分析测试百科

标题: 【求助】关于高通量测序 [打印本页]

作者: leifengta 时间: 2016-1-14 16:07 标题: 【求助】关于高通量测序

第一次送样做高通量测序，很多地方不懂，我想分析古菌和细菌的多样性，引物要自己选么，一般选择什么引物呢，是把16S全长测出来还是测某个可变区，有木有大神跟我讲一讲，万分感谢

作者: ladyhuahua 时间: 2016-1-14 16:07

引物的话，一般的测序公司都已经确定好了，可以选择的扩增区域不是很多，要看你选择哪个测序公司，不过，目前用的平台大都是Illumina 的，由于读长的限制，扩增区域也是比较有限的。另外，也有用三代测序Pacbio测序的，测的是16S的全长，楼主可以检索一些相关文献，学习一下。不是很懂的时候，可以多跟测序公司的技术支持聊聊，多咨询一下慢慢的就知道啦。

作者: zhenxin 时间: 2016-1-14 16:08

对细菌而言一般用通用引物扩增出16sRNA，再测序比对。

作者: 49888 时间: 2016-1-14 16:08

引物不需要自己设计

作者: bojitu 时间: 2016-1-14 16:10

直接找公司给你做吧全套 800一个样品

作者: taoshengyijiu 时间: 2016-1-14 16:10

通用引物就可以了。

作者: yayya 时间: 2016-1-14 16:11

引物有taget V3,V4,V5,V3+V4,V4+V5等。

欢迎光临分析测试百科 (http://bbs.antpedia.com/)