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标题: 【求助】做出来的高分辨图谱有一个很高的峰应该是M+H的峰 [打印本页]

作者: aaby    时间: 2016-5-2 12:25     标题: 【求助】做出来的高分辨图谱有一个很高的峰应该是M+H的峰

我做了一些高分辨质谱,拿其中一个化合物为例,分子式:C32H55N3O2,做出来的高分辨图谱有一个很高的峰(应该是M+H的峰)为514.4341,还有紧挨着一个低一点的峰515.4398,想请教的问题是计算化合物精确分子量是用的哪一套原子质量?我看一般的教材上有两种,一种是monoisotopic mass(同位素质量), 另一种是average mass(平均质量),参照有些文章的,结果发现两种原子质量都有人在用。我用同位素质量计算值为514.4372(M+H),用平均质量计算值为514.8133(M+H),不知道我计算对了没有,感觉用同位素质量计算更加接近测量值,但是我不知道正确的计算方法应该用哪一种,请知道的指点一下,该使用哪一套原子质量,或者使用的是其他更好的一套质量,请给出你认为正确的计算式(方便我查看你所使用原子的原子量),不胜感激!
作者: 青青草    时间: 2016-5-2 12:26     标题: 【回复】

用Chemdraw,画出结构式,view-->show analysis window会显示出exact mass
作者: 大大    时间: 2016-5-2 12:26     标题: 【回复】

质谱分子量都是用同位素质量计算得到的。
高分辨的最高强度峰是用组成该分子的所有原子在天然界中丰度最高的同位素的质量加和得到的,对有多个同位素的原子,同一个分子碎片就有可能出现多个质谱峰。
举个简单的例子:
如BnBr,溴原子有原子量为79和81两个同位素,而且天然丰度都是50%,其质谱图中就会出现169.97,171.97两个分子离子峰,且强度比接近1:1;因为碳元素也有两种同位素,所以还会出现 170.97 和 172.97 两个峰。
Chemdraw里,给出分子式,它会帮你算出质谱的分子离子峰。
作者: xiaoxiaojinglin    时间: 2016-5-2 12:27     标题: 【回复】

HRMS 肯定要用同位素质量。
另外chemdraw 算的分子量 好像不是很准。我的HRMS都是用那个机器附带程序计算的,然后再和测到的实际分子量比较 算出误差
作者: xiaoxiaojinglin    时间: 2016-5-2 12:27     标题: 【回复】

chemdraw 算出来的分子量只是分子离子的强度,
而HRMS一般都是M+H,或者M+Na,M+K的质量,
要根据HRMS的模式,
只要在此基础上加上相应的数即可




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