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标题: 【转帖】【分享】GCMS Chemstation（安捷伦）如何合并现... [打印本页]

作者: duchy 时间: 2015-7-12 19:58 标题: 【转帖】【分享】GCMS Chemstation（安捷伦）如何合并现...

GCMS Chemstation（安捷伦）如何合并现有谱库成自建库？
大家在使用GCMS分析未知化合物时对质谱库的依赖度非常高，所以大家会购买一些专属性较强的谱库，如农药库，香精香料库等，当然还有强大的Nist库。但功能强大了烦恼也来了，工作站会尽职尽责，把每个数据上的每个色谱峰都进行分析，打印出详细的检索结果，而大家真正关心的化合物可能仅仅是其中几个，而且万一大家关心的这几个化合物还在不同的质谱库里，这时怎么办？
小编在这里就告诉大家如何把自己关心的化合物从众多谱库中一一挑出，合并到自己新建的谱库中，以解大家“众里寻图千百度”的烦恼。
A：可以通过JCAMP文件转换进行。
Ø 第一步，将*.L文件转换成*.JCAMP文件。
1）在data analysis的view菜单选Parametric Retrieval 进入Parametric Retrieval mode。进入Parametric Retrieval mode后，选择Library\Write JCAMP file…，如下图所示；

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作者: duchy 时间: 2015-7-12 19:59

2）如在检索参数中不做选择，则整个*.L文件转换成*.JCAMP文件；如设定检索条件，则符合要求的*.L中若干条目被转换成*.JCAMP文件。该例中我们将谱库Test1（NIST11.L中的所有化学名称为Dodecane的条目）和谱库Test2（整个demo.L文件）合并为Test谱库。输入新生成的JCAMP文件名称，新生成的JCAMP文件Test1和Test2被默认保存在C:\msdchem\MSexe路径下。

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作者: duchy 时间: 2015-7-12 19:59

Ø 第二步，将两个*.JCAMP文件合并转换成*.L文件。
3）选择Library\Read JCAMP file…，如下图所示，选择需合并的.JCAMP文件TEST1；

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作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:00

4）创建新生成的谱库TEST.L文件名称，如下图所示；对.JCAMP文件TEST2重复3）～4）操作，并选择添加到同一个谱库TEST.L文件中，搞定！

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作者: bling 时间: 2015-7-12 20:00

好文章，实用性强，可惜我的是岛津的

作者: jrwyyplt 时间: 2015-7-12 20:01

自建谱库的一种方法，从商业库中提取，好方法

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:01

QUOTE:

原帖由 bling 于 2015-7-12 20:00 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
好文章，实用性强，可惜我的是岛津的

岛津的也有方法，把中意的某一个物质加入到自建库中。

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:02

还有个单一物质添加进自建库的方法
“视图”——“参数检索”
输入参数，检索到自建库中没有的化合物，然后

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作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:02

在data analysis的view菜单选Parametric Retrieval 进入Parametric Retrieval mode。

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:02

QUOTE:

原帖由 bling 于 2015-7-12 20:00 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
好文章，实用性强，可惜我的是岛津的

岛津也应该有相似的功能？

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:03

QUOTE:

原帖由 jrwyyplt 于 2015-7-12 20:01 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
自建谱库的一种方法，从商业库中提取，好方法

这样可以扩大自建库。

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:03

打开工作站，进入谱库编辑窗口，打开已有谱库，如NIST，在参数检索中输入参数，找到需要添加的物质，
“Compound Info”——“Copy to another library”，选择自建库，点击确定，即可。

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:03

谢谢分享。也看到岛津有index search，这个功能好，安捷伦没有。

作者: 克隆 时间: 2015-7-12 20:04

QUOTE:

原帖由 duchy 于 2015-7-12 20:03 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
谢谢分享。也看到岛津有index search，这个功能好，安捷伦没有。

这个就是参数检索的开始按钮，index search下面就两个选择，一个start，一个stop。

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:04

QUOTE:

原帖由克隆于 2015-7-12 20:04 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

这个就是参数检索的开始按钮，index search下面就两个选择，一个start，一个stop。

那天找个岛津的工作站看看，index Search怎样玩，不错。

作者: glass 时间: 2015-7-12 20:05

不错，加到自建库里，查找方便。

作者: chuntian1983 时间: 2015-7-12 20:05

岛津也应该有相似的功能？

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是的，但岛津也有

作者: chuntian1983 时间: 2015-7-12 20:05

岛津的也有方法，把中意的某一个物质加入到自建库中。

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岛津的自建谱库有个奇葩的缺陷是，碎片离子的数量不能超出50个，如果后面添加一个，第一个就会消失，保持在50个，有时某个组分的碎片离子较多，添加到自建谱库的时候，往往后面几个特征分子离子峰会没有

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:06

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原帖由 chuntian1983 于 2015-7-12 20:05 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
岛津的也有方法，把中意的某一个物质加入到自建库中。

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不能超过50个离子就可能会较少存储空间，但可能造成谱库谱图不完整的可能。

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:06

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原帖由 glass 于 2015-7-12 20:05 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
不错，加到自建库里，查找方便。

这样可以增加自建库的条目，不用再自己做标样加入自检库。

作者: sunbent 时间: 2015-7-12 20:07

岛津的自建谱库有个奇葩的缺陷是，碎片离子的数量不能超出50个，如果后面添加一个，第一个就会消失，保持在50个，有时某个组分的碎片离子较多，添加到自建谱库的时候，往往后面几个特征分子离子峰会没有

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还是你观察得仔细。我一直在用，就没注意这个缺点呢
有机会我也看看

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:08

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原帖由 sunbent 于 2015-7-12 20:07 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
岛津的自建谱库有个奇葩的缺陷是，碎片离子的数量不能超出50个，如果后面添加一个，第一个就会消失，保持在50个，有时某个组分的碎片离子较多，添加到自建谱库的时候，往往后面几个特征分子离子峰会没有

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不知道安捷伦有无50个离子的限制？

作者: 131415 时间: 2015-7-12 20:08

有那么麻烦吗？一个“Subset library"(子集谱库）功能就可以完成啦，都不需要转JCAMP

作者: 131415 时间: 2015-7-12 20:08

就在你发的第一张图的红圈下面一项功能，点一下就可以将下一步设定谱库检索的结果直接导入新建谱库或已有谱库当中。（注意别试图把整个NIST库导出）

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:09

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原帖由 131415 于 2015-7-12 20:08 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
就在你发的第一张图的红圈下面一项功能，点一下就可以将下一步设定谱库检索的结果直接导入新建谱库或已有谱库当中。（注意别试图把整个NIST库导出） ...

谢谢，以前好像用过，如果整个NIST库导出来，电脑就可能死机了。

作者: 婴儿脸 时间: 2015-7-12 20:09

岛津的自建谱库有个奇葩的缺陷是，碎片离子的数量不能超出50个，如果后面添加一个，第一个就会消失，保持在50个，有时某个组分的碎片离子较多，添加到自建谱库的时候，往往后面几个特征分子离子峰会没有

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可能是工作站版本的问题。用GCMSsolution4.2测试，没有问题。

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:09

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原帖由 婴儿脸 于 2015-7-12 20:09 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
岛津的自建谱库有个奇葩的缺陷是，碎片离子的数量不能超出50个，如果后面添加一个，第一个就会消失，保持在50个，有时某个组分的碎片离子较多，添加到自建谱库的时候，往往后面几个特征分子离子峰会没有

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会不会是旧的版本有限制？

作者: 婴儿脸 时间: 2015-7-12 20:10

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我的版本老旧，是2.53版本，不知道是否可以更新？

作者: any333 时间: 2015-7-12 20:10

应该是版本旧的问题。
厂家估计不会免费升级吧，4006500439

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:10

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原帖由 any333 于 2015-7-12 20:10 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
应该是版本旧的问题。
厂家估计不会免费升级吧，4006500439

一般不会免费升级的，有的版本也可能无法升级。

作者: any333 时间: 2015-7-12 20:11

气质主机型号是什么？新版本未必支持。

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:11

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原帖由 any333 于 2015-7-12 20:11 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
气质主机型号是什么？新版本未必支持。

这个问题也需要注意，硬件是否和信版本兼容。

作者: 小葵 时间: 2015-7-12 20:11

请教各位，为什么我结构加进去了，检索的时候，却还是没有结构呢？

作者: duchy 时间: 2015-7-12 20:13

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原帖由小葵于 2015-7-12 20:11 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
请教各位，为什么我结构加进去了，检索的时候，却还是没有结构呢？

请问设置或添加结构库了嘛？

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