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标题: [求助]脂肪组织提RNA [打印本页]

作者: lgm    时间: 2011-10-22 17:28     标题: [求助]脂肪组织提RNA

[求助]脂肪组织提RNA


各位高手:
你们好!我无法从脂肪组织中提取总RNA(用Trizol法),不知能否介绍些宝贵经验,在下万分感激!

作者: 蝴蝶结子    时间: 2011-10-22 17:28

分子克隆第三版上讲,提取含甘油三脂较丰富的脂肪组织中的总RNA不能用一步法。可以用Chirgwin等(1979)发展,由Tavangar(1990)改进的方法。你可以查一下全文。

A micromethod for the isolation of total RNA from adipose tissue.
Anal Biochem.
作者:Tavangar K, Hoffman AR, Kraemer FB。

作者: 过路甲    时间: 2011-10-22 17:29

我在从脂肪组织中抽提RNA前也查了一些文献,看到zhongzidegushi说的那条信息,咨询Trizol产品公司,建议用柱式RNA进行抽提,但考虑到麻烦,于是进行了一下尝试,用普通的Trizol进行抽提,并进行RT-PCR,最后电泳,结果很好,条带清晰而且没有杂带,所以普通的Trizol用于脂肪组织的抽提也是可行的
作者: qiangren789    时间: 2011-10-22 17:29

我提了好多次脂肪组织的RNA,其实也并不是很难!总结一下需注意的问题如下:
1 脂肪组织由于含有很高的甘油三脂和其他脂类,所以在提取的时候,所取组织的量要增加,
2 加入TRIZOL后,充分匀浆,静止,然后4度12000转离心10分钟!
3 弃取上层的油,将下层,红色的液体吸出,再加氯仿!
4 脂肪组织更易降解,除了研磨时要注意,取样时也要注意,最好是新鲜的样!
你试试吧!祝好运!

作者: 研究僧112    时间: 2011-10-22 17:30

终于找到同志了,我好高兴,不过我也没提出来.我用的是Qiagen 的RNeasy mini kit试剂盒,都说这个试剂盒挺好的,但我提了10次了.还是没提出来,而且我不知道该怎样去除上层的油,是直接倒掉,还是用吸头吸,我试了吸头吸,但效果不好,请高手指导一下,感激不尽.
作者: lgm    时间: 2011-10-22 17:30

你好!首先得感谢你的热心帮助。昨日我用你介绍的方法 提脂肪组织(前日杀RAT所取脂肪)的RNA(先加入TRIZOL后,充分匀浆,静止,然后4度12000转离心10分钟!后弃取上层的油,将下层,红色的液体吸出,再加氯仿!)最终在加异丙醇后离心,EP管底可见明显沉淀,好高兴!同时提心肌RNA也见明显沉淀,但跑胶后两者均未见三条带,心肌提取物跑胶后为一条亮带,不知为何?所提物是RNA吗?沉淀用无酶水可完全溶解,如沉淀为DNA 或蛋白质,无酶水可完全溶解吗?今日用上法提-70度保存近2月的脂肪组织 提RNA,但未见沉淀 ...???组织取材后未放液氮仅用-70度保存,可明显影响以后RNA提取吗?请指教。非常感谢!
祝万事如意!

作者: 笨鸟321    时间: 2011-10-22 17:31

各位高手、大侠
你们好!我无法从脂肪组织中提取总RNA(用Trizol法),不知能否介绍如何从脂肪组织提RNA做RT-PCR的详细步骤及注意事项,在下万分感激!

作者: 笨鸟321    时间: 2011-10-22 17:31

各位高手、大侠
你们好!我无法从脂肪组织中提取总RNA(用Trizol法),不知能否介绍如何从脂肪组织提RNA做RT-PCR的详细步骤及注意事项,在下万分感激!

作者: +田田+    时间: 2011-10-22 17:31

若我的建议能对你有一点的帮助,我也是非常高兴的!
不过,你的实验好像还是有问题的,正常的总rna是要跑出三条带的,5s最弱,28s的亮度大约是18s的两倍,不过由于胶的问题,常常不会那么明显,在跑1%的TBE琼脂糖凝胶时,1:1就不错了,为防止跑胶时降解,可以配置MOPs胶,你可以查一下,它跑出的效果要好的多!
对了,怎么没见你提到RNA的OD值呀?正常提完都要测得,看一下比值,你的RNA是降解了,是蛋白多了就大致有数了!
我提过保存一年的脂肪组织,确实降解得很厉害,所以建议你最好用新的组织,还有我觉得脂肪组织中,脂肪滴占有很大的比例,而细胞数要比其他组织少的多,越是成熟的脂肪细胞越严重,所以,组织量要控制好!
好像也没说什么有用的,希望你能尽快得出结果!

作者: +田田+    时间: 2011-10-22 17:31

加异丙醇后不会立即可见白絮状漂浮物及较多细丝线团状物形成,但是会有很多气泡!离心后才可见沉淀!我提时就是按照Trizol说明书上的步骤,没有什么特别的改动,要注意的几点我也说过了,其他象什么防止RNA酶污染等我想也不用交代的,我觉得你还是应该测一下OD值,你提的很可能是DNA,因为提DNA时会出现这样的现象!  
作者: #黄药师#    时间: 2011-10-22 17:32

如何防止用Trozol 提的是RNA而 非DNA?谢谢!
作者: vivian4123    时间: 2011-10-22 17:32

在加氯仿之前离心12K,5分钟,因该有一个上层覆盖物弃出,再吸取上清,再加氯仿,然后按说明书来就可以的!祝你实验成功!  
作者: #甜#    时间: 2011-10-22 17:33

你提不出来是你脂肪的用量可能太少了,多加一些组织在试试看吧。
作者: 冰儿0109    时间: 2011-10-22 17:33

先回答你的问题:
1.加异丙醇后离心前需静置2小时或过夜吗?
不需要!加完后轻轻晃动,混匀,然后静止5分钟即可.
2.用70%酒精还是75%的洗涤RNA?
其实我是用的75%的乙醇洗的,但我觉的70%和75%不会对实验结果产生很大的影响,它的作用应该就是洗去残留的异丙醇,
3.提出总RNA后用无酶水还是用酒精保存?
那要分组织,脂肪的保存在无酶水中即可,我没有用酒精保存过,也没听说过!不过可以保存在甲酰氨中
4.可用普通TBE缓冲液及琼酯糖跑电泳吗?TBE缓冲液用1X,琼酯糖用1%浓度,100V跑小胶的2/3,即可,你可以查一下,用甲醛变性胶,结果更好!

作者: (cat)    时间: 2011-10-22 17:34

我用最普通的方法提,没看到沉淀,但也跑出三条带了,我用的组织放在--70C冰箱里,拿出来后马上在冰上匀浆。




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