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标题: 【求助】总RNA电泳18s比28s亮很多是什么原因? [打印本页]

作者: IAM007    时间: 2016-4-4 21:41     标题: 【求助】总RNA电泳18s比28s亮很多是什么原因?

我这两天抽提的总RNA 凝胶电泳总是18s的亮度超过28s很多,28s跟5s的亮度一样甚至还要暗。
请教高手,这是不是降解啊?
我印象中的降解是5s条带变亮,但是28s不会明显比18s暗啊。这种情形第一次碰到。请高手帮忙指点!不甚感激!


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作者: ha111    时间: 2016-4-4 21:44


个人认为是加样量多了,还有溶解时间短了,跑胶时间短了些,不知道,你的上述时间是多少?

作者: IAM007    时间: 2016-4-4 21:44


谢谢LS!
这个样本的浓度是32,A260/A280为1.732,加样量1ul,100V,跑了30分钟。因为没有加Marker,可能不大好对比。
我以前跑胶的量多得多,电压时间也是这样,可是不是这样的结果。
下面我以前的结果,都是这样的。


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http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=43327


作者: dmg    时间: 2016-4-4 21:46


楼主,你以前的电泳时变性电泳,效果很好啊!怎么跑出的?

作者: hulu呼噜    时间: 2016-4-4 21:46

个人感觉应该是降解了吧,就像下边的那张电泳图,好的电泳图28s应该比18s要亮的多。
作者: ilovegaga    时间: 2016-4-4 21:46

可以肯定的说RNA 发生了降解.我开始提RNA 时也是这个样子.
作者: IAM007    时间: 2016-4-4 21:47



QUOTE:
原帖由 dmg 于 2016-4-4 21:46 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

楼主,你以前的电泳时变性电泳,效果很好啊!怎么跑出的?

我跑的不是变性胶,就是普通的凝胶,0.8%浓度的,100V跑二、三十分钟左右,呵呵!
以前都是抽提细胞株的总RNA,量多,降解了一部分还剩很多,不怕!
现在抽提的是临床骨髓标本的总RNA,细胞少了,问题也多了!

作者: IAM007    时间: 2016-4-4 21:47



QUOTE:
原帖由 ilovegaga 于 2016-4-4 21:46 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
可以肯定的说RNA 发生了降解.我开始提RNA 时也是这个样子.

那你后来是怎么样改进的啊?请教哦!
作者: dog002    时间: 2016-4-4 21:48


我以前提取RNA的时候,Trizol试剂还没有很好的市场, 我们那个时候是用自己配制的试剂提取的, 浪费了很多很很的时间, 结果都不很理想.你要想得到好的结果,首先要弄清楚RNA 提取所要注意的事项, 另外还需要一定的经验. 总之我个人认为除了所用器具和试剂符合要求外,环境也是一个非常值得注意的地方.

作者: yhtfyl    时间: 2023-2-24 08:27

感谢楼主分享,受教了




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