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标题: 【求助】甲基化测序结果如何做成黑白点图 [打印本页]

作者: bs4665    时间: 2016-4-9 10:10     标题: 【求助】甲基化测序结果如何做成黑白点图


我的甲基化测序结果已经出来了,有甲基化存在,想进一步分析做成黑白点图,有methtool是在线的,不太会用,哪位仁兄帮忙解决一下,万分感激!

作者: xuuuu    时间: 2016-4-9 10:11


BiQ_Analyzer
google搜索一下就知道了。

作者: bs4665    时间: 2016-4-9 10:11

那个软件可以分析,但是好像是只能对CpG位点的甲基化状态进行简单的线型绘图,不能用形象化的黑白点图表示吧?望赐教!
作者: fei1226com    时间: 2016-4-9 10:14



QUOTE:
原帖由 bs4665 于 2016-4-9 10:11 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
那个软件可以分析,但是好像是只能对CpG位点的甲基化状态进行简单的线型绘图,不能用形象化的黑白点图表示吧?望赐教!

这种图不是你要的?

图片附件: 91268047.snap.jpg (2016-4-9 10:14, 75.91 KB) / 该附件被下载次数 45
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=43489


作者: 1221    时间: 2016-4-9 10:14


我也是BSP的新手,同样不知道怎么分析测序结果,哪位资深前辈,望不吝赐教!!!

作者: bs4665    时间: 2016-4-9 10:14

老师好辛苦,晚上两点了还在工作,表示敬佩和感谢!我就是想要那种图,我再好好学习一下,搞不定还要请前辈赐教!
作者: 33号    时间: 2016-4-9 10:15


甲基化分析中的测序法的结果是怎么判定的 ,那些黑点图应该怎么样去看呢?

作者: 3.14    时间: 2016-4-9 10:15

各位,请问下面图是手画的还是软件生成的啊,应该怎么画才可以发文章啊。谢过!

图片附件: 13623132.jpg (2016-4-9 10:15, 10.38 KB) / 该附件被下载次数 104
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=43492


作者: 9900    时间: 2016-4-9 10:15


请问甲基化测序结果如何分析啊,跟普通的测序结果分析是一样的吗?我的测序出来了,就是看不懂。谢谢指点!

作者: 3648755    时间: 2016-4-9 10:16



QUOTE:
原帖由 9900 于 2016-4-9 10:15 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

请问甲基化测序结果如何分析啊,跟普通的测序结果分析是一样的吗?我的测序出来了,就是看不懂。谢谢指点!

使用biq-anlysis软件分析。
作者: 2541    时间: 2016-4-9 10:16


methtool和BiQ Analyzer有声区别呀,求解?

作者: u234    时间: 2016-4-9 10:17

有**版的吗?
作者: yhtfyl    时间: 2023-2-24 07:32

感谢楼主分享,受教了




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