1月17日,《美国国家科学院院刊》(Proceedings of the National Academy of Sciences, PNAS)在线发表了中国科学院生物物理研究所苗龙课题组和北京生命科学研究所董梦秋课题组合作的最新研究成果:Nematode sperm maturation triggered by protease involves sperm-secreted serine protease inhibitor (Serpin)。该研究在Ascaris suum线虫中鉴定了两个精子激活调控相关的蛋白因子:丝氨酸蛋白酶抑制因子As_SRP-1和类胰蛋白酶As_TRY-5;阐述了它们之间相互协同作用调控精子成熟的机理,为精子竞争研究提供了全新的分子机制。
这篇文章的另一个亮点是不依赖于蛋白数据库的肽段从头测序(de novo sequencing)。以前的从头测序效果欠佳,鲜有实际应用。为了此项研究的需要,北京生命科学研究所董梦秋研究组与中国科学院计算所贺思敏研究组共同开发了肽段从头测序的质谱实验流程和算法,达到了与数据库搜索相当的鉴定效果。本文中的两个蛋白As_SRP-1和As_TRY-5都是用肽段从头测序技术pNovo鉴定到的,表明pNovo足以支持生物学研究,尤其是对于新蛋白(序列未被收纳到现有数据库中)的鉴定有极大的帮助。最新公布的猪蛔虫基因组草图[Nature 479, 529–533 (24 November 2011)]将极大地推进后续研究的进行。