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标题: 【求助】安捷伦GCMS直接积分的问题 [打印本页]

作者: 森林木 时间: 2016-4-25 16:41 标题: 【求助】安捷伦GCMS直接积分的问题

各位老师，本人新手，昨天打开GCMS工作站处理样品数据时，发现用直接积分功能只积分到了几个峰，拿之前的样品再次积分时发现有的甚至都没有积到峰，这是怎么回事啊特向大家求助求助，不要嫌弃地多多指教啊~

作者: viviwang1987 时间: 2016-4-25 16:41

检查一下积分参数是否有改变，设置合理的积分参数。

作者: panda王 时间: 2016-4-25 16:46

因为之前没有关注过积分参数，不知道怎样的数值设定比较合理呢？（下午我去查看一下现在的参数回复您，还麻烦您帮忙指导指导！~

作者: panda王 时间: 2016-4-25 16:46

上图是我点开积分参数后截图的，下面是我找了个样品进行积分，只有14个峰，而且丰度还特别高，不知道怎么回事呢？

图片附件: 2016041913053968.jpg (2016-4-25 16:46, 38.61 KB) / 该附件被下载次数 59
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=43986

作者: panda王 时间: 2016-4-25 16:47

图2

图片附件: 2016041913054600.jpg (2016-4-25 16:47, 41.66 KB) / 该附件被下载次数 36
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=43987

作者: 45778 时间: 2016-4-25 16:48

请问是TIC积分还是FID积分？
你这个问题应该是积分参数不合理造成的
FID积分：
初始峰宽改为0.02
初始阈值改为11，（如果是TIC积分，可以改为14）
你初始阈值太高了，小峰给滤掉了

作者: ladyhuahua 时间: 2016-4-25 16:48

阈值太大，调整到12-14试试。峰面积限制也适当加一些，以便过滤基线的假峰。

作者: 森林木 时间: 2016-4-25 16:48

请问是TIC积分还是FID积分？
你这个问题应该是积分参数不合理造成的
FID积分：
初始峰宽改为0.02
初始阈值改为11，（如果是TIC积分，可以改为14）
你初始阈值太高了，小峰给滤掉了

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感谢回复！这个是TIC积分，上周关机（是另外一个同事操作的）过后这周开下来就这样了，这个图还能积分到一些峰呢，还有一些样品积分的峰数为0，不知道到底怎么回事

作者: 森林木 时间: 2016-4-25 16:49

阈值太大，调整到12-14试试。峰面积限制也适当加一些，以便过滤基线的假峰。

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好的，谢谢！我先去试试改阈值看看

作者: 森林木 时间: 2016-4-25 16:49

阈值太大，调整到12-14试试。峰面积限制也适当加一些，以便过滤基线的假峰。

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1、改完阈值（12）之后，发现积分下来的峰是多了很多，基本峰数是以前的两倍，好像有点太多了，不知道可不可以有什么地方查看之前分析的样品时的阈值呢？
2、数据分析里的阈值设置和仪器控制界面上的全扫描参数里的阈值是不相关的吗？
【新手，自己正在摸索，还有很多不熟还请各位解答~

作者: milkdog 时间: 2016-4-25 16:50

可以手动去积分！

作者: 森林木 时间: 2016-4-25 16:50

QUOTE:

原帖由 milkdog 于 2016-4-25 16:50 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
可以手动去积分！

几百个峰手动积分有点慌。。。我们手动一般辅助性改改直接积分的重叠峰啥的。刚刚改了下阈值还是可行的，不过和之前出的报告还是有点区别，准备再试试其他方法~

作者: ladyhuahua 时间: 2016-4-25 16:51

把初始面积改成1000-10000试试，峰数就会减少。一般是不好查看原来处理过的积分参数的，除非你保持过方法。

作者: milkdog 时间: 2016-4-25 16:51

几百个峰手动积分有点慌。。。我们手动一般辅助性改改直接积分的重叠峰啥的。刚刚改了下阈值还是可行的，不过和之前出的报告还是有点区别，准备再试试其他方法~

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哦，也是！手动积分适合少的峰的积分！

作者: ladyhuahua 时间: 2016-4-25 16:52

2、数据分析里的阈值设置和仪器控制界面上的全扫描参数里的阈值是不相关的吗？
不是一回事，一个是采样的阈值，一个是积分的阈值。首先是必须要采样的化合物，才有可能积分。

作者: queen 时间: 2016-4-25 16:55

先看看培训资料吧，都有提到的

作者: 森林木 时间: 2016-4-25 16:56

先看看培训资料吧，都有提到的

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资料也看，但还是想摸摸仪器的同时再多理解一下，光看书有点搞不清

作者: ffaa 时间: 2016-4-25 16:56

安捷伦的工作站，不建议完全靠自动积分。偏差极大。

作者: 森林木 时间: 2016-4-25 16:58

QUOTE:

原帖由 ffaa 于 2016-4-25 16:56 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
安捷伦的工作站，不建议完全靠自动积分。偏差极大。

是的，还需要手动积分处理重叠峰，处理起来也是个体力活儿

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