总线传输能力要达到100Mb,超过PCI-32和100M以太网,特别是硬盘,需要用阵列8个硬盘才够。也不是不能做,麻烦一点。USB2号称480Mb,实际效果也就10MB随机BLOCK的样子。或者根本不开FPGA处理功能,这样,一秒钟可以到3万张,但是数据量大概2Gb的样子,用板载的32G RAM,可以记录15秒,但是无法传输。

作者: youyou99    时间: 2015-5-19 18:21

您好,非常感谢您的意见,不过还是有些不太懂的地方:
1.不知道Waters的MSE的在全质量范围进行MS以及MS/MS采集具体是怎么做的,因为按照SWATH的25Da范围在m/z400-1200进行MS以及MS/MS同时采集,一个循环需要的时间大约是100ms(MS累积时间)+100ms(每个MS/MS的累积时间)*(1200-400)/25=3300ms,32张质量还可以接受的MS/MS谱图就需要三秒多,不知道Waters的MSE是怎么样的?
2.即使LECO的500Hz是极端的情况,那么50-100Hz应该是一个各个参数都能够顾及到得情况了,厂家应该不至于常用的条件是10Hz就拿500Hz的极端条件来宣传。然而50-100Hz对目前LC的MS和MS/MS同时采集来说也已经是很高很高的了。因为虽然AB宣传的是最高到100Hz,但为了谱图质量能接受,Reudi的SWATH也只是用了10Hz(每张谱图累积100ms)。如果能把LECO的检测器拿过来用的话,按照50Hz计算,在同样的3300ms时间范围内,一个MS能够得到约160张MS/MS谱图,很高的数目了。
waters的MSE据我所知,因为整个过程非常简单,只是在整个质量数范围做高低能量切换从而得到一张MS及一张MS/MS图,以30HZ计,一个duty cycle time约为33ms+33ms=66ms,1s可以采集15张MS/MS图及15张MS/MS图。您的第一条中MS及MS/MS累积时间均为100ms,我觉得因为AB的MS最高速度为100hz,而MS/MS为50hz,因此我想如果MS累积时间为100ms,那么MS/MS是否应该为200ms呢?我个人觉得waters及AB在速度上或者说在单位时间所采集谱图的数量上应该差别不大。倒是有个担心,当SWATH以25Da做扫描质量数范围切换,四级杆需要变换质量数范围,会不会有信号会丢失呢?不明白。

作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:21

waters的MSE据我所知,因为整个过程非常简单,只是在整个质量数范围做高低能量切换从而得到一张MS及一张MS/MS图,以30HZ计,一个duty cycle time约为33ms+33ms=66ms,1s可以采集15张MS/MS图及15张MS/MS图。您的第一条中MS及MS/MS累积时间均为100ms,我觉得因为AB的MS最高速度为100hz,而MS/MS为50hz,因此我想如果MS累积时间为100ms,那么MS/MS是否应该为200ms呢?我个人觉得waters及AB在速度上或者说在单位时间所采集谱图的数量上应该差别不大。倒是有个担心,当SWATH以25Da做扫描质量数范围切换,四级杆需要变换质量数范围,会不会有信号会丢失呢?不明白。

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1.虽然AB的MS最高速度为100Hz,MS/MS为50Hz,但是swath中的MS和MS/MS均只是用到了10Hz,因此MS和MS/MS都累积100ms应该没什么问题
2.我个人的理解,SWATH的quad是做了一种特殊的Tune,从而能够选择一定质量范围的母离子,切换应该不会有影响,因为常用的DDA或者IDA在对TOP5或者TOP10做二级的时候也会有切换的问题,只不过SWATH的切换是从一个质量范围到另一个质量范围,而DDA或者IDA是从一个确定的m/z到另一个确定的m/z.

作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:21



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原帖由 xuuuu 于 2015-5-19 18:20 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
这些机器用的是TDC,而且是TDC里面比较老的LIST模式。数据线上传输的是HIT信息,并不是质谱的谱图。到了电脑以后再转换成HIST模式,才是谱图。理论上LIST可以记录每一个离子打击的时间,但是问题是动态范围低会失真。
如果是 ...

不过您提到的TDC的一些相关名词真心不太懂。另外按照您提到的,是不是受电脑和通讯等硬件方面的限制,因此ADC的扫描速度不能做到100Hz以上,但是就ADC本身来说还是能够达到500Hz甚至更高的。还有后面的FPGA等彻底不懂了
作者: zhy平平    时间: 2015-5-19 18:22

Waters Synapt G2 or G2-s采用3Ghz ADC,再之前老的产品是TDC。
AB5600采用40GHz TDC。
不过仍然不是很明白TDC与ADC的区别,请教。

作者: jude    时间: 2015-5-19 18:22

我来给你们讲讲SWATCH的笑话吧!
说QTOF的MS2,其实窗口开的太小不是太好,一方面灵敏度低了,生物大分子同位素浪费很厉害,另一方面生物信息学的分析其实也不是太看母离子的m/z有多好。这些软件如今都可以从碎片倒推母离子,甚至于很多时候倒推出来的母离子还不只几个这么多,即使你母离子子窗口还仅仅1u宽,有的母离子可以偏离窗口高达十几个u。
这样就有聪明人想,干脆烂到底,全开(MS ALL),后来效果也不好,就跳呀跳,搞了个开30u。

作者: milkdog    时间: 2015-5-19 18:23

AB的SWATH是这样的,一个循环中,首先100ms的MS(400-1200),接下来进行32个100ms的MS/MS,第一个MS/MS的precursor ions是400-425(对Quad进行一种特殊的tune,使其可以选择这一范围的离子送到碰撞室去进行CID),第二个MS/MS的precursor ions是425-450,以此类推,第32个MS/MS的precursor ions是1175-1200,这样一个循环下来总共花费了3300ms,得到了一张MS谱图,以及32张MS/MS谱图。(为了简化描述,这里precursor ions的选择是整数,实际上Reudi做的时候,是有一个0.5Da的偏移)
按照我的理解,Waters的MSE一个扫描循环下来似乎只得到了一张MS谱图和一张MS/MS谱图,这样的话对MS/MS谱图进行解析的话,有些难以将谱图上的碎片峰与其precursor ion进行对应。当然了WATERS对此好像有解释,但我没有仔细看,不知道有没有高手对此了解的比较详细的来给大家解惑。
AB的swath虽然也不是对某个确定的m/z的precursor ion去打二级,但他们将全部的质量范围等分成了32份,至少我们知道第一张谱图的precursor ions来自400-425这个范围。即使这样,在谱图解析的难度上,这与我们常用的DDA,IDA等还是有不小的差距的,因为DDA或者IDA是选择一个确定的m/z去打二级的,每张MS/MS谱图都有一个确定m/z的precursor ion。当然了,SWATH是对全质量范围进行了MS/MS,其结构信息还是更为丰富的,DDA或者IDA只是对TOP 5, 10,20或者甚至到50,100(已经非常困难了)进行了MS/MS。若要以每张谱图都有一个确定m/z的precursor ion的要求来对全质量范围进行MS/MS的话,一个循环中要有800张二级谱图(当然要保证谱图的质量),这对扫描速度是一个极其巨大的挑战。

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讲得太好了,我们假设一个循环是3300ms,而且已经能做800张二级谱图。那SWATH的窗口最小就可开成是1Da(实际工作时由于同位素峰不需开得这么小),基本上一个样品做下来所有看得见看不见的母离子二级信息都全了,那将推动二级谱图采集从data dependent 到data independent的巨大改进。我想这也是楼主对500HZ技术那么感兴趣的的原因。
作者: chengjie79    时间: 2015-5-19 18:23

Hz跟感度是双面刃。。。。。。
作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:23



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原帖由 chengjie79 于 2015-5-19 18:23 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
Hz跟感度是双面刃。。。。。。

如您所说,由于扫描速度的提高带来的TOF的灵敏度的损失是不可避免的,但是灵敏度还是可以通过质谱其他部分硬件性能方面的提升来加以补偿。而我也总是在提到扫描速度提高的同时,总要加上一句“在保证谱图质量的前提下”。
不知道该不该另开一个帖子来讨论,就是现有的各家质谱厂商所能达到的最高离子化效率和离子传输效率能到多少,有没有一个量化的指标来表示,还能有多少提升的空间?形象点说,假如从色谱柱末端洗脱出来了某化合物A的100个分子,那么从离子源开始算起,最终达到检测器的该化合物的离子能够有多少个?

作者: zbboom    时间: 2015-5-19 18:24

1.虽然AB的MS最高速度为100Hz,MS/MS为50Hz,但是swath中的MS和MS/MS均只是用到了10Hz,因此MS和MS/MS都累积100ms应该没什么问题
2.我个人的理解,SWATH的quad是做了一种特殊的Tune,从而能够选择一定质量范围的母离子,切换应该不会有影响,因为常用的DDA或者IDA在对TOP5或者TOP10做二级的时候也会有切换的问题,只不过SWATH的切换是从一个质量范围到另一个质量范围,而DDA或者IDA是从一个确定的m/z到另一个确定的m/z.

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个人觉得您对SWATH理解很精确,很专业,有个疑问想请教您:SWATH中MS及MS/MS只用到10HZ,这是为什么呢?
作者: utt0989    时间: 2015-5-19 18:24



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原帖由 zbboom 于 2015-5-19 18:24 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
1.虽然AB的MS最高速度为100Hz,MS/MS为50Hz,但是swath中的MS和MS/MS均只是用到了10Hz,因此MS和MS/MS都累积100ms应该没什么问题
2.我个人的理解,SWATH的quad是做了一种特殊的Tune,从而能够选择一定质量范围的母离子,切换应该 ...

如同你所讲,扫描速度跟灵敏度还是不能兼得的(单纯就检测器这一部分来说),个人觉得虽然AB宣称能达到100Hz,但是在此扫描速度下,谱图的质量(也就是灵敏度)对于实际应用来讲可能还是不太够吧。在质谱其余部分的硬件性能的提升还不足以补偿由此带来的灵敏度的损失的情况下,SWATH实际只用到了10Hz,其实这个速度相对于很多常规应用来说也不算慢了
作者: vvmmoy    时间: 2015-5-19 18:25

从DDA返回到IDA肯定是一种无奈的倒退,这是由于LCMS的一些性能或者根本原理达不到而做的妥协。
至于这个10Hz,应该是四极杆的切换极限,一方面settling time要10ms左右,此外CC的clear out也要ms级别。所以切换母离子速度上不去。

作者: iii_ii    时间: 2015-5-19 18:25

力可高通量的质谱,确实是可以做到500张图谱/秒的,高分辨的可以做到200张图谱/秒,只不过力可的LC-TOF在中国不卖的,只有GC-TOF,所有蛋白组学用不了,代谢组学比较适合。
LECO是做产品的,而大A类的公司都是做市场的,市场大,他们才会跟进,LECO的TOF只要是针对复杂组分的未知物分析的,做研究才会用的上。跟目前主流的做目标物定性的应用不一样的,所以主流质谱厂家一直没有跟进。
而且,LECO的销售貌似从来不主动出来跑客户的,只有国外用过LECO仪器的,或者听同行介绍的,他们才会过来聊一下,他们每年在中国不超过20台的销量,主要还是卖给玩腻了三重四极的,想玩些高端应用的人的。





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